Deinococcus

Género de bacterias

Deinococcus
Una tétrada de D. radiodurans
clasificación cientifica
Dominio:	Bacterias
Filo:	Deinococcus - Thermus
Clase:	Deinococos
Pedido:	Deinococcales
Familia:	Deinococcaceae
Género:	Deinococcus Brooks y Murray 1981 enmendan. Rainey y col. 1997
Sinónimos
Deinobacter Oyaizu y col. 1987

Deinococcus (del griego : δεινός , deinos , "terrible, extraño" y κόκκος, kókkos , "gránulo" ^[1] ) es un género ^[2] de tres en el orden Deinococcales ^{[3] [4]} del filo bacteriano Deinococcus - Thermus altamente resistente a los peligros ambientales. Estas bacterias tienen paredes celulares gruesas que les dantinciones Gram-positivas , pero incluyen una segunda membrana y, por lo tanto, tienen una estructura más cercana a las bacterias Gram-negativas . Deinococcussobreviven cuando su ADN está expuesto a altas dosis de radiación gamma y ultravioleta. Mientras que otras bacterias cambian su estructura en presencia de radiación, como al formar endosporas, Deinococcus la tolera sin cambiar su forma celular y no se retira a una estructura endurecida. También se caracterizan por la presencia del pigmento carotenoide deinoxantina que les da su color rosa. Por lo general, se aíslan de acuerdo con estos dos criterios. En agosto de 2020, los científicos informaron que las bacterias de la Tierra, en particular la bacteria Deinococcus, sobrevivieron durante tres años en el espacio exterior , según estudios realizados en la Estación Espacial Internacional . Estos hallazgos apoyan la noción depanspermia , la hipótesis de que la vida existe en todo el Universo , distribuida de diversas formas, incluyendo polvo espacial , meteoroides , asteroides , cometas , planetoides o naves espaciales contaminadas . ^{[5] [6]}

Especies

En agosto de 2011 ^[actualizar], había 47 especies de Deinococcus descritas según el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI):

• ? D. aluminii Kim y col. 2018
• ? " D. aquivivus " ♠ ^{[nota 1]} Kaempferet al. 2008
• ? D. arenae Lee y col. 2016
• ? D. budaensis Makk y col. 2016
• ? D. erythromyxa (ex Chester 1901) Brooks & Murray 1981 nom. Rvdo.
• ? " D. gammatolerans " ♠ Srinivasan, Kang & Kim 2017
• ? D. hibisci Moya y col. 2018
• ? D. knuensis Lee y col. 2017
• ? " D. koreense " ♠ Kim, Kang y Srinivasan 2017
• ? D. koreensis Baek y col. 2018
• ? D. lacus Park y col. 2018
• ? D. malanensis Zhu y col. 2017
• ? D. multiflagellatus Kim y col. 2018
• ? D. persicinus Jeon y col. 2016
• ? " D. planocerae " ♠ Lin et al. 2017
• ? " D. populi " ♠ Li, Kudo y Tonouchi 2018
• ? " D. puniceus " ♠ Lee et al. 2014
• ? D. radioresistens Srinivasan et al. 2016
• ? D. ruber Kim y col. 2017
• ? D. rufus Wang y col. 2018
• ? " D. sahariens " ♠ Bouraoui et al. 2012
• ? D. sedimenti Lee y col. 2017
• ? " D. soli " ♠ Cha et al. 2016
• ? " D. soli " ♠ ^{[nota 1]} Zhang et al. 2011
• ? D. taklimakanensis Liu y col. 2017
• ? " D. xianganensis " ♠ Zheng et al. 2014
• D. actinosclerus ^[7]
• D. aerius ^[8]
• D. aerolatus ^[9]
• D. aerophilus ^[9]
• D. aetherius ^[10]
• D. alpinitundrae ^[11]
• D. altitudinis ^[11]
• D. antarcticus ^[7]
• D. apachensis ^[12]
• D. aquaticus ^[13]
• D. aquatilis ^[14]
• D. aquiradiocola ^[15]
• D. arenae ^[7]
• D. budaensis ^[7]
• D. caeni ^[13]
• D. carri ^[7]
• D. cellulosilyticus ^[16]
• D. citri ^[7]
• D. claudionis ^[11]
• D. daejeonensis ^[17]
• D. depolymerans ^[18]
• D. deserti ^[19]
• D. ficus ^[20]
• D. frigens ^[21]
• D. geotermalis ^[22]
• D. gobiensis ^[23]
• D. grandis (originalmente Deinobacter grandis , ^[24] pero luego transferido ^[25] )
• D. hohokamensis ^[12]
• D. hopiensis ^[12]
• D. knuensis ^[7]
• D. indicus ^[26]
• D. maricopensis ^[12]
• D. marmoris ^[21]
• D. metalli
• D. metallilatus
• D. misasensis ^[27]
• D. murrayi ^[22]
• D. navajonensis ^[12]
• D. papagonensis ^[12]
• D. peraridilitoris ^[28]
• D. persicinus ^[7]
• D. pimensis ^[12]
• D. piscis ^[29]
• D. proteolyticus ^[30]
• D. puniceus ^[7]
• D. radiodurans ^[31]
• D. radiomollis ^[11]
• D. radiophilus ^[32]
• D. radiopugnans ^[33]
• D. reticulitermitis ^[34]
• D. roseus ^[27]
• D. ruber ^[7]
• D. saudiensis ^[7]
• D. saxicola ^[21]
• D. sedimenti ^[7]
• D. seoulensis ^[7]
• D. soli ^[7]
• D. sonorensis ^[12]
• D. wulumuqiensis ^[35]
• D. xibeiensis ^[35]
• D. xinjiangensis ^[36]
• D. yavapaiensis ^[12]
• D. yunweiensis ^[37]

Filogenia

Ver también: taxonomía bacteriana

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres de procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) ^[38] y NCBI ^[39] y la filogenia se basa en la liberación 132 de LTP basada en rRNA 16S del Proyecto 'The All-Species Living Tree' . ^[40]

D. pimensis Rainey y da Costa 2005       D. peraridilitoris Rainey et al. 2007       D. papagonensis Rainey y da Costa 2005     D. yavapaiensis Rainey y da Costa 2005               D. misasensis Asker et al. 2008       D. cellulosilyticus Weon et al. 2007     D. roseus Asker y col. 2008           D. maricopensis Rainey y da Costa 2005         D. sonorensis Rainey y da Costa 2005       D. radiomollis Callegan y col. 2008       D. altitudinis Callegan et al. 2008       D. aquiradiocola Asker y col. 2009     D. claudionis Callegan y col. 2008               D. alpinitundrae Callegan y col. 2008         D. radiophilus (ex Lewis 1973) Books y Murray 1981       D. piscis Shashidhar y Bandekar 2009     D. proteolyticus Brooks y Murray 1981             D. xinjiangensis Peng y col. 2009       D. antarcticus Dong y col. 2015       D. carri Kim y col. 2015       D. aquatilis Kämpfer y col. 2008       D. enclensis Thorat y col. 2015     D. ficus Lai y col. 2006 enmienda. Kämpfer 2009                   D. phoenicis Vaishampayan, Venkateswaran y Schwendner 2014       D. reticulitermitis Chen y col. 2012       D. citri Ahmed y col. 2014     D. gobiensis Yuan y col. 2009               D. indicus Suresh y col. 2004       D. radiodurans (ex Raj et al. 1960) Brooks y Murray 1981 (tipo sp.)     D. wulumuqiensis Wang y col. 2010             D. radiotolerans Cha et al. 2015       D. deserti de Groot y col. 2005       D. hohokamensis Rainey y da Costa 2005     D. navajonensis Rainey y da Costa 2005               D. caeni Im y col. 2008       D. aquaticus Im y col. 2008     D. depolymerans Asker et al. 2011             D. daejeonensis Srinivasan y col. 2012       D. actinosclerus Joo y col. 2016     D. grandis (Oyaizu et al. 1987) Rainey et al. 1997             D. metalli Feng y col. 2015     D. yunweiensis Zhang y col. 2007           D. hopiensis Rainey y da Costa 2005         D. murrayi Ferreira y col. 1997       D. metallilatus Kim y col. 2015       D. geothermalis Ferreira y col. 1997       D. apachensis Rainey y da Costa 2005       D. aerius Yang y col. 2009     D. aetherius Yang y col. 2010                     D. aerophilus Yoo y col. 2010       D. humi Srinivasan y col. 2012       D. aerolatus Yoo y col. 2010       D. swuensis Lee y col. 2015       D. radiopugnans Brooks y Murray 1981       D. marmoris Hirsch y col. 2006       D. saxicola Hirsch y col. 2006     D. frigens Hirsch y col. 2006

Notas

1. Cepa encontrada en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) pero no incluida en la Lista de nombres de procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN).

