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Dominio de tipo C de lectina
PDB 1jzn EBI.jpg
Estructura pentamérica de la lectina de veneno de serpiente de cascabel, que es una lectina de unión a galactosa. [1] [2]
Identificadores
SímboloLectin_C
PfamPF00059
InterProIPR001304
INTELIGENTECLECT
PROSITEPS50041
SCOP22msb / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00037
Membranome52
Estructuras proteicas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumresumen de estructura

Una lectina de tipo C ( CLEC ) es un tipo de dominio de proteína de unión a carbohidratos conocido como lectina . [3] La designación de tipo C proviene de su requisito de calcio para la unión. [4] Las proteínas que contienen dominios de lectina de tipo C tienen una amplia gama de funciones que incluyen la adhesión célula a célula, la respuesta inmune a patógenos y la apoptosis . [5] [6]

Clasificación [ editar ]

Drickamer y col. clasificaron las lectinas de tipo C en 7 subgrupos (I a VII) basándose en el orden de los diversos dominios proteicos en cada proteína. [7] Esta clasificación se actualizó posteriormente en 2002, lo que dio lugar a siete grupos adicionales (VIII a XIV). [8] Más recientemente, se agregaron tres subgrupos más (XV a XVII). [3]

GrupoNombreDominios asociados
ILecticasDominios EGF , Sushi , Ig y Link
IIReceptores de asialoglicoproteína y DCNinguno
IIICollectinsNinguno
IVSeleccionesDominios de sushi y EGF
VNK - receptores de célulasNinguno
VIReceptores endocíticos multi-CTLDDominios FnII y Ricin
VIIGrupo de registroNinguno
VIIICondrolectina , LayilinNinguno
IXTetranectinaNinguno
XPolicistinaDominios WSC, REJ, PKD
XIAttractin ( ATRN )Dominios PSI, EGF y CUB
XIIProteína básica principal de eosinófilos (EMBP)Ninguno
XIIIDGCR2Ninguno
XIVTrombomodulina , CD93 , CD248 , CLEC14ADominios EGF [9]
XVBimlecNinguno
XVIVERDominios SCP y EGF
XVIICBCP / Frem1 / QBRICKRepeticiones CSPG y dominios CalX-beta

Los CLEC incluyen:

  • CLEC1A , CLEC1B
  • CLEC2A , CLEC2B , CD69 (CLEC2C), CLEC2D , CLEC2L
  • CLEC3A , CLEC3B
  • CLEC4A , CLEC4C , CLEC4D , CLEC4E , CLEC4F , CLEC4G , ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
  • CLEC5A
  • CLEC6A
  • CLEC7A
  • OLR1 (CLEC8A)
  • CLEC9A
  • CLEC10A
  • CLEC11A
  • CLEC12A , CLEC12B
  • CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
  • CLEC14A
  • CLEC16A
  • CLEC17A

Los "receptores similares a lectina de células NK" son un grupo muy relacionado: [10]

  • KLRA1
  • KLRB1 (CLEC5B)
  • KLRC1 , KLRC2 , KLRC3 , KLRC4
  • KLRD1
  • KLRF1 (CLEC5C)
  • KLRG1 (CLEC15A), KLRG2 (CLEC15B)
  • KLRK1

Las proteínas adicionales que contienen este dominio incluyen:

  • AGC1 ; ATRNL1
  • BCAN
  • CD248 ; CD72 ; CD93 ; CHODL ; CL-K1-Ia ; CL-K1-Ib ; CL-K1-Ic ; CLECSF5 ; COLEC10 ; COLEC11 ; COLEC12 ; CSPG3
  • FCER2 ; FREM1 ; HBXBP ;
  • LAYN ; LOC348174 ; LOC728276
  • MAFA ; MBL2 ; MGC34761 ; MICL ; MRC1L1
  • OLR1
  • PAP ; PKD1 ; PKD1L2 ; PLA2R1 ; PRG2 ; PRG3
  • REG1A ; REG1B ; REG3A ; REG3G ; REG4
  • SELE ; VENDER ; SELP ; SFTPA1 ; SFTPA2 ; SFTPA2B ; SFTPD ; SRCL
  • THBD
  • VCAN

Referencias [ editar ]

  1. ^ Walker JR, Nagar B, Young NM, Hirama T, Rini JM (abril de 2004). "Estructura cristalina de rayos X de una lectina de tipo C específica de galactosa que posee una estructura cuaternaria decamérica novedosa". Bioquímica . 43 (13): 3783–92. doi : 10.1021 / bi035871a . PMID  15049685 .
  2. ^ Mahla RS, Reddy MC, Prasad DV, Kumar H (septiembre de 2013). "Endulzar los PAMP: papel de los PAMP complejados con azúcar en la inmunidad innata y la biología de las vacunas" . Fronteras en inmunología . 4 : 248. doi : 10.3389 / fimmu.2013.00248 . PMC 3759294 . PMID 24032031 .  
  3. ↑ a b Zelensky AN, Gready JE (diciembre de 2005). "La superfamilia de dominios similares a lectina de tipo C". FEBS J . 272 (24): 6179–217. doi : 10.1111 / j.1742-4658.2005.05031.x . PMID 16336259 . 
  4. ^ Tipo C + Lectina en los encabezados de temas médicos de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.(MeSH)
  5. ^ Drickamer K (octubre de 1999). "Dominios similares a lectina de tipo C". Curr. Opin. Struct. Biol . 9 (5): 585–90. doi : 10.1016 / S0959-440X (99) 00009-3 . PMID 10508765 . 
  6. ^ Cambi A, Figdor C (mayo de 2009). "Necrosis: las lectinas de tipo C detectan la muerte celular". Curr. Biol . 19 (9): R375–8. doi : 10.1016 / j.cub.2009.03.032 . PMID 19439262 . S2CID 17409821 .  
  7. ^ Drickamer K (1993). "Evolución de lectinas animales dependientes de Ca (2 +)". Prog. Res. De ácido nucleico Mol. Biol . Avances en investigación de ácidos nucleicos y biología molecular. 45 : 207–32. doi : 10.1016 / S0079-6603 (08) 60870-3 . ISBN 978-0-12-540045-9. PMID  8341801 .
  8. ^ Drickamer K, Fadden AJ (2002). "Análisis genómico de lectinas de tipo C". Biochem. Soc. Symp . 69 (69): 59–72. doi : 10.1042 / bss0690059 . PMID 12655774 . 
  9. ^ Khan, KA; McMurray, JL; Mohammed, F .; Bicknell, R. (2019). "Proteínas del grupo 14 del dominio de lectina de tipo C en biología vascular, cáncer e inflamación" . Diario FEBS . 286 (17): 3299–3332. doi : 10.1111 / febs.14985 . PMC 6852297 . PMID 31287944 .  
  10. ^ NK + Cell + Lectin-Like + Receptores en los encabezados de temas médicos de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.(MeSH)

Enlaces externos [ editar ]

  • Functional Glycomics Gateway , una colaboración entre el Consortium for Functional Glycomics y Nature Publishing Group