Motivo de ARN anti-hemB


El motivo de ARN anti-hemB es una estructura de ARN conservada que se encontró en todas las bacterias conocidas del género Burkholderia y en una variedad de otras betaproteobacterias . [1] El motivo de ARN anti-hemB consta principalmente de dos bucles de tallo , seguidos de un bucle de tallo de terminación de la transcripción independiente de rho previsto . Dado que los ARN anti-hemB generalmente no se ubican en una UTR 5' , se supone que los ARN son ARN no codificantes . El bucle de tallo terminador implica que los ARN anti-hemB se transcriben como moléculas independientes.

El nombre "anti-hemB" es para distinguir el motivo de su complemento inverso, que se denominó motivo "hemB", un motivo que a menudo se encuentra en las UTR 5' aparentes de los genes hemB . Se consideró ambiguo cuál de estas orientaciones es la correcta, ya que ambas direcciones exhiben covariación (ver predicción de estructura secundaria ) y ambas se pliegan en estructuras de ARN plausibles. Sin embargo, se consideró que el anti-hemB era la orientación más probable, porque tenía menos pares de bases AC , que no contribuyen a la estabilidad del ARN. En complemento inverso, un par AC se convierte en el par oscilante GU estable.