En biología molecular, la familia de glucósido hidrolasas 15 es una familia de glucósido hidrolasas .
Familia de glucosil hidrolasas 15 | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | Glyco_hydro_15 | |||||||
Pfam | PF00723 | |||||||
Clan pfam | CL0059 | |||||||
SCOP2 | 1glm / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CAZy | GH15 | |||||||
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Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un resto carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7] y [_] 9
La familia de glucósido hidrolasa 15 CAZY GH_15 comprende enzimas con varias actividades conocidas; glucoamilasa ( EC 3.2.1.3 ); alfa-glucosidasa ( EC 3.2.1.20 ); glucodextranasa ( EC 3.2.1.70 ).
La glucoamilasa (GA) cataliza la liberación de D-glucosa de los extremos no reductores del almidón y otros oligo o polisacáridos. Los estudios de GA por hongos han indicado 3 residuos ácidos agrupados de cerca que juegan un papel en el mecanismo catalítico. [8] Esta región también se conserva en una GA bacteriana secuenciada recientemente. [9]
La estructura tridimensional del pseudotetrasacárido acarbosa complejado con glucoamilasa II (471) de Aspergillus awamori var. Se ha determinado que X100 tiene una resolución de 2,4 A. [10] La proteína pertenece principalmente a la clase alfa y contiene 19 hélices y 9 hebras .
Referencias
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y la predicción de un pliegue común para varias familias de glicosil hidrolasas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código Bibliográfico : 1995PNAS ... 92.7090H . doi : 10.1073 / pnas.92.15.7090 . PMC 41477 . PMID 7624375 .
- ^ Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de glicosil hidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9 . PMID 8535779 .
- ^ Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencia de glicosil hidrolasas" . La revista bioquímica . 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. doi : 10.1042 / bj3160695 . PMC 1217404 . PMID 8687420 .
- ^ "Inicio" . CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
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- ^ "Familia de glucósido hidrolasa 15" . CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
- ^ Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viva de enzimas activas en carbohidratos" (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093 / glycob / cwx089 . hdl : 21.11116 / 0000-0003-B7EB-6 . PMID 29040563 .
- ^ Sierks MR, Ford C, Reilly PJ, Svensson B (enero de 1990). "Mecanismo catalítico de la glucoamilasa fúngica definida por mutagénesis de Asp176, Glu179 y Glu180 en la enzima de Aspergillus awamori". Ingeniería de proteínas . 3 (3): 193–8. doi : 10.1093 / proteína / 3.3.193 . PMID 1970434 .
- ^ Ohnishi H, Kitamura H, Minowa T, Sakai H, Ohta T (julio de 1992). "Clonación molecular de un gen de glucoamilasa de un Clostridium termófilo y cinética de la enzima clonada". Revista europea de bioquímica . 207 (2): 413–8. doi : 10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17064.x . PMID 1633799 .
- ^ Aleshin AE, Firsov LM, Honzatko RB (junio de 1994). "Estructura refinada para el complejo de acarbosa con glucoamilasa de Aspergillus awamori var. X100 a resolución 2.4-A". La revista de química biológica . 269 (22): 15631–9. PMID 8195212 .