Una base de datos cristalográfica es una base de datos diseñada específicamente para almacenar información sobre la estructura de moléculas y cristales . Los cristales son sólidos que tienen, en las tres dimensiones del espacio, una disposición de átomos , iones o moléculas que se repite regularmente . Se caracterizan por su simetría , morfología y propiedades físicas direccionalmente dependientes. Una estructura cristalina describe la disposición de átomos, iones o moléculas en un cristal. (Las moléculas deben cristalizar en sólidos para que sus arreglos que se repiten regularmente se puedan aprovechar en rayos X, cristalografía basada en difracción de electrones y neutrones ).
Las estructuras cristalinas de material cristalino se determinan típicamente a partir de datos de difracción monocristalina de rayos X o neutrones y se almacenan en bases de datos de estructuras cristalinas. Se identifican de forma rutinaria comparando intensidades de reflexión y espaciamientos de celosía de datos de difracción de rayos X en polvo con entradas en bases de datos de huellas dactilares de difracción de polvo .
Las estructuras cristalinas de muestras cristalinas de tamaño nanométrico se pueden determinar a través de la información de amplitud del factor de estructura a partir de datos de difracción de electrones de cristal único o información de amplitud de factor de estructura y ángulo de fase de transformadas de Fourier de imágenes HRTEM de cristalitos . Se almacenan en bases de datos de estructuras cristalinas especializadas en nanocristales y se pueden identificar comparando subconjuntos de ejes de zona en diagramas de huellas dactilares en celosía con entradas en una base de datos de huellas dactilares en celosía .
Las bases de datos cristalográficas difieren en los derechos de acceso y uso y ofrecen distintos grados de capacidad de búsqueda y análisis. Muchos proporcionan capacidades de visualización de estructuras. Pueden basarse en un navegador o instalarse localmente. Las versiones más recientes se basan en el modelo de base de datos relacional y admiten el archivo de información cristalográfica ( CIF ) como formato de intercambio de datos universal.
Los datos cristalográficos se extraen principalmente de artículos científicos publicados y material complementario. Las versiones más nuevas de las bases de datos cristalográficas se basan en el modelo de base de datos relacional , lo que permite una eficiente referencia cruzada de tablas. Las referencias cruzadas sirven para derivar datos adicionales o mejorar la capacidad de búsqueda de la base de datos.
El intercambio de datos entre bases de datos cristalográficas, software de visualización de estructuras y programas de refinamiento de estructuras se ha visto facilitado por la aparición del formato de archivo de información cristalográfica (CIF). El formato CIF es el formato de archivo estándar para el intercambio y archivo de datos cristalográficos. [1] Fue adoptado por la Unión Internacional de Cristalografía ( IUCr ), que también proporciona especificaciones completas del formato. [2] Es compatible con las principales bases de datos cristalográficas.