Bridget Olivia Carragher (nacida el 17 de junio de 1957 en Sudáfrica) es una física estadounidense especializada en microscopía electrónica . Es profesora adjunta en la Universidad de Columbia (Nueva York, NY) y, junto con Clint Potter, también es directora del National Resource for Automated Molecular Microscopy (NRAMM), directora del Simons Electron Microscopy Center en New York Structural Biology Center. (Ciudad de Nueva York, NY) y PI en el Centro Nacional de Acceso y Capacitación CryoEM. También es fundadora y directora de operaciones de la empresa NanoImaging Services, Inc.
Vida personal
Carragher nació y creció en Sudáfrica . Excepto por un breve período, donde vivió en Ghana durante su infancia y durante un período de un año en Inglaterra, se mudó a los Estados Unidos después de su maestría y ha vivido allí desde entonces. Carragher es ciudadano estadounidense, está casado y tiene dos hijos.
Educación
Carragher recibió su primera educación en la Universidad de Witwatersrand , Sudáfrica, en el campo de la Física (B.Sc .: 1975-1977; B.Sc. Hons: 1978-1978; M.Sc .: 1979-1981). En 1982 se graduó de la Universidad Northwestern , Evanston, Illinois (Maestría en Física). En el mismo año, comenzó su doctorado en la Universidad de Chicago , Chicago, Illinois defendiendo en 1987.
Carrera profesional
Durante la mayor parte de su carrera, Carragher ha estado involucrada en el desarrollo de métodos optimizados y automatizados para microscopía electrónica (EM) , destinados a mejorar tanto la calidad de los datos EM como la accesibilidad de estas técnicas a la comunidad biológica en general.
Después de su doctorado, Carragher trabajó en una variedad de posiciones, tanto en la industria como en la academia hasta que se mudó al Instituto de Investigación Scripps en 2001. Desde 2002 se ha desempeñado, junto con Clint Potter, como Directora del Recurso Nacional para Microscopía Molecular Automatizada ( NRAMM), un recurso nacional de investigación en biotecnología financiado por los NIH. El NRAMM se especializa en el desarrollo y la aplicación de tecnologías automatizadas para EM y en brindar capacitación en todos los niveles.
En 2007, Carragher cofundó una nueva empresa, NanoImaging Services, Inc., donde se desempeña como directora de operaciones. El objetivo de la empresa es proporcionar crioEM y otros servicios de microscopía a la industria biofarmacéutica y biotecnológica.
En 2015, Carragher y Clint trasladaron su laboratorio académico del Instituto de Investigación Scripps al Centro de Biología Estructural de Nueva York, donde se desempeñan como codirectores del Centro de Microscopía Electrónica Simons. En mayo de 2018 se les otorgó una subvención U24 para iniciar el Centro Nacional de Acceso y Capacitación CryoEM (NCCAT).
Año | Posición |
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1987 - 1988 | Asociado de investigación, U. Chicago |
1988-1990 | Científico sénior, CEMAX Incorporated, Santa Clara, California |
1990 - 1991 | Neurocientífico asistente de investigación, Departamento de Neurociencia, UCSD |
1992-1998 | Director, Centro de visualización óptica, Instituto Beckman, UIUC |
1994-2001 | Profesor adjunto adjunto, Departamento de Biología Celular y Estructural, UIUC |
1996 - 1999 | Investigador científico senior, Centro Nacional de Aplicaciones de Supercomputación, UIUC |
1998-2001 | Director, Grupo de Tecnología de Imágenes, Instituto Beckman, UIUC |
2001 - 2012 | Profesor asociado, Departamento de Biología Celular, Instituto de Investigación Scripps. La Jolla, CA |
2003-presente | Director, Recurso Nacional para Microcopia Molecular Automatizada (NRAMM) |
2007-presente | Fundador y director científico de NanoImaging Services, Inc. |
2012-2014 | Profesor, Departamento de Biología Integrativa Estructural y Computacional, The Scripps Research Institute. La Jolla, CA |
2015-presente | Director, Centro de Microscopía Electrónica Simons, Centro de Biología Estructural de Nueva York, NY, NY |
2015-presente | Profesor adjunto, Universidad de Columbia, Nueva York, NY |
2018-presente | Co-PI, Centro Nacional de Acceso y Capacitación CryoEM |
Año | Actividad |
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1993-presente | Consejo editorial, Journal of Structural Biology |
