El dominio WH1 es un dominio proteico conservado evolutivamente . [1] Por tanto, tiene una función importante.
Dominio WH1 | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | WH1 | |||||||
Pfam | PF00568 | |||||||
InterPro | IPR000697 | |||||||
INTELIGENTE | WH1 | |||||||
SCOP2 | 1evh / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd01205 | |||||||
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Función
Los dominios WH1 se encuentran en las proteínas WASP, que a menudo participan en la polimerización de actina. Por lo tanto, WH1 es importante para todos los procesos celulares que involucran a la actina, esto incluye la motilidad celular, el tráfico celular, la división celular y la citocinesis, la señalización celular y el establecimiento y mantenimiento de las uniones celulares y la forma celular. [2]
Estructura
La estructura terciaria del dominio WH1 de la proteína Mena reveló similitudes estructurales con el dominio pleckstrina (PH). El pliegue general consiste en un sándwich beta paralelo compacto, cerrado a lo largo de un borde por una hélice alfa larga . Un grupo altamente conservado de tres cadenas laterales aromáticas expuestas a la superficie forma el sitio de reconocimiento para los ligandos diana de la molécula . [3]
Interacciones
La familia de proteínas WASP controla la polimerización de actina activando el complejo Arp2 / 3. WASP es defectuoso en el síndrome de Wiskott-Aldrich (WAS) por lo que en la mayoría de los casos de pacientes, la mayoría de las mutaciones puntuales ocurren dentro del dominio WH1 N-terminal. Los receptores metabotrópicos de glutamato mGluR1alpha y mGluR5 se unen a una proteína llamada homer, que es un homólogo del dominio WH1. [4] [5]
Las proteínas de la familia WASP contienen un EVH1 (WH1) en sus N-terminales que se unen a secuencias ricas en prolina en la proteína que interactúa con WASP. Las proteínas de la familia RanBP1 contienen un dominio WH1 en su región N-terminal, que parece unirse a un motivo de secuencia diferente presente en la parte C-terminal de la proteína RanGTP. [6] [7]
La estructura terciaria del dominio WH1 de la proteína Mena reveló similitudes estructurales con el dominio de homología de pleckstrina (PH). El pliegue general consiste en un sándwich beta paralelo compacto, cerrado a lo largo de un borde por una hélice alfa larga. Un grupo altamente conservado de tres cadenas laterales aromáticas expuestas a la superficie forma el sitio de reconocimiento para los ligandos diana de las moléculas. [3]
EVH1
EVH1 | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | EVH1 | |||||||
Pfam | PF00568 | |||||||
Clan pfam | CL0266 | |||||||
InterPro | IPR000697 | |||||||
INTELIGENTE | WH1 | |||||||
SCOP2 | 1evh / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd00837 | |||||||
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Un subconjunto de dominios WH1 se ha denominado dominio EVH1 que se une a un motivo poliprolina. El dominio EVH1 (también conocido como WH1 , RanBP1-WASP o dominio de homología 1 habilitado / VASP ) también es un dominio de proteína conservado evolutivamente . Los dominios EVH1 reconocen y se unen al motivo FPPPP rico en prolina con baja afinidad, luego se forman más interacciones entre los residuos flanqueantes. [5] [8]
El dominio EVH1 se encuentra en proteínas de homología Ena / Vasp multidominio implicadas en una amplia gama de eventos de señalización, transporte nuclear y citoesqueleto . Este dominio de alrededor de 115 aminoácidos está presente en especies que van desde levaduras hasta mamíferos . Muchas proteínas que contienen EVH1 se asocian con estructuras basadas en actina y juegan un papel en la organización citoesquelética . Los dominios EVH1 reconocen y se unen al motivo FPPPP rico en prolina con baja afinidad, luego se forman más interacciones entre los residuos flanqueantes. [8] [9] [10]
Ejemplos de
Los genes humanos que codifican proteínas que contienen el dominio WH1 (EVH1) incluyen:
- ENAH , EVL
- HOMER1 , HOMER2 , HOMER3
- RESORTE1 , RESORTE2 , RESORTE3
- VASP , FUE , WASL
Referencias
- ^ Symons M, Derry JM, Karlak B, Jiang S, Lemahieu V, Mccormick F, Francke U, Abo A (marzo de 1996). "La proteína del síndrome de Wiskott-Aldrich, un nuevo efector de la GTPasa CDC42Hs, está implicada en la polimerización de actina". Celular . 84 (5): 723–34. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81050-8 . PMID 8625410 . S2CID 17838931 .
- ^ Veltman DM, Insall RH (2010). "Proteínas de la familia WASP: su evolución y sus implicaciones fisiológicas" . Mol Biol Cell . 21 (16): 2880–93. doi : 10.1091 / mbc.E10-04-0372 . PMC 2921111 . PMID 20573979 .
- ^ a b Prehoda KE, Lee DJ, Lim WA (mayo de 1999). "Estructura del complejo de péptido-dominio de homología 1 habilitado / VASP: un componente clave en el control espacial del ensamblaje de actina". Celular . 97 (4): 471–80. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80757-6 . PMID 10338211 . S2CID 17078939 .
- ^ Ponting CP, Phillips C (1997). "La identificación de homer como un homólogo de la proteína del síndrome de Wiskott-Aldrich sugiere una función de unión al receptor para los dominios WH1". J. Mol. Med . 75 (11-12): 769-71. doi : 10.1007 / s001090050166 . PMID 9428607 . S2CID 39958754 .
- ^ a b Niebuhr K, Ebel F, Frank R, Reinhard M, Domann E, Carl UD, Walter U, Gertler FB, Wehland J, Chakraborty T (septiembre de 1997). "Un nuevo motivo rico en prolina presente en ActA de Listeria monocytogenes y proteínas citoesqueléticas es el ligando del dominio EVH1, un módulo proteico presente en la familia Ena / VASP" . EMBO J . 16 (17): 5433–44. doi : 10.1093 / emboj / 16.17.5433 . PMC 1170174 . PMID 9312002 .
- ^ Callebaut I, Cossart P, Dehoux P (diciembre de 1998). "Los dominios EVH1 / WH1 de las proteínas VASP y WASP pertenecen a una gran familia que incluye los dominios de unión a Ran de la familia RanBP1" . FEBS Lett . 441 (2): 181–5. doi : 10.1016 / S0014-5793 (98) 01541-5 . PMID 9883880 . S2CID 8527080 .
- ^ Beddow AL, Richards SA, Orem NR, Macara IG (abril de 1995). "El dominio de unión a Ran / TC4 GTPasa: identificación por clonación de expresión y caracterización de un motivo de secuencia conservada" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (8): 3328–32. doi : 10.1073 / pnas.92.8.3328 . PMC 42159 . PMID 7724562 .
- ^ a b Ball LJ, Jarchau T, Oschkinat H, Walter U (febrero de 2002). "Dominios EVH1: estructura, función e interacciones" . FEBS Lett . 513 (1): 45–52. doi : 10.1016 / S0014-5793 (01) 03291-4 . PMID 11911879 . S2CID 10368115 .
- ^ Pawson T. "Dominio EVH1" . El laboratorio de Pawson . Consultado el 9 de junio de 2011 .
- ^ PDB : 1QC6 ; Fedorov AA, Fedorov E, Gertler F, Almo SC (julio de 1999). "Estructura de EVH1, un nuevo módulo de unión a ligando rico en prolina implicado en la dinámica del citoesqueleto y la función neuronal". Nat. Struct. Biol . 6 (7): 661–5. doi : 10.1038 / 10717 . PMID 10404224 . S2CID 22881412 .
enlaces externos
- Motivo lineal eucariota clase de motivo de recurso LIG_EVH1_1
- Motivo lineal eucariota clase de motivo de recurso LIG_EVH1_2
- Motivo lineal eucariota clase de motivo de recurso LIG_WH1