El género Haemocystidium fue creado para dar nombre al hemoproteido de un gecko perteneciente al género Hemidactylus en Sri Lanka por Castellani y Willey en 1904. Una segunda especie de este género fue descrita en 1909 por Johnston y Cleland, quienes encontraron gametocitos pigmentados en el sangre de la tortuga australiana Chelodina longicollis . Estas especies fueron transferidas a Haemoproteus en 1926 por Wenyon.
El género fue resucitado por Garnham en 1966 cuando creó un nuevo nombre genérico, Simondia , para las hemoproteínas de los quelonios . Siguió las opiniones de Wenyon, Hewitt y DeGiusti y sugirió que todos estos parásitos pertenecían a una especie: Simondia metchnikovi . Conservó el nombre de Haemocystidium para los hemoproteidos de los lagartos .
Levine y Campbell en 1971 trasladaron todas las especies de Simondia y Haemocystidium a Haemoproteus , una opinión que fue seguida por autores posteriores.
El género Haemocystidium fue resucitado nuevamente por Telford en 1996 cuando describió tres nuevas especies de protozoos en geckos de Pakistán . [1]
Este género, como los de muchos protozoos, puede modificarse aún más una vez que estén disponibles secuencias de ADN adicionales.
Haemocystidium se distingue de Plasmodium por la ausencia de un ciclo asexual en las células sanguíneas circulantes .