1993-presente | Miembro de varias secciones de estudio de NIH / NSF |
1993 - 2000 | Comité Asesor Científico, Centro Nacional de Imágenes Macromoleculares, Facultad de Medicina de Baylor |
1993, 1995 | Co-organizador, Workshop on Advanced Computing for Biological Imaging, UIUC / NCSA |
1995 | Coorganizador, Taller práctico sobre técnicas estereológicas prácticas, UIUC |
1995-presente | Miembro del Comité Asesor, HVEM Resource, Boulder, Co. |
1996 | Coeditor del número especial de Journal of Structural Biology sobre "Recursos de software para el procesamiento y visualización de imágenes en biología estructural" |
1998-presente | Miembro del Comité Asesor, BMIRR, Wadsworth Center, Albany, NY |
1997, 1999 | Vicepresidente, Presidente de la Conferencia Gordon sobre 3DEM de Macromoléculas |
2003 | Coorganizador, Taller multidisciplinario sobre selección automatizada de partículas |
2003 - 2014 | Coorganizador, Taller Bienal de Microscopía Molecular |
2003 | Coeditor, Journal of Structural Biology, números especiales sobre selección automatizada de partículas y métodos analíticos |
2003-2005 | Sección de estudios de la BBCB de los NIH |
2005-2007 | Sección de estudios de NIH MI |
2005-presente | Editor asociado, Journal of Structural Biology |
2011-2015 | Comité Asesor Científico, Iniciativa EM Transcontinental para la Estructura de Proteínas de Membrana |
2012-2014 | Junta Asesora, Instalación Nacional Canadiense CryoEM |
2013-2015 | Comité Asesor Externo, Grupo de Biofísica Teórica y Computacional |
2014-presente | Presidente del Comité de EMDB para el desafío de mapas cryoEM |
2015-presente | Miembro, Grupo de Trabajo del Método Integrativo / Híbrido (IHM) de wwPDB: Subgrupo de Federación |
2015-presente | Miembro, Comité Asesor Científico de Diamantes |
2015-presente | Miembro, Comité Asesor del Banco de Datos de Proteínas de RCSB |
2015-presente | Miembro de la Junta Asesora Externa del Centro Nacional de Tomografía de Rayos X |
2016-presente | Comité Editorial, Biología Química Celular |
2017-presente | Miembro, Comité Asesor de NCXT |
2017-presente | Miembro, Consejo Asesor Científico Internacional, Instituto Max Planck, Frankfurt |
2017-presente | Junta Asesora Externa, instalación cryoEM multiusuario de UTSW |
2017 | Miembro honorario de la Royal Microscopy Society |
2017-presente | Comité Editorial, Revista Biofísica |
2018-presente | Junta Asesora Externa, instalación cryoEM multiusuario de Harvard |
Contribución a la ciencia
A lo largo de su carrera, Carragher ha publicado 165 artículos, ha recibido varias subvenciones para la financiación de la investigación y es propietaria de cinco patentes .
Patentes
- Smith PE, Callahan MP, Daniel I, Potter CS, Carragher B, Suloway CJ, inventores; Sistema robótico para secuenciar múltiples muestras entre una bandeja de sujeción y un microscopio. 2005, US 2005/0107917 A1.
- Mulder A, Carragher B, Potter CS, inventores; Caracterización de partículas mediante microscopía electrónica y métodos de procesamiento de imágenes. 2011, provisional. Presentada el 17 de agosto de 2011.
- Carragher B, Potter CS, Jain T, inventores; Preparación de matrices de muestras en una rejilla EM. 2012, provisional. Archivado el 17/01/2012.
- Carragher B, Potter CS, Jain T, inventores; Rejillas de muestras superhidrófilas para microscopía electrónica. 2012, provisional. Archivado el 17/01/2012.
- Carragher B, Potter CS, Jain T, Kahn P, Wiktor P, inventores; Aparato y método para producir muestras para microscopía electrónica. 2012, provisional. Archivado el 17/01/2012.
Contribuciones al campo EM
- Suloway, C; Pulokas, J; Fellmann, D; Cheng, A; Guerra, F; Quispe, J; Stagg, S; Potter, CS; Carragher, B (2005). "Microscopía molecular automatizada: el nuevo sistema Leginon". J Struct Biol . 151 (1): 41–60. doi : 10.1016 / j.jsb.2005.03.010 . PMID 15890530 .
- Lander, GC; Stagg, SM; Voss, NR; Cheng, A; Fellmann, D; Pulokas, J; Yoshioka, C; Irving, C; Mulder, A; Lau, PW; Lyumkis, D; Potter, CS; Carragher, B (2009). "Appion: una canalización integrada impulsada por una base de datos para facilitar el procesamiento de imágenes EM" . J Struct Biol . 166 (1): 95–102. doi : 10.1016 / j.jsb.2009.01.002 . PMC 2775544 . PMID 19263523 .
