Los Hyphomicrobiales son un orden de Alphaproteobacteria Gram-negativas .
Hyphomicrobiales | |
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Agrobacterium (imagen SEM) | |
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Pedido: | Hyphomicrobiales Douglas 1957 (listas aprobadas 1980) |
Familias [1] | |
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Sinónimos [2] | |
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Los rizobios , que fijan nitrógeno y son simbióticos con las raíces de las plantas, aparecen en varias familias diferentes. Las cuatro familias Nitrobacteraceae , Hyphomicrobiaceae , phyllobacteriaceae , y Rhizobiaceae contienen al menos varios géneros de la fijación de nitrógeno, leguminosa-nodulante , bacterias microsymbiotic . Algunos ejemplos son los géneros Bradyrhizobium y Rhizobium . Las especies de Methylocystaceae son metanótrofos ; utilizan metanol (CH 3 OH) o metano(CH 4 ) como su única fuente de energía y carbono. Otros géneros importantes son los patógenos humanos Bartonella y Brucella , así como Agrobacterium (útil en ingeniería genética ).
Taxonomía
Familias aceptadas
- Aestuariivirgaceae Li et al . 2019
- Afifellaceae Hördt y col . 2020
- Ahrensiaceae Hördt et al . 2020
- Alsobacteraceae Sun et al . 2018
- Amorphaceae Hördt et al . 2020
- Ancalomicrobiaceae Dahal et al . 2018
- Aurantimonadaceae Hördt et al . 2020
- Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939 (Listas aprobadas 1980)
- Beijerinckiaceae Garrity et al . 2006
- Blastochloridaceae Hördt et al . 2020
- Boseaceae Hördt y col . 2020
- Breoghaniaceae Hördt et al . 2020
- Brucellaceae Breed y col . 1957 (listas aprobadas 1980)
- Chelatococcaceae Dedysh et al . 2016
- Cohaesibacteraceae Hwang y Cho 2008
- Devosiaceae Hördt et al . 2020
- Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950 (listas aprobadas 1980)
- Kaistiaceae Hördt y col . 2020
- Lichenibacteriaceae Pankratov et al . 2020
- Lichenihabitantaceae Noh et al . 2019
- Methylobacteriaceae Garrity et al . 2006
- Methylocystaceae Bowman 2006
- Nitrobacteraceae corrig. Buchanan 1917 (listas aprobadas 1980)
- Notoacmeibacteraceae Huang et al . 2017
- Parvibaculaceae Hördt et al . 2020
- Phreatobacteraceae Hördt et al . 2020
- Phyllobacteriaceae Mergaert y columpios 2006
- Pleomorphomonadaceae Hördt et al . 2020
- Pseudoxanthobacteraceae Hördt et al . 2020
- Rhabdaerophilaceae Ming et al . 2020
- Rhizobiaceae Conn 1938 (listas aprobadas 1980)
- Rhodobiaceae Garrity et al . 2006
- Roseiarcaceae Kulichevskaya et al . 2014
- Salinarimonadaceae Cole et al . 2018
- Segnochrobactraceae Akter et al . 2020
- Stappiaceae Hördt et al . 2020
- Tepidamorphaceae Hördt et al . 2020
- Xanthobacteraceae Lee et al . 2005
Géneros no asignados
El siguiente género no ha sido asignado a ninguna familia:
- Flaviflagellibacter Dong y col . 2019 [3]
TAXA PROVISIONAL
Estos taxones han sido publicados, pero no han sido validados según el Código Bacteriológico :
- " Nordella " La Scola et al . 2004 [4]
- " Propylenellaceae " Liu et al . 2021 [5]
- " Propylenella " Liu et al . 2021 [5]
- " Propylenella binzhouense " Liu et al . 2021 [5]
- " Propylenella " Liu et al . 2021 [5]
- " Thermopetrobacter " Sislak 2013 [6]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura [7] y la filogenia se basa en secuencias de genoma completo. [2] [a]
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Transformación genética natural
Se ha informado de transformación genética natural en al menos cuatro especies de Hyphomicrobiales : Agrobacterium tumefaciens , [8] Methylobacterium organophilum , [9] Ensifer adhaerens , [10] y Bradyrhizobium japonicum . [11] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio y la integración de la secuencia del donante en el genoma del receptor mediante recombinación homóloga .
Ver también
- Lar1
Notas
- ^ Aestuariivirgaceae , Alsobacteraceae , Ancalomicrobiaceae , Lichenibacteriaceae , Lichenihabitantaceae , Rhabdaerophilaceae y Segnochrobactraceae no se incluyen en este árbol filogenético.
