Amos Bairoch (nacido el 22 de noviembre de 1957) [1] es un bioinformático suizo [2] [6] [7] y profesor de bioinformática en el Departamento de Ciencias de las Proteínas Humanas de la Universidad de Ginebra, donde dirige el grupo CALIPHO [8] en el Instituto Suizo de Bioinformática (SIB) que combina bioinformática, curación y esfuerzos experimentales para caracterizar funcionalmente las proteínas humanas. [9]
Amos Bairoch | |
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Nació | [1] | 22 de noviembre de 1957
alma mater | Universidad de Ginebra [2] |
Conocido por | |
Premios |
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Carrera científica | |
Campos | |
Instituciones | Instituto Suizo de Bioinformática |
Sitio web | web |
Su padre fue el historiador económico Paul Bairoch .
Educación
Su primer proyecto como Ph.D. estudiante fue el desarrollo de PC / Gene, [10] un paquete de software basado en MS-DOS para el análisis de secuencias de proteínas y nucleótidos. PC / Gene fue comercializado, primero por una empresa suiza (Genofit) y luego por Intelligenetics en los EE. UU., Que luego fue comprada por Oxford Molecular. [ cita requerida ]
Investigar
Su principal trabajo [5] está en el campo del análisis de secuencias de proteínas y más particularmente en el desarrollo de bases de datos y herramientas de software para este propósito. Su contribución más importante es la aportación del conocimiento humano mediante una cuidadosa anotación manual en los datos relacionados con las proteínas. [11]
Mientras trabajaba en PC / Gene, comenzó a desarrollar una base de datos de secuencias de proteínas anotadas que se convirtió en Swiss-Prot y se publicó por primera vez en julio de 1986. [12] Desde 1988 en adelante, ha sido un proyecto de colaboración con el grupo Data Library de European Molecular Biology Laboratorio que luego evolucionó hasta convertirse en el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI).
La base de datos Swiss-Prot es el principal recurso de secuencias de proteínas del mundo y ha sido un instrumento de investigación clave tanto para los bioinformáticos como para los científicos de laboratorio en una amplia gama de aplicaciones. [13] Una medida de su éxito es el reciente desarrollo de UniProt, el catálogo de información sobre proteínas más completo del mundo. [14] UniProt es un recurso de información central de secuencias de proteínas y funciones creadas uniendo la información contenida en Swiss-Prot , TrEMBL y las bases de datos de American Protein Information Resource (PIR) .
En 1988, comenzó a desarrollar PROSITE , [15] una base de datos de dominios y familias de proteínas. Poco tiempo después creó ENZYME, [16] [17] [18] [19] [20] una base de datos de nomenclatura de enzimas así como SeqAnalRef, [21] una base de datos de referencia bibliográfica de análisis de secuencias. [22] [23]
En colaboración con Ron Appel , inició, en agosto de 1993, el primer servidor WWW de biología molecular, ExPASy . [24] Lo que pretendía ser un prototipo se convirtió rápidamente en un sitio importante que brinda acceso a las numerosas bases de datos producidas parcial o completamente en Ginebra, así como a muchas herramientas para el análisis de proteínas (proteómica).
En 1998, con colegas en Ginebra y Lausana, fue uno de los fundadores del Instituto Suizo de Bioinformática SIB, cuya misión es establecer en Suiza un centro de excelencia en el campo de la bioinformática con énfasis en investigación, educación, servicios y el desarrollo de bases de datos y herramientas. [25]
En noviembre de 1997, junto con Ron Appel y Denis Hochstrasser, fundó GeneBio (Geneva Bioinformatics SA), una empresa dedicada al conocimiento biológico. En abril de 2000, las personas mencionadas con Keith Rose y Robin Offord fundaron GeneProt (Geneva Proteomics), una empresa de proteómica de alto rendimiento que cesó sus operaciones en 2005. [26]
Desde 2009, en el marco del grupo CALIPHO, dirigido por él mismo y Lydie Lane, está involucrado en el desarrollo de neXtProt [27] [28] [29], un recurso que tiene como objetivo proporcionar a los científicos de la vida un amplio espectro de conocimientos sobre todas las proteínas humanas.
También está involucrado en el desarrollo del Cellosaurus, un recurso de conocimiento sobre líneas celulares.
Según Google Scholar [5] y Scopus , [6] A partir de 2015[actualizar]Sus artículos revisados por pares más citados en revistas científicas se han publicado en Nucleic Acids Research , [30] [31] [32] [33] [34] the Biochemical Journal , [35] [36] Nature , [37] Briefings in Bioinformática , [38] y Base de datos . [39]
Premios y honores
Bairoch recibió el Premio Friedrich Miescher de 1993 de la Sociedad Suiza de Bioquímica, el Premio de Incentivo de la Fundación Helmut Horten de 1995, el Premio Pehr Edman de 2004, el Premio Europeo Latsis de 2004 , el Premio Otto Naegeli de 2010 , el Premio de Logros Distinguidos HUPO 2011 en Proteomic Sciences., [40] el premio pionero de la proteómica EUPA 2013, [1] y en 2018 el premio ABRF .
Citas
A medida que el proceso sigue bajando, llegamos al punto en el que se secuenciará cada genoma que pueda secuenciarse. [41]
Referencias
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