- Lyumkis, D; Julien, JP; de Val, N; Cupo, A; Potter, CS; Klasse, PJ; Burton, DR; Sanders, RW; Moore, JP; Carragher, B; Wilson, IA; Ward, AB (2013). "Estructura crio-EM de un trímero de envoltura de VIH-1 escindido soluble completamente glicosilado" . Ciencia . 342 (6165): 1484–90. Código Bibliográfico : 2013Sci ... 342.1484L . doi : 10.1126 / science.1245627 . PMC 3954647 . PMID 24179160 .
- Noble, AJ; Wei, H; Dandey, vicepresidente; Zhang, Z; Tan, YZ; Potter, CS; Carragher, B (2018). "Reducción de los efectos de la adsorción de partículas a la interfaz aire-agua en crio-EM" . Métodos Nat . 15 (10): 793–795. doi : 10.1038 / s41592-018-0139-3 . PMC 6168394 . PMID 30250056 .
- Scapin, G; Dandey, vicepresidente; Zhang, Z; Prosise, W; Hruza, A; Kelly, T; Mayhood, T; Strickland, C; Potter, CS; Carragher, B (2018). "Estructura del complejo de insulina-receptor de insulina mediante análisis crio-EM de una sola partícula" . Naturaleza . 556 (7699): 122–5. Código Bib : 2018Natur.556..122S . doi : 10.1038 / nature26153 . PMC 5886813 . PMID 29512653 .
Contribuciones seleccionadas adicionales al campo EM
Automatización CryoEM
Carragher fue uno de los primeros defensores de los métodos automatizados para la microscopía electrónica. Ella desarrolló un software para analizar fibras de hemoglobina de células falciformes mal ordenadas [1] y luego colaboró con el grupo de Ron Milligan para desarrollar una tubería para el procesamiento helicoidal (Phoelix). [2] Junto con Clint Potter, Carragher lideró el desarrollo de Leginon , [3] un sistema para control automatizado y adquisición de datos desde un microscopio electrónico, y Appion , [4] una tubería para el procesamiento de datos de partículas individuales. Recientemente, demostraron que podían utilizar esta canalización automatizada para obtener mapas con una resolución de 2,8 Å.
Nuevas tecnologías para TEM
Carragher y su equipo han desarrollado una serie de tecnologías novedosas para la microscopía electrónica de transmisión (TEM). Estos incluyen Spotiton, un sistema de vitrificación y dispensación de inyección de tinta para crio-TEM, [5] [6] dispositivos robóticos para cargar muestras TEM en el microscopio, [7] robots de manipulación de líquidos para controlar la vitrificación de muestras [8] [9] y tinción negativa y nuevos sustratos, incluido uno que dio lugar a rejillas que ahora están disponibles comercialmente con el nombre comercial Cflats . [10]
Contribuciones a la biología estructural
Los principales objetivos del desarrollo tecnológico han sido impulsados por las necesidades de proyectos de investigación biológica convincentes. Normalmente son gestionados por un estudiante de posgrado o un becario posdoctoral que establece estrechas líneas de comunicación entre el grupo de EM y el laboratorio de investigación biológica. Si bien su papel principal es administrar los esfuerzos técnicos, a menudo también están íntimamente involucrados en la orientación de las cuestiones biológicas y la redacción de los artículos. Los autores de estos artículos [11] [12] [13] [14] eran estudiantes de posgrado o posdoctorados en los laboratorios de Carragher.
Contribuciones al campo:
Carragher ha estado involucrado en una serie de esfuerzos para validar y mejorar métodos para todo el campo. Estos incluyen un taller de recolección de partículas [15], el reciente desafío CTF [16] y una serie de talleres organizados por el EMDB para discutir estándares y validación. [17] [18] También ha organizado numerosos talleres, incluido el Taller de métodos avanzados bienal NRAMM.
Referencias
- ^ Carragher, B .; Bluemke, DA; Gabriel, B .; Potel, MJ; Josephs, R. (20 de enero de 1988). "Análisis estructural de polímeros de hemoglobina falciforme. I. Fibras de hemoglobina falciforme". Revista de Biología Molecular . 199 (2): 315–331. doi : 10.1016 / 0022-2836 (88) 90316-6 . ISSN 0022-2836 . PMID 3351926 .
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