Las células de los organismos eucariotas se subdividen minuciosamente en compartimentos unidos a la membrana funcionalmente distintos. Algunos de los componentes principales de las células eucariotas son: espacio extracelular , citoplasma , núcleo , mitocondrias , aparato de Golgi , retículo endoplásmico (RE), peroxisoma , vacuolas , citoesqueleto , nucleoplasma , nucleolo , matriz nuclear y ribosomas .
Las bacterias también tienen localizaciones subcelulares que pueden separarse cuando se fracciona la célula. Las localizaciones más comunes a las que se hace referencia incluyen el citoplasma , la membrana citoplasmática (también denominada membrana interna en las bacterias Gram negativas ), la pared celular (que suele ser más gruesa en las bacterias Gram positivas ) y el entorno extracelular . El citoplasma, la membrana citoplasmática y la pared celular son localizaciones subcelulares, mientras que el entorno extracelular claramente no lo es. La mayoría de las bacterias gramnegativas también contienen una membrana externa y un espacio periplásmico.. A diferencia de los eucariotas, la mayoría de las bacterias no contienen orgánulos unidos a la membrana, sin embargo, hay algunas excepciones (es decir, magnetosomas ). [1]
Bases de datos de ubicación subcelular de proteínas
Las ubicaciones subcelulares de proteínas determinadas experimentalmente se pueden encontrar en UniProtKB , Compartments y en algunos recursos más especializados, como la base de datos del secretoma bacteriano del ácido láctico .
También hay varias bases de datos de ubicación subcelular con predicciones computacionales , como la base de conocimiento del secretoma fúngico y el proteoma subcelular - versión 2 (FunSecKB2), la base de conocimiento del secretoma vegetal y del proteoma subcelular (PlantSecKB), MetazSecKB para ubicaciones subcelulares de proteínas de humanos y animales, y ProtSecKB para las ubicaciones subcelulares de proteínas de todos los protistas.
Ver también
Referencias
- ^ Schuler D. (2004). Análisis molecular de un compartimento subcelular: la membrana del magnetosoma en Magnetospirillum gryphiswaldense. Arch Microbiol. 181: 1-7