La Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares (ABRF, por sus siglas en inglés ) se dedica a promover los laboratorios de biotecnología centrales y de investigación a través de la investigación, la comunicación y la educación. [1] Los miembros de ABRF incluyen a más de 1200 científicos que representan a 340 laboratorios centrales diferentes en 41 países, incluidos los de la industria, el gobierno, las instituciones académicas y de investigación.
Formación | 1989 |
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Sede | Lexington, KY |
Localización | |
Afiliación | 1200 (enero de 2021) |
Idioma oficial | inglés |
presidente | Kevin Knudtson |
Sitio web | http://www.abrf.org/ |
Historia
En 1986 se celebró una Reunión Satélite del Fondo de Recursos de Investigación junto con la Sexta Conferencia Internacional sobre Métodos de Análisis de Secuencias de Proteínas. [ cita requerida ] El próximo año se enviaron muestras de secuenciación de proteínas y de aminoácidos para inspeccionar 103 instalaciones centrales. En 1989, la ABRF se organizó e incorporó formalmente. Cada año se celebró una reunión anual como reunión satélite de la Sociedad de Proteínas hasta 1996, cuando comenzaron las reuniones por separado. [2]
Grupos de investigación ABRF
Los Grupos de Investigación se establecen para cumplir con dos de los propósitos de la Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. En primer lugar, proporcionar mecanismos para la autoevaluación y la mejora de la exactitud, precisión y eficiencia operativas y de procedimiento en las instalaciones de recursos y los laboratorios de investigación. En segundo lugar, contribuir a la educación del personal de las instalaciones de recursos y del laboratorio de investigación, los usuarios, los administradores y los miembros interesados de la comunidad científica. [3] Los resultados de los estudios del ABRF Research Group se han publicado en artículos científicos. [4] [5] [6] Los resultados de los estudios del ABRF Research Group han sido reutilizados en otras investigaciones. [7] [8] [9]
- Grupo de secuenciación de próxima generación ABRF (ABRF-NGS)
- Grupo de Investigación en Tecnología de Anticuerpos (ARG)
- Grupo de Investigación Biomédica 'Ómica (BORG)
- Grupo de investigación de secuenciación de ADN (DSRG)
- Grupo de Investigación de Citometría de Flujo (FCRG)
- Grupo de Investigación en Genómica (GVRG)
- Grupo de Investigación de Glicoproteínas (gPRG)
- Grupo de Investigación de Microscopía de Luz (LMRG)
- Grupo de Investigación en Metabolómica (MRG)
- Grupo de Investigación en Metagenómica (MGRG)
- Grupo de Investigación de Interacciones Moleculares (MIRG)
- Grupo de Investigación de Ácidos Nucleicos (NARG)
- Grupo de Investigación en Expresión de Proteínas (PERG)
- Grupo de investigación de secuenciación de proteínas (PSRG)
- Grupo de Investigación en Proteómica (PRG)
- Grupo de Investigación en Informática del Proteoma (iPRG)
- Grupo de Investigación de Estándares de Proteómica (sPRG)
Tecnologías de recursos
Los miembros de ABRF están involucrados en un amplio espectro de tecnologías biomoleculares que se implementan en entornos de instalaciones centrales:
- Automatización: cribado de alto rendimiento, LIMS , robótica .
- Química de proteínas / péptidos : análisis de aminoácidos, secuenciación N- y C-terminal, síntesis de péptidos, matrices de péptidos / proteínas.
- Biofísica : calorimetría , CD, fluorescencia , dispersión de luz , SPR , ultracentrifugación .
- Citometría de flujo Activación de fluorescencia Clasificación de células
- Expresión , identificación y perfil de proteínas : fluorescencia diferencial, electroforesis en gel 2-D convencional , descubrimiento de biomarcadores de enfermedades.
- Expresión y creación de perfiles de genes: matrices de genes, PCR en tiempo real .
- Espectrometría de masas : análisis cualitativo, cuantitativo y estructural de proteínas, carbohidratos , oligonucleótidos y lípidos .
- Microscopía Microscopía óptica e imagenología, Microscopía confocal
- Nucleic Acid Química : secuenciación de ADN , la síntesis de ADN , la síntesis de ARN , la genotipificación .
- Separaciones: 1 y 2-D PAGE, electroforesis capilar , cromatografía .
