La base de datos de proteínas diversidad conformacional ( PCDB ) es una base de datos de la diversidad de estructuras terciarias de proteína dentro de los dominios de proteínas como se determina por cristalografía de rayos X . [1] [2] Las proteínas son inherentemente flexibles y esta base de datos recopila información sobre este tema para su uso en la investigación molecular. Utiliza la base de datos CATH como fuente de estructuras para cada proteína e informa el rango de diferencias en las estructuras en función de su superposición e informa un RMSD máximo.. La interfaz para la base de datos permite a los investigadores encontrar proteínas con un rango de flexibilidad conformacional que les permite encontrar proteínas altamente flexibles, por ejemplo. La base de datos es administrada y mantenida por un grupo de investigadores de la Universidad Nacional de Quilmes en Argentina.
Contenido | |
---|---|
Descripción | diversidad conformacional de proteínas . |
Contacto | |
Centro de Investigación | Universidad Nacional de Quilmes |
Laboratorio | Centro de Estudios e Investigaciones |
Autores | Ezequiel I Juritz |
Cita primaria | Juritz y col. (2011) [1] |
Fecha de lanzamiento | 2010 |
Acceso | |
Sitio web | http://www.pcdb.unq.edu.ar |
Ver también
Referencias
- ↑ a b Juritz EI, Alberti SF, Parisi GD (enero de 2011). "PCDB: una base de datos de diversidad conformacional de proteínas" . Ácidos nucleicos Res . 39 (Problema de la base de datos): D475–9. doi : 10.1093 / nar / gkq1181 . PMC 3013735 . PMID 21097895 .
- ^ Galperin MY, Cochrane GR (enero de 2011). "El problema de la base de datos de investigación de ácidos nucleicos de 2011 y la colección de bases de datos de biología molecular en línea" . Ácidos nucleicos Res . 39 (Problema de la base de datos): D1–6. doi : 10.1093 / nar / gkq1243 . PMC 3013748 . PMID 21177655 .
enlaces externos
- Juritz, Ezequiel Iván; Fernández Alberti, Sebastián; Parisi, Gustavo Danie. "Base de datos conformacional de proteínas" . Grupo de Bioinformática Estructural; Universidad Nacional de Quilmes. Archivado desde el original el 30 de marzo de 2012 . Consultado el 19 de agosto de 2011 .