Nacido en Estrasburgo, Schnitzler estudió música en el Conservatorio de Estrasburgo ( órgano , clavicémbalo , dirección y escritura), antes de completar su formación como director en la Universidad Mozarteum de Salzburgo mientras daba numerosos recitales de órgano en Francia y en el extranjero. En 1971 fue nombrado organista titular del gran órgano de la Catedral de Estrasburgo .
Se unió a la Opéra national du Rhin en 1972 como director de canto y en 1975 se convirtió en asistente de Alain Lombard en la Orquesta Filarmónica de Estrasburgo y en la Opéra national du Rhin, donde desde entonces ha dirigido numerosos espectáculos.
De 1981 a 1985, colaboró regularmente con la Ópera de París , donde dirigió espectáculos de ópera y ballet tanto en el Palais Garnier como en la Salle Favart .
En 1986 asumió la dirección de la Orquesta de la ciudad de Rennes , compaginando este cargo con el de director titular de la Opéra national du Rhin.
De 1989 a 1995 estuvo a cargo de la Orchestre symphonique de Bretagne y sigue actuando al frente de las principales orquestas francesas (Orchestra of the Paris Opera , Orchestre philharmonique de Radio France , Orchestre national d'Île-de -Francia , Orquesta de la Ópera de Lyon , Orchestre National Bordeaux Aquitaine , Orchestre philharmonique de Montpellier) así como en muchos teatros de ópera extranjeros ( Liceu de Barcelona, la Fenice de Venecia, Teatro Regio de Turín, Théâtre Royal de la Monnaie en Bruselas ).
Divide su tiempo entre la ópera y el concierto sinfónico, donde el repertorio tradicional se fusiona con el contemporáneo. Dirigió la creación del Goya de Jean Prodromidès en Montpellier y Marsella; el estreno francés de Owen Wingrave de Britten (en la Opéra du Rhin).