- Control de calidad : GLP, GMP, calidad y cumplimiento.
- Universal Proteomics Standard (UPS), una mezcla de proteínas utilizadas como estándar de referencia en proteómica, introducido por el sPRG mencionado anteriormente. [10] Esto incluye dos conjuntos: el original (UPS1, donde las 48 proteínas están en 48 pmol) y un rango dinámico de concentraciones (llamado UPS2), que van desde 500 amol a 50 pmol. [11]
- Otros: bioinformática , análisis de carbohidratos , visualización diferencial, producción de proteínas recombinantes .
Conferencia anual
Cada año, la conferencia anual de la Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares se lleva a cabo durante la primavera en una ciudad diferente de América del Norte. Esta conferencia internacional se utiliza para exponer a los miembros a la biotecnología nueva y emergente a través de conferencias, mesas redondas, presentaciones de grupos de investigación, sesiones de carteles, talleres y exhibiciones técnicas.
- ABRF 2022, 27-30 de marzo de 2022, Palm Springs, CA
- ABRF 2021, 7-11 de marzo de 2021, reunión virtual debido a COVID-19
- ABRF 2020, 29 de febrero - 3 de marzo de 2020, Palm Springs, CA
- ABRF 2019, 23 a 26 de marzo, San Antonio , Texas; 30 años desafiando los límites de la ciencia y la tecnología, abriendo puertas para el futuro
- ABRF 2018, 22 a 25 de abril, Myrtle Beach, Carolina del Sur ; La conferencia principal de servicios básicos
- ABRF 2017, 25-28 de marzo, San Diego , California; Un foro para el avance de las tecnologías centrales de hoy para habilitar las innovaciones del mañana
- ABRF 2016, 20 a 23 de febrero, Ft. Lauderdale , Florida; Tecnologías innovadoras que aceleran el descubrimiento
- ABRF 2015, 28 a 31 de marzo, St. Louis , Missouri; Tecnologías integradoras para el avance de los núcleos científicos
- ABRF 2014, 23 a 25 de marzo, Albuquerque , Nuevo México; Team Science y Big Data: núcleos en la frontera
- ABRF 2013, 2 a 5 de marzo, Palm Springs, California; Herramientas para el avance de la ciencia de la convergencia
- ABRF 2012, 17 a 20 de marzo, Orlando, Florida; Aprendiendo de las biomoléculas
- ABRF 2011, 19 a 22 de febrero, San Antonio, Texas; Tecnologías para habilitar la medicina personalizada
- ABRF 2010, 20 a 23 de marzo, Sacramento, California; Traducir la investigación básica con avances en tecnología biomolecular
- ABRF 2009, 7 a 10 de febrero, Memphis, Tennessee; Aplicación y optimización de biotecnologías existentes y emergentes
- ABRF 2008, 9 a 12 de febrero, Salt Lake City, Utah; Tecnologías facilitadoras en las ciencias biológicas
- ABRF 2007, 31 de marzo a 3 de abril, Tampa, Florida; Creación de la hoja de ruta biológica
- ABRF 2006, 11 a 14 de febrero, Long Beach, California; Integrando ciencia, herramientas y tecnologías con la biología de sistemas
- ABRF 2005, 5 a 8 de febrero, Savannah, Georgia; Tecnologías biomoleculares: descubrimiento a hipótesis
- ABRF 2004, 28 de febrero a 2 de marzo, Portland, Oregon; Integración de tecnologías en proteómica y genómica
- ABRF 2003, 10 a 13 de febrero, Denver, Colorado; Traducción de biología mediante proteómica y genómica funcional
- ABRF 2002, 9 a 12 de marzo, Austin, Texas; Tecnologías biomoleculares: herramientas para el descubrimiento en proteómica y genómica
- ABRF 2001, 24 a 27 de febrero, San Diego, CA; La nueva biología: tecnología para resolver comunicaciones macromoleculares
- ABRF 2000, 19 a 22 de febrero, Bellevue, Washington; De los análisis singulares a los globales de sistemas biológicos
- ABRF 1999, 19 a 22 de marzo, Durham, Carolina del Norte; Bioinformática y tecnologías biomoleculares: vinculación de genomas, proteomas y bioquímica
- ABRF 1998, 21 a 24 de marzo, San Diego, California; De los genomas a la función: desafíos técnicos de la era posterior al genoma
- ABRF 1997, 9 a 12 de febrero, Baltimore, Maryland; Técnicas en la interfaz genoma-proteoma
- ABRF 1996, 30 de marzo a 2 de abril, San Francisco, California; Técnicas biomoleculares
Premio ABRF
El premio ABRF se presenta en la reunión anual de ABRF por sus contribuciones destacadas a las tecnologías biomoleculares. Ganadores de premios anteriores: [12]
- 2021 -
- 2020 a George Church por su investigación pionera en secuenciación genómica y su liderazgo en los campos de la terapia génica y las tecnologías de biología sintética.
