Afifella es un género del filo Proteobacteria ( Bacteria ). [4] [5] [6] Afifella se encuentra en entornos marinos y estuarinos, incluidas las esteras microbianas. [5] [3] [6] Son anaerobios, con un representante cultivado capaz de realizar la fotosíntesis.
El nombre genérico Afifella deriva de S. Afif, filósofo y pintor británico, en reconocimiento a su experiencia y orientación en el tema de la tendencia filosófica del estructuralismo, esencial para el desarrollo y comprensión de la taxonomía como ciencia. [7]
A. marina es un anaerobio que produce hidrógeno. [5] A. pfennigii es una célula móvil, en forma de varilla, con tinción de Gram negativa con una longitud de 1 a 2 μm y un ancho de 0,6 μm. [6] A. aestuarii es una bacteria fototrófica de color rosa, móvil, ovalada o con forma de bastón, tinción de Gram negativa, oxidasa positiva, catalasa negativa. [3]
Aislamiento
Las tres especies de Afifella se aislaron de las aguas costeras. A. marina se aisló de las esponjas marinas en la costa del Adriático. [5] A. pfennigii se aisló de una estera microbiana bentónica de un estanque salobre ubicado en el atolón de Rangiroa en las islas Tuamotu cerca de Australia. [6] A. aestuarii fue aislado de un estuario cerca de Pata, Gujarat, India. [3]
Cultura y crecimiento
Crecimiento de A. marina en un medio de rhodospirillaceae (DSMZ Medium 27), a 25 ° C, con 3% de NaCl, y es anaeróbico a la luz. [5] Crecimiento de A. pfennigii en un (DSMZ Medium 27), a 28 ° C, suplementado con 1% de NaCl y 0,15% de NaHCO 3 , y es anaeróbico a la luz. [6] A. aestuarii requiere tiamina para crecer y es el únicoaislado de Afifella capaz de modos de crecimiento fotolitoautotrófico, fotoorganoheterotrófico y quimioorganoheterotrófico. [3]
Secuenciación del genoma
A. marina se designa como cepa DSM 2698 T y tiene un contenido de GC del 63,8% en moles. [5] [3] A. pfennigii se designa como cepa DSM17143 T y tiene un contenido de GC de 63,8% en moles . [6] [3] A. aestuarii se designa como cepa JA968 T y tiene un contenido de GC de 63,5% en moles. Una comparación de las secuencias del gen 16rRNA mostró que lacepa JA968T de A. aestuarii era muy similar a lacepa DSM 2698 T de A. marina con una similitud del 99,9% y lacepa DSM17143 T de A. pfennigii con una similitud del 98,4%. [3]
Ver también
Taxonomía bacteriana
Microbiología
Referencias
^ Hördt A, García López M, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, Gronow A, Kyrpides NC, Woyke T, Göker M (2020). "El análisis de genomas de más de 1000 tipos de cepas mejora sustancialmente la clasificación taxonómica de Alphaproteobacteria " . Parte delantera. Microbiol . 11 : 468. doi : 10.3389 / fmicb.2020.00468 .
^ Urdiain M, López-López A, Gonzalo C, Busse HJ, Langer S, Kämpfer P, Rosselló-Móra R (2008). "Reclasificación de Rhodobium marinum y Rhodobium pfennigii como Afifella marina gen. Nov. Comb . Nov. Y Afifella pfennigii comb. Nov., Un nuevo género de Alphaproteobacteria fotoheterotrófica y descripciones enmendadas de Rhodobium , Rhodobium orientis y Rhodobium gokarnense ". Syst Appl Microbiol . 31 : 339–351.
^ a b c d e f g h i j Buddhi, Sailaja; G., Suresh; Gupta, Deepshikha; Ch., Sasikala; Ch. V., Ramana (2020). " Afifella aestuarii sp. Nov., Una bacteria fototrófica" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 70 (1): 327–333. doi : 10.1099 / ijsem.0.003756 . ISSN 1466-5026 . PMID 31592760 .
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^ a b c d e f g Reimer LC, Sarda Carbasse J, Podstawka A, Overmann J (29 de noviembre de 2019). " Afifella marina (Imhoff 1984) Urdiain et al. 2009 " . BacDive: información ligada a cepas sobre la biodiversidad de bacterias y arqueas . DSMZ . Consultado el 16 de septiembre de 2020 .
^ a b c d e f g h Reimer LC, Sarda Carbasse J, Podstawka A, Overmann J (29 de noviembre de 2019). " Afifella pfennigii (Caumette et al. 2007) Urdiain et al. 2009 " . BacDive: información ligada a cepas sobre la biodiversidad de bacterias y arqueas . DSMZ . Consultado el 16 de septiembre de 2020 .
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