Las Clostridiaceae son una familia de la clase bacteriana Clostridia y contienen el género Clostridium .
Clostridiaceae | |
---|---|
Microfotografía de la bacteria Clostridium botulinum teñida con violeta cristal | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | Bacterias |
Filo: | Firmicutes |
Clase: | Clostridios |
Pedido: | Clostridiales |
Familia: | Clostridiaceae Pribram 1933 [1] |
La familia Clostridiaceae (nombre científico) definido por el esquema taxonómico de Bergey del Manual de Bacteriología Sistemática contiene como núcleo del género Clostridium ( sensu stricto ), así como Acetivibrio , Acidaminobacter , Alkaliphilus , Anaerobacter , Caloramator , Caloranaerobacter , Coprobacillus , Dorea , Natronincola , Oxobacter , Sarcina , Sporobacter , Thermobrachium , Thermohalobacter y Tindallia . La inclusión previa de estos géneros adicionales (como se ve a la derecha) en una familia de Clostridiaceae se basa en su mayor parte porque las especies tipo de estos géneros están en muchos casos relacionadas filogenéticamente con especies mal clasificadas del género Clostridium . Sin embargo, con la excepción de Anaerobacter , Caloramator , Oxobacter , Sarcina y Thermobrachium , estos géneros quedan fuera de la radiación de lo que puede considerarse la verdadera familia Clostridiaceae y ahora se consideran pertenecientes a otras familias dentro de la baja G + C, Gram- phylum positivo.
Esta clasificación errónea es el resultado de problemas bien conocidos de la estructura taxonómica actual del género tradicional Clostridium . El análisis filogenético de Collins (1994) fue la primera comparación a gran escala de secuencias de genes de ARNr 16S de especies del género Clostridium y taxones relacionados. El hecho de que las especies del género Clostridium no formaran un grupo monofilético se ha demostrado en varios estudios en los que se habían comparado pequeños grupos de especies de Clostridium desde 1981. El estudio comparativo de Collins (1994) y estudios posteriores Se puede utilizar para concluir que más de la mitad de las especies actualmente asignadas a este género no están estrechamente relacionadas con la especie tipo, C. butyricum , y desde un punto de vista filogenético no deberían incluirse en un género Clostridium recién definido . [2]
Esta extensa diversidad genética del género Clostridium se había demostrado utilizando estudios de hibridación de ADNr: ARNr 23S en 1975 por Johnson y Francis, pero el enfoque de la secuencia del gen ARNr 16S reveló las relaciones filogenéticas reales entre las especies de este género y otros géneros.
El género Clostridium comprende actualmente 152 especies descritas válidamente en la nomenclatura. [3] Sin embargo, sobre la base de los análisis de la secuencia del gen del ARNr 16S, solo 73 de ellos caen dentro de la radiación de la especie tipo del género Clostridium .
Subdivisiones
- Alkaliphilus
- Anaeromicrobium
- Anaerosolibacter
- Anoxynatronum
- Beduini
- Brassicibacter
- Butyricicoccus
- Caldanaerocella
- Caldisalinibacter
- Caloramator
- Caloranaerobacter
- Caminicella
- Clostridiisalibacter
- Clostridium
- Crassaminicella [4]
- Desnuesiella
- Enterocloster
- Falcatimonas
- Fervidicela
- Fonticella
- Geosporobacter
- Haloimpatiens
- Hathewaya
- Hungatella
- Inediibacterium
- Queratinibaculum
- Khelaifiella
- Lacrimispora
- Lactonifactor
- Linmingia
- Lutispora
- Maledivibacter
- Marinisporobacter
- Massilioclostridium
- Mordavella
- Natronincola
- Oceanirhabdus
- Oxobacter
- Paramaledivibacter
- Proteiniclasticum
- Salimesophilobacter
- Sarcina
- Senegalia
- Serpentinicela
- Sporosalibacterium
- Thermobrachium
- Thermohalobacter
- Thermotalea
- Tindallia
- Wukongibacter
- Youngiibacter
- " Ca. Arthromitus "
- " Ca. Savagella " Thompson y col. 2012
Referencias
- ↑ Pribram, Ernst August : Klassification der Schizomyceten. F. Deuticke, Leipzig, (1933) págs. 1-143.
- ^ Collins, MD; Lawson, PA; Willems, A; Cordoba, JJ; Fernández-Garayzabal, J; García, P; Cai, J; Hippe, H; Farrow, JA (octubre de 1994). "La filogenia del género Clostridium: propuesta de cinco nuevos géneros y once nuevas combinaciones de especies" . Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 44 (4): 812-26. doi : 10.1099 / 00207713-44-4-812 . PMID 7981107 .
- ^ www.bacterio.net
- ^ Lakhal, R; Pradel, N; Postec, A; Ollivier, B; Cayol, JL; Godfroy, A; Fardeau, ML; Galés, G (septiembre de 2015). "Crassaminicella profunda gen. Nov., Sp. Nov., Una bacteria marina anaeróbica aislada de sedimentos de aguas profundas" (PDF) . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 65 (9): 3097–102. doi : 10.1099 / ijsem.0.000386 . PMID 26296351 .