- 2019 Richard M. Caprioli por el descubrimiento del procesamiento temporal y espacial en sistemas biológicos mediante espectrometría de masas.
- 2018 Amos Bairoch para el desarrollo de recursos comunitarios como la base de conocimientos UniProtKB / Swiss-Prot , PROSITE , ENZYME y neXtProt .
- 2017 Sir Shankar Balasubramanian y David Klenerman por la invención de un método de secuenciación de ADN de próxima generación que se conoce comúnmente hoy como "secuenciación por síntesis".
- 2016 Emmanuelle Charpentier y Jennifer Doudna por el desarrollo de tecnologías de edición del genoma CRISPR / Cas9.
- 2015 John G. White y William Bradshaw Amos por el desarrollo del microscopio confocal de barrido láser de alta resolución
- 2014 Patrick H. O'Farrell , por el desarrollo de electroforesis en gel bidimensional.
- 2013 Leonard Herzenberg y Leonore Herzenberg por el desarrollo de la clasificación celular activada por flujo (FACS).
- 2012 Alan G. Marshall por el desarrollo de la espectrometría de masas por resonancia de ciclotrón de iones por transformada de Fourier (FT-ICR).
- 2011 Sir Alec John Jeffreys : desarrolló técnicas para la toma de huellas dactilares de ADN y la elaboración de perfiles de ADN
- 2010 Pat Brown : Trabajo pionero en el desarrollo de microarrays y las diversas aplicaciones de esta tecnología en la investigación genética.
- 2009 Mathias Uhlén
- 2008 Ruedi Aebersold
- 2007 Donald F. Hunt
- 2006 Roger Tsien
- 2005 Stephen Fodor
- 2004 Edwin Southern
- 2003 Franz Hillenkamp y Michael Karas
- 2002 John Fenn
- 2001 Csaba Horvath
- 2000 Leroy capucha
- 1999 Marvin H. Caruthers por sus contribuciones pioneras a la síntesis química de ADN y ARN
- 1998 Bruce Merrifield
- 1997 Lloyd M. Smith
- 1996 David Lipman
- 1995 Klaus Biemann
- 1994 Frederick Sanger
Revista de técnicas biomoleculares
El ABRF es el editor del Journal of Biomolecular Techniques. La revista es revisada por pares y se publica trimestralmente. [13] El enfoque principal de la revista es publicar reseñas científicas y artículos relacionados con las instalaciones de recursos biomoleculares. Los informes publicados por el Grupo de Investigación incluyen encuestas anuales. También se incluyen noticias y eventos, así como una observación de artículos centrada en las técnicas utilizadas en los entornos típicos de las instalaciones centrales. El editor en jefe actual es Ron Orlando, Universidad de Georgia .
Junta Ejecutiva de ABRF
- Kevin Knudtson, presidente de ABRF, División de Genómica, Universidad de Iowa
- Christian Lytle, tesorero, Dartmouth College
- Marie Adams, Instituto Van Andel
- Roxann Ashworth, Universidad Johns Hopkins
- Sridar Chittur, SUNY Albany
- Justine Kigenyi, Centro Médico KU
- Claudius Mundoma, Universidad Estatal de Florida
- Magnus Palmblad, Centro Médico de la Universidad de Leiden
- Ken Schoppmann, director ejecutivo de ABRF
Referencias
- ^ "Declaración de misión" . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original el 1 de abril de 2019 . Consultado el 4 de marzo de 2020 .
- ^ Crabb, JW: "ABRF; Una breve historia" ABRF News, junio de 1995
- ^ "Directrices del grupo de investigación" (PDF) . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original (PDF) el 31 de enero de 2012 . Consultado el 15 de abril de 2009 .
- ^ Choi, Meena; Eren-Dogu, Zeynep F .; Colangelo, Christopher; Cottrell, John; Hoopmann, Michael R .; Kapp, Eugene A .; Kim, Sangtae; Lam, Henry; Neubert, Thomas A .; Palmblad, Magnus; Phinney, Brett S .; Weintraub, Susan T .; MacLean, Brendan; Vitek, Olga (2017). "Estudio de 2015 del grupo de investigación de informática de proteomas ABRF (iPRG): detección de proteínas diferenciales abundantes en experimentos de LC-MS / MS cuantitativos sin etiqueta". Revista de investigación del proteoma . 16 (2): 945–957. doi : 10.1021 / acs.jproteome.6b00881 . PMID 27990823 .
- ^ Chalkley, Robert J .; Bandeira, Nuno; Chambers, Matthew C .; Clauser, Karl R .; Cottrell, John S .; Deutsch, Eric W .; Kapp, Eugene A .; Lam, Henry HN; McDonald, W. Hayes; Neubert, Thomas A .; Sun, Rui-Xiang (2014). "Grupo de investigación en informática de proteomas (iPRG) _2012: un estudio sobre la detección de péptidos modificados en una mezcla compleja" . Proteómica molecular y celular . 13 (1): 360–371. doi : 10.1074 / mcp.M113.032813 . PMC 3879627 . PMID 24187338 . Consultado el 5 de noviembre de 2018 .
- ^ Bennett, Keiryn L .; Wang, Xia; Bystrom, Cory E .; Chambers, Matthew C .; Andacht, Tracy M .; Dangott, Larry J .; Elortza, Félix; Leszyk, John; Molina, Henrik; Moritz, Robert L .; Phinney, Brett S .; Thompson, J. Will; Bunger, Maureen K .; Tabb, David L. (2015). "El estudio del grupo de investigación proteómica ABRF 2012/2013: evaluación de la variabilidad intralaboratorio longitudinal en análisis de espectrometría de masas en tándem de cromatografía líquida de péptidos de rutina" . Proteómica molecular y celular . 14 (12): 3299–3309. doi : 10.1074 / mcp.O115.051888 . PMC 4762617 . PMID 26435129 . Consultado el 5 de noviembre de 2018 .
- ^ Nguyen, Trung Hai; Rustenburg, Ariën S .; Krimmer, Stefan G .; Zhang, Hexi; Clark, John D .; Novick, Paul A .; Branson, Kim; Pande, Vijay S .; Chodera, John D .; Minh, David DL (2018). "Análisis bayesiano de calorimetría de titulación isotérmica para la termodinámica de unión" . PLOS One . 13 (9): e0203224. doi : 10.1371 / journal.pone.0203224 . PMC 6136728 . PMID 30212471 .
- ^ El, Mateo; Edfors, Fredrik; Pérez-Riverol, Yasset; Payne, Samuel H .; Hoopmann, Michael R .; Palmblad, Magnus; Forsström, Björn; Käll, Lukas (2018). "Un estándar de proteínas que emula la homología para la caracterización de algoritmos de inferencia de proteínas" . Revista de investigación del proteoma . 17 (5): 1879–1886. doi : 10.1021 / acs.jproteome.7b00899 . PMC 6474350 . PMID 29631402 .
- ^ Wu, Guanying; Wan, Xiang; Xu, Baohua (2018). "Una nueva estimación de la tasa de falso descubrimiento a nivel de proteína" . BMC Genomics . 19 (Suppl 6): 567. doi : 10.1186 / s12864-018-4923-3 . PMC 6101079 . PMID 30367581 .
- ^ "Estándares de proteómica universal - validando el futuro de la proteómica" . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ^ "Estándares proteómicos UPS1 y UP2" . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ^ "Premio ABRF" . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original el 30 de enero de 2012 . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ^ "JBT: Revista de técnicas biomoleculares" . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original el 3 de agosto de 2019 . Consultado el 4 de marzo de 2020 .
enlaces externos
- Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares ABRF
- Federación de Sociedades Americanas de Biología Experimental FASEB
- Foro de discusión ABRF
- Revista de técnicas biomoleculares
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