Human Proteinpedia es un portal para compartir e integrar datos proteómicos humanos. [1] [2] Permite a los laboratorios de investigación contribuir y mantener anotaciones de proteínas. La base de datos de referencia de proteínas humanas ( HPRD ) integra datos que se depositan en Human Proteinpedia junto con la información curada de la literatura existente en el contexto de una proteína individual. [3] [4] En esencia, los investigadores pueden agregar nuevos datos a HPRD registrándose en Human Proteinpedia. Los datos depositados en Human Proteinpedia están disponibles gratuitamente para su descarga. Enfatizando la importancia de la disposición de los datos proteómicos a los repositorios públicos, Nature Methods recomienda Human Proteinpedia en su editorial.[5] Más de 70 laboratorios participan en este esfuerzo.
Los datos relacionados con las modificaciones postraduccionales , las interacciones proteína-proteína , la expresión tisular, la expresión en líneas celulares , la localización subcelular y las relaciones entre el sustrato enzimático pueden enviarse a Human Proteinpedia.
Este portal que permite agregar información sobre proteínas fue desarrollado como un esfuerzo de colaboración entre el laboratorio del Dr. Akhilesh Pandey en la Universidad Johns Hopkins y el Instituto de Bioinformática.
No se permiten contribuciones anónimas. Los detalles del colaborador deben presentarse claramente al aportar datos.
No se permiten predicciones de ningún tipo. Los datos aportados deben obtenerse experimentalmente y deben ir acompañados de pruebas experimentales.
Los datos no están sujetos a revisión por pares y se deben proporcionar los datos experimentales reales (sin procesar o procesados).