Intelligent Systems for Molecular Biology ( ISMB ) es una conferencia académica anual sobre los temas de bioinformática y biología computacional organizada por la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB). El enfoque principal de la conferencia es el desarrollo y la aplicación de métodos computacionales avanzados para problemas biológicos. La conferencia se ha celebrado todos los años desde 1993 y ha crecido hasta convertirse en una de las reuniones más grandes y prestigiosas en estos campos, con más de 2.000 delegados en 2004. [1] [2]Desde la primera reunión, ISMB se ha realizado en lugares de todo el mundo; desde 2007, las reuniones se han realizado en Europa y América del Norte en años alternos. Desde 2004, se han celebrado reuniones europeas conjuntamente con la Conferencia Europea de Biología Computacional (ECCB).
Sistemas inteligentes para biología molecular | |
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Frecuencia | Anualmente |
Ubicación (es) | Praga , República Checa (2017) |
Años activos | 27 |
Evento anterior | ISMB 2016 |
Próximo evento | ISMB / ECCB 2017 |
Asistencia | 2000 [1] |
Organizado por | Teresa Przytycka, Pierre Baldi (presidentes 2016) |
Miembro | Sociedad Internacional de Biología Computacional |
Sitio web | www |
La conferencia principal de ISMB generalmente se lleva a cabo durante tres días y consta de presentaciones, sesiones de carteles y charlas magistrales . La mayoría de las presentaciones se dan en múltiples pistas paralelas; sin embargo, las conferencias magistrales se presentan en una sola pista y se eligen para reflejar una investigación destacada en bioinformática. Entre los oradores destacados de ISMB se han incluido ocho premios Nobel. