El Atlas of UTR Regulatory Activity ( AURA ), [1] ahora en su segunda versión, [2] es un catálogo completo y curado manualmente de secuencias humanas 5 'y 3' no traducidas (UTR) y anotaciones reguladoras UTR.
Contenido | |
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Descripción | Atlas de actividad reguladora de UTR |
Contacto | |
Centro de Investigación | CIBIO - Universidad de Trento |
Laboratorio | Laboratorio de Genómica Traslacional |
Autores | Erik Dassi, Andrea Malossini, Angela Re, Tommaso Mazza, Toma Tebaldi, Luigi Caputi y Alessandro Quattrone |
Fecha de lanzamiento | 2014 |
Acceso | |
Sitio web | aura |
Incluye anotaciones básicas, conservación filogenética, sitios de unión para proteínas de unión a ARN y miARN, elementos cis, datos de metilación y edición de ARN, y más, para humanos y ratones. A través de su interfaz web intuitiva, además proporciona acceso completo a una gran cantidad de información que integra datos de secuencia y estructura de ARN, sitios de variación, sintenia de genes, expresión de genes y proteínas y descripciones funcionales de genes de la literatura científica y bases de datos especializadas. Finalmente, proporciona varias herramientas para el análisis por lotes de listas de genes, lo que permite el seguimiento de redes reguladoras postranscripcionales.
Ver también
Referencias
- ^ Dassi, E; Malossini A; Re A; Mazza T; Tebaldi T; Caputi L; Quattrone A (enero de 2012). "AURA: Atlas de Actividad Reguladora UTR" . Bioinformática . Inglaterra. 28 (1): 142-143. doi : 10.1093 / bioinformatics / btr608 . PMID 22057158 .
- ^ Dassi, E; Re A; Leo S; Tebaldi T; Pasini L; Peroni D; Quattrone A (enero de 2014). "AURA 2: potenciando el descubrimiento de redes postranscripcionales" . Traducción . Inglaterra: Taylor & Francis. 2 (1): e27738. doi : 10.4161 / trla.27738 . PMC 4705823 . PMID 26779400 .