El Método Berlín de filtración biológica es un método para mantener un ambiente limpio y estable dentro de un acuario de agua salada , típicamente un sistema de arrecifes de coral . Este método se basa en el uso de una gran cantidad de roca viva (roca con organismos marinos vivos y bacterias sobre o dentro de ella). La teoría es que las bacterias aeróbicas que cubren la superficie de la roca viva porosa y la arena convierten el amoníaco dañino (de los desechos de peces e invertebrados) en nitritos y luego en nitratos , que son mucho menos dañinos para los habitantes del tanque. A través del proceso de difusión , los nitratosse mueven profundamente dentro de la roca donde son convertidos por bacterias anaeróbicas en gas nitrógeno libre . Los nitratos sobrantes se eliminan mediante cambios parciales regulares de agua o con filtración de algas, como un depurador de algas . Como medida adicional, se utiliza un skimmer de proteínas para eliminar algunos de los compuestos orgánicos disueltos antes de que se descompongan en amoníaco , aunque los skimmers no eliminan el amoníaco de la urea de pescado.
La regla general típica es usar de 1 a 2 lb (0,45 a 0,9 kg) de roca viva por galón (EE. UU.) (3,7 litros) de agua de acuario, dependiendo de la densidad de la roca, o llenar el tanque hasta 2/3 del camino a la cima. El beneficio de usar roca viva es cuádruple: primero, la roca viva actúa como un filtro biológico, agregando bacterias beneficiosas. En segundo lugar, introduce una gran cantidad de vida marina en el acuario que muchos peces , invertebrados y corales utilizan como alimento. En tercer lugar, proporciona una apariencia de arrecife natural con amplios lugares para ubicar los corales. Por último, la roca viva también ayudará a equilibrar y estabilizar el pH en el acuario.
El calcio, la alcalinidad y otros oligoelementos que son consumidos por los corales se reemplazan mediante cambios de agua (utilizando agua de mar natural o una mezcla de sal sintética de calidad) o el uso de un reactor de calcio , kalkwasser (agua de calcio - hidróxido de calcio mezclado con agua pura) o un solución equilibrada de dos partes.