- ^ Phyllobacterium está separado del resto de Phyllobacteriaceae .
- ^ Prosthecomicrobium está separado del resto de Hyphomicrobiaceae .
Referencias
- ^ Parker CT, Garrity GM (1 de enero de 2003). "Resumen taxonómico de las familias: Mabikibacteraceae ". Los resúmenes de NamesforLife . NamesforLife, LLC. doi : 10.1601 / tx.30673 .
- ^ a b Hördt A, López MG, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, et al. (2020). "El análisis de genomas de más de 1000 tipos de cepas mejora sustancialmente la clasificación taxonómica de Alphaproteobacteria " . Fronteras en microbiología . 11 : 468. doi : 10.3389 / fmicb.2020.00468 . PMC 7179689 . PMID 32373076 .
- ^ Dong L, Han MX, Wang D, Liu F, Asem MD, Jiao JY, Xiao M, Salam N, Li WJ. (2019). " Flaviflagellibacter deserti gen. Nov., Sp. Nov., Un miembro nuevo del orden Rhizobiales aislado de un suelo desértico". Antonie Van Leeuwenhoek . 112 : 947–954.Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ La Scola B, Barrassi L, Raoult D. (2004). "Una nueva alfa-Proteobacterium, Nordella oligomobilis gen. Nov., Sp. Nov., Aislado mediante el uso de co-cultivos de amebas". Res Microbiol . 155 : 47–51.Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ a b c Liu YL, Meng D, Wang F, Gong XF, Gu PF, Fan XY, Du ZJ, Zou JD, Li Q (2021). " Propylenella binzhouense gen. Nov., Sp. Nov. Aislado de lodos activados, y propuesta de Propylenellaceae fam. Nov". Antonie van Leeuwenhoek . 114 (3): 225–233. doi : 10.1007 / s10482-020-01514-2 . PMID 33400070 .
- ^ CD Sislak (2013). Nuevas bacterias termófilas aisladas de respiraderos hidrotermales marinos (MSc). Universidad Estatal de Portland. doi : 10.15760 / etd.1485 . 1486.
- ^ Euzéby JP, Parte AC. " Hyphomicrobiales " . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN) . Consultado el 15 de mayo de 2021 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ Demanèche S, Kay E, Gourbière F, Simonet P (junio de 2001). "Transformación natural de Pseudomonas fluorescens y Agrobacterium tumefaciens en suelo" . Microbiología aplicada y ambiental . 67 (6): 2617-21. doi : 10.1128 / AEM.67.6.2617-2621.2001 . PMC 92915 . PMID 11375171 .
- ^ O'Connor M, Wopat A, Hanson RS (enero de 1977). "Transformación genética en Methylobacterium organophilum" . Revista de Microbiología General . 98 (1): 265–72. doi : 10.1099 / 00221287-98-1-265 . PMID 401866 .
- ^ Zuniga-Soto E, Mullins E, Dedicova B (2015). "Transformación mediada por Ensifer: un protocolo eficiente no Agrobacterium para la modificación genética del arroz" . SpringerPlus . 4 : 600. doi : 10.1186 / s40064-015-1369-9 . PMC 4628045 . PMID 26543735 .
- ^ Raina JL, Modi VV (agosto de 1972). "Unión y transformación de desoxirribonucleados en Rhizobium jpaonicum" . Revista de bacteriología . 111 (2): 356–60. doi : 10.1128 / JB.111.2.356-360.1972 . PMC 251290 . PMID 4538250 .
Otras lecturas
- Kuykendall LD, Dazzo FB (2005). " Allorhizobium ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilonproteobacteria, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, NY. págs. 345–346. ISBN 978-0-387-24144-9.
- Kuykendall LD (2005). "Género Azorhizobium ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilonproteobacteria, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, NY. págs. 505–506. ISBN 978-0-387-24144-9.
- Kuykendall LD (2005). "Género Bradyrhizobium , familia Bradyrhizobiaceae ' ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilonproteobacteria, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, NY. págs. 438–443. ISBN 978-0-387-24144-9.
- Kuykendall LD, Young JM, Martínez-Romero, Kerr A, Sawada H (2005). "Género Rhizobium , un género muy divergente en una familia revisada". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilonproteobacteria, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, NY. págs. 324–340. ISBN 978-0-387-24144-9.
- Chen WX, Wang ET, Kuykendall LD (2005). "enus Mesorhizobium , familia Photobacteriaceae.". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilonproteobacteria, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, NY. págs. 403–408. ISBN 978-0-387-24144-9.