En bioinformática , The Green Non-Coding Database, GreeNC , es una base de datos biológica que actúa como un archivo de lncRNA de plantas y anotaciones. [1] Iniciada en 2015, la base de datos GreeNC proporciona información sobre la secuencia, las coordenadas del genoma , el potencial de codificación y la energía de plegado de los lncRNA . GreeNC incluye alrededor de 200.000 páginas con información sobre más de 190.000 transcripciones de 37 plantas y seis algas . Según Paytuví y colaboradores, [1] al usar la misma tubería para anotar lncRNAs GreeNC permite comparar secuencias y distribución de lncRNA de diferentes especies.
Contenido | |
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Descripción | anotación y secuencias de lncRNA de la planta |
Tipos de datos capturados | proporcionar una herramienta para la comunidad científica que pueda impulsar la investigación sobre lncRNAs |
Organismos | Plantas y algas |
Contacto | |
Centro de Investigación | Sequentia Biotech |
Autores | Andreu Paytuvi Gallart; Antonio Hermoso Pulido; Irantzu Anzar Martínez de Lagran; Walter Sanseverino; Riccardo Aiese Cigliano |
Cita primaria | doi : 10.1093 / nar / gkv1215 |
Fecha de lanzamiento | 2015 |
Acceso | |
Sitio web | http://greenc.sciencedesigners.com/wiki/Main_Page |
Referencias
- ↑ a b Paytuví Gallart, Andreu; Hermoso Pulido, Antonio; Anzar Martínez de Lagrán, Irantzu; Sanseverino, Walter; Aiese Cigliano, Riccardo (4 de enero de 2016). "GREENC: una base de datos basada en Wiki de lncRNAs de plantas" . Investigación de ácidos nucleicos . 44 (D1): D1161 – D1166. doi : 10.1093 / nar / gkv1215 . PMC 4702861 . PMID 26578586 .
enlaces externos
- Verde