La policistina 1 (a menudo abreviada como PC1 ) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen PKD1 . [5] [6] Las mutaciones de PKD1 se relacionan con la mayoría de los casos de poliquistosis renal autosómica dominante , un trastorno hereditario grave de los riñones caracterizado por el desarrollo de quistes renales y disfunción renal grave. [7]
PKD1 |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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1B4R |
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Identificadores |
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Alias | PKD1 , PBP, Pc-1, TRPP1, policistina 1, canal potencial del receptor transitorio que interactúa, PC1 |
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Identificaciones externas | OMIM : 601313 MGI : 97603 HomoloGene : 250 GeneCards : PKD1 |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 16 (humano) [1] |
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| Banda | 16p13.3 | Comienzo | 2.088.708 pb [1] |
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Final | 2,135,898 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 17 (ratón) [2] |
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| Banda | 17 A3.3 | 17 12.4 cm | Comienzo | 24,549,834 pb [2] |
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Final | 24.596.508 pb [2] |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • canal iónico de unión • dominio de unión específica de proteína • actividad de los canales de calcio • GO: proteína de unión 0001948 • proteína quinasa de unión • de unión a carbohidratos
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Componente celular | • citoplasma • componente integral de la membrana • aparato de Golgi • proyección celular • lateral plasma membrana • membrana • Golgi membrana • plasma membrana • componente integral de la membrana plasmática • cilio • superficie celular • basolateral plasma membrana • ciliar membrana • Golgi asociada a membrana de la vesícula • exosoma extracelular • núcleo • complejo de policistina • cilio móvil
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Proceso biológico | • la adhesión célula-matriz independiente de calcio • transporte de iones de calcio • regulación de proceso catabólico proteína proteasomal • desarrollo de túbulos mesonéfricos • el desarrollo del sistema renal • receptor vía de señalización a través de JAK-STAT • metanéfrico distal túbulo morfogénesis • regulación de la organización huso mitótico • desarrollo conducto mesonéfrico • desarrollo renal • secuestro citoplasmático del factor de transcripción • regulación positiva de la concentración de iones de calcio citosólico • morfogénesis de la estructura anatómica • desarrollo de vasos sanguíneos de la placenta • desarrollo de la placenta embrionaria • desarrollo embrionario en el útero • respuesta al estrés por cizallamiento del líquido • desarrollo de los genitales • desarrollo metanéfrico ascendente de miembros delgados • metanéfrico proximal tubule desarrollo • el desarrollo del corazón • desarrollo del cartílago • regulación de la adhesión celular • proceso metabólico compuesto de nitrógeno • desarrollo de vasos sanguíneos • transporte transmembrana de iones de calcio • peptidil-serina fosforilación • linfático morfogénesis recipiente • desarrollo del tubo neural • exportación de proteínas del núcleo • detección de estímulos mecánicos • establecimiento de la polaridad celular • desarrollo de la médula espinal • desarrollo del conducto colector metanéfrico • desarrollo del hígado • regulación positiva de la unión de proteínas • desarrollo del tracto digestivo • adhesión de la matriz celular • desarrollo del epitelio pulmonar • morfogénesis ramificada de un tubo epitelial • condensación del cartílago • regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II • desarrollo de la piel • adhesión celular homofílica a través de moléculas de adhesión a la membrana plasmática • adhesión célula-célula
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 16: 2,09 - 2,14 Mb | Crónicas 17: 24,55 - 24,6 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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La PC1 interactúa con la policistina 2 mediante un dominio de espiral citoplásmico.
PC1 es una proteína unida a la membrana de 4303 aminoácidos de longitud que se expresa principalmente en el cilio primario , así como en las membranas apicales , uniones adherentes y desmosomas . [8] Tiene 11 dominios transmembrana , un dominio N-terminal extracelular grande y un dominio C-terminal citoplásmico corto (alrededor de 200 aminoácidos) . [8] [9] Este dominio intracelular contiene un dominio en espiral a través del cual PC1 interactúa con policistina 2 (PC2), un canal iónico permeable al Ca 2+ unido a la membrana .
Se ha propuesto PC1 para actuar como un receptor acoplado a proteína G . [8] [10] El dominio C-terminal se puede escindir de varias formas diferentes. En un caso, se ha encontrado que una porción de ~ 35 kDa de la cola se acumula en el núcleo celular en respuesta a la disminución del flujo de líquido en el riñón del ratón. [11] En otro caso, se puede producir un fragmento de 15 kDa, interactuando con el activador transcripcional y coactivador STAT6 y p100, o componentes de la vía de señalización canónica Wnt de manera inhibidora. [12] [13]
La estructura del complejo PKD1-PKD2 humano se resolvió mediante microscopía crioelectrónica , que mostró una relación 1: 3 de PKD1 y PKD2 en la estructura. PKD1 consiste en un pliegue de canal iónico dependiente de voltaje que interactúa con PKD2. [14]
El PC1 media la mecanosensación del flujo de líquido por el cilio primario en el epitelio renal y la deformación mecánica del cartílago articular. [15]
Se han observado variantes de empalme que codifican diferentes isoformas para PKD1 . El gen está estrechamente relacionado con seis pseudogenes en una región duplicada conocida en el cromosoma 16p. [dieciséis]