Las células tienen generalmente alrededor de 10 μm de longitud, sin ningún caparazón o cubierta. Producen seudópodos filosos para capturar bacterias , pero no los utilizan para la locomoción, que suele tener lugar deslizándose por superficies.
La mayoría de los miembros tienen dos flagelos , [3] uno dirigido hacia adelante y otro que se arrastra debajo de la celda, insertados en ángulo recto cerca de su parte anterior. El núcleo está conectado a las bases flagelares y acompañado por un cuerpo paranuclear característico.
Los estudios genéticos ubican a las cercomonades entre los Cercozoa , [4] un grupo diverso de protozoos ameboides y flagelados. Se dividen en dos familias.
La clasificación de géneros y especies continúa en revisión. Se han fusionado algunos géneros, como Cercomonas y Cercobodo . Otros como Helkesistix , Sainouron y Cholamonas se han trasladado a Helkesida, [5] mientras que el resto de la familia Heteromitidae se ha trasladado a Glissomonadida . [6]