Referencias

1. Entrada de Deinococcus en LPSN ; Euzéby, JP (1997). "Lista de nombres bacterianos con posición en nomenclatura: una carpeta disponible en Internet" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 47 (2): 590–2. doi : 10.1099 / 00207713-47-2-590 . PMID  9103655 .
2. Brooks BW, Murray RGE (1981) Nomenclatura de "Micrococcus radiodurans" y otros cocos resistentes a la radiación: Deinococcaceae fam. nov. y Deinococcus gen. nov., incluidas cinco especies. Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva 31: 353.
3. Ekman JV, Raulio M, Busse HJ, Menos DP, Salkinoja-Salonen M (2010) Deinobacterium chartae gen. nov., sp. nov., unabacteria formadora de biopelículas extremadamente resistente a la radiaciónaislada de una fábrica de papel finlandesa. Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva.
4. Albuquerque L, Sims C, Nobre MF, Pino NM, Battista JR, et al. (2005) Truepera radiovictrix gen. nov., sp. nov., una nueva especie resistente a la radiación y la propuesta de Trueperaceae fam. nov. Cartas de microbiología FEMS 247: 161-169.
5. Strickland, Ashley (26 de agosto de 2020). "Las bacterias de la Tierra pueden sobrevivir en el espacio y podrían soportar el viaje a Marte, según un nuevo estudio" . Noticias de CNN . Consultado el 26 de agosto de 2020 .
6. Kawaguchi, Yuko; et al. (26 de agosto de 2020). "Daño del ADN y curso del tiempo de supervivencia de los gránulos de células deinocócicas durante 3 años de exposición al espacio ultraterrestre" . Fronteras en microbiología . doi : 10.3389 / fmicb.2020.02050 . Consultado el 26 de agosto de 2020 .
7. Parte, AC "Deinococcus" . LPSN .
8. Yang Y, Itoh T, Yokobori S, Itahashi S, Shimada H, Satoh K, Ohba H, Narumi I, Yamagishi A. Deinococcus aerius sp. nov., aislado de la alta atmósfera. Int J Syst Evol Microbiol. Agosto de 2009; 59 (Pt 8): 1862-6.
9. Yoo SH, Weon HY, Kim SJ, Kim YS, Kim BY, Kwon SW. Deinococcus aerolatus sp. nov. y Deinococcus aerophilus sp. nov., aislado de muestras de aire. Int J Syst Evol Microbiol. Mayo de 2010; 60 (Pt 5): 1191-5.
10. Yang Y, Itoh T, Yokobori S, Shimada H, Itahashi S, Satoh K, Ohba H, Narumi I, Yamagishi A. Deinococcus aetherius sp. nov., aislado de la estratosfera. Int J Syst Evol Microbiol. Abril de 2010; 60 (Pt 4): 776-9
11. Callegan RP, Nobre MF, McTernan PM, Battista JR, Navarro-González R, McKay CP, da Costa MS, Rainey FA. Descripción de cuatro especies novedosas de Deinococcus psicrófilas, sensibles a la radiación ionizante de entornos alpinos. Int J Syst Evol Microbiol. Mayo de 2008; 58 (Pt 5): 1252-8.
12. Rainey FA, ​​Ray K, Ferreira M, Gatz BZ, Nobre MF, Bagaley D, Rash BA, Park MJ, Earl AM, Shank NC, Small AM, Henk MC, Battista JR, Kämpfer P, da Costa MS. Amplia diversidad de bacterias resistentes a las radiaciones ionizantes recuperadas del suelo del desierto de Sonora y descripción de nueve nuevas especies del género Deinococcus obtenidas de una sola muestra de suelo. Appl Environ Microbiol. Septiembre de 2005; 71 (9): 5225-35. Errata en: Appl Environ Microbiol. Noviembre de 2005; 71 (11): 7630.
13. Soy WT, Jung HM, Ten LN, Kim MK, Bora N, Goodfellow M, Lim S, Jung J, Lee ST. Deinococcus aquaticus sp. nov., aislado de agua dulce, y Deinococcus caeni sp. nov., aislado de lodos activados. Int J Syst Evol Microbiol. Octubre de 2008; 58 (Pt 10): 2348-53.
14. Kämpfer P, Lodders N, Huber B, Falsen E, Busse HJ. Deinococcus aquatilis sp. nov., aislado del agua. Int J Syst Evol Microbiol. Diciembre de 2008; 58 (Pt 12): 2803-6.
15. Autor de la pregunta D, Awad TS, Beppu T, Ueda K. Deinococcus aquiradiocola sp. nov., aislado de un sitio radiactivo en Japón. Int J Syst Evol Microbiol. Enero de 2009; 59 (Pt 1): 144-9.
16. Weon HY, Kim BY, Schumann P, Son JA, Jang J, Go SJ, Kwon SW. Deinococcus cellulosilyticus sp. nov., aislado del aire. Int J Syst Evol Microbiol. Agosto de 2007; 57 (Pt 8): 1685-8.
17. Srinivasan S, Kim MK, Lim S, Joe M, Lee M. Deinococcus daejeonensis sp. nov., aislado de lodos en una planta de tratamiento de aguas residuales. Int J Syst Evol Microbiol. 2011 15 de julio
18. Autor de la pregunta D, Awad TS, McLandsborough L, Beppu T, Ueda K. Deinococcus depolymerans sp. nov., una bacteria resistente a la radiación gamma y UV, aislada de un sitio naturalmente radiactivo. Int J Syst Evol Microbiol. Junio ​​de 2011; 61 (Pt 6): 1448-53
19. de Groot A, Chapon V, Sirviente P, Christen R, Saux MF, Sommer S, Heulin T. Deinococcus deserti sp. nov., una bacteria tolerante a la radiación gamma aislada del desierto del Sahara. Int J Syst Evol Microbiol. Noviembre de 2005; 55 (Pt 6): 2441-6.
20. Lai WA, Kämpfer P, Arun AB, Shen FT, Huber B, Rekha PD, Young CC. Deinococcus ficus sp. nov., aislado de la rizosfera de Ficus religiosa L. Int J Syst Evol Microbiol. Abril de 2006; 56 (Pt 4): 787-91
21. Hirsch P, Gallikowski CA, Siebert J, Peissl K, Kroppenstedt R, Schumann P, Stackebrandt E, Anderson R. Deinococcus frigens sp. nov., Deinococcus saxicola sp. nov. y Deinococcus marmoris sp. nov., bacterias resistentes a los rayos ultravioleta y tolerantes a bajas temperaturas y corrientes de aire de la Antártida continental. Syst Appl Microbiol. Noviembre de 2004; 27 (6): 636-45.
22. Ferreira AC, Nobre MF, Rainey FA, ​​Silva MT, Wait R, Burghardt J, Chung AP, da Costa MS. Deinococcus geothermalis sp. nov. y Deinococcus murrayi sp. nov., dos especies extremadamente resistentes a la radiación y ligeramente termofílicas de aguas termales. Int J Syst Bacteriol. Octubre de 1997; 47 (4): 939-47.
23. Yuan M, Zhang W, Dai S, Wu J, Wang Y, Tao T, Chen M, Lin M. Deinococcus gobiensis sp. nov., una bacteria extremadamente resistente a la radiación. Int J Syst Evol Microbiol. Junio ​​de 2009; 59 (Pt 6): 1513-7
24. Oyaizu H, Stackebrandt E, Schleifer KH, Ludwig W, Pohla H, Ito H, Hirata A, Oyaizu Y, Komagata K. Una bacteria en forma de varilla resistente a la radiación, Deinobacter grandis gen. nov., sp. nov., con peptidoglicano que contiene ornitina. En t. J. Syst. Bacteriol., 1987, 37, 62-67.
25. Rainey FA, ​​Nobre MF, Schumann P, Stackebrandt E, Da Costa MS. Diversidad filogenética de los deinococos determinada por comparación de secuencias de ADN ribosómico 16S. En t. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 510-514.
26. Suresh K, Reddy GS, Sengupta S, Shivaji S. Deinococcus indicus sp. nov., una bacteria resistente al arsénico de un acuífero en Bengala Occidental, India. Int J Syst Evol Microbiol. Marzo de 2004; 54 (Pt 2): 457-61.
27. Asker D, Awad TS, Beppu T, Ueda K. Deinococcus misasensis y Deinococcus roseus , nuevos miembros del género Deinococcus , aislados de un sitio radiactivo en Japón. Syst Appl Microbiol. Marzo de 2008; 31 (1): 43-9.
28. Rainey FA, ​​Ferreira M, Nobre MF, Ray K, Bagaley D, Earl AM, Battista JR, Gómez-Silva B, McKay CP, da Costa MS. Deinococcus peraridilitoris sp. nov., aislado de un desierto costero. Int J Syst Evol Microbiol. 2007 Julio; 57 (Pt 7): 1408-12.
29. Shashidhar R, Bandekar JR. Deinococcus piscis sp. nov., una bacteria resistente a la radiación aislada de un pez marino. Int J Syst Evol Microbiol. Noviembre de 2009; 59 (Pt 11): 2714-7
30. Kobatake, M., Tanabe, S., Hasegawa, S. Nouveau micrococcus radioresistant a pigment rouge, isole de feces de Lama glama , et son utilization comme indicaur microbiologique de la radiosterilisation. CR Seances Soc. Biol. Fil. (1973) 167, 1506-1510.
31. Anderson, AW; HC Nordan, RF Cain, G Parrish, D Duggan (1956). "Estudios sobre un micrococo radio-resistente. I. Aislamiento, morfología, características culturales y resistencia a la radiación gamma". Food Technol. 10 (1): 575–577.
32. Lewis NF. Micrococcus radiophilus sp. nov. aislado de pato de Bombay irradiado ( Harpodon nehereus ). Curr. Sci. (India) 1976, v. 42, no. 14, pág. 504
33. Davis, NS, Silverman, GJ, Mausurosky, EB Coco pigmentado resistente a la radiación aislado de tejido de eglefino. J. Bacteriol. 1963; 86, 294-298.
34. Chen W, Wang B, Hong H, Yang H, Liu SJ. Deinococcus reticulitermitis sp. nov., aislado de un intestino de termitas. Int J Syst Evol Microbiol. 18 de febrero de 2011
35. Wang W, Mao J, Zhang Z, Tang Q, Xie Y, Zhu J, Zhang L, Liu Z, Shi Y, Goodfellow M. Deinococcus wulumuqiensis sp. nov. y Deinococcus xibeiensis sp. nov., aislado de suelo contaminado por radiación. Int J Syst Evol Microbiol. Septiembre de 2010; 60 (Pt 9): 2006-10
36. Peng F, Zhang L, Luo X, Dai J, An H, Tang Y, Fang C. Deinococcus xinjiangensis sp. nov., aislado del suelo del desierto. Int J Syst Evol Microbiol. Abril de 2009; 59 (Pt 4): 709-13.
37. Zhang YQ, Sun CH, Li WJ, Yu LY, Zhou JQ, Zhang YQ, Xu LH, Jiang CL. Deinococcus yunweiensis sp. nov., una bacteria de China resistente a la radiación gamma y UV. Int J Syst Evol Microbiol. Febrero de 2007; 57 (Pt 2): 370-5.
38. JP Euzéby. "Deinococcus-Thermus" . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN) . Consultado el 20 de julio de 2018 .
39. Sayers; et al. "DeinococcusThermus" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de julio de 2018 .
40. "Lanzamiento 132 de LTP basado en rRNA 16S (árbol completo)" . Proyecto de árboles vivos para todas las especies . Silva Base de datos completa de ARN ribosómico . Consultado el 20 de julio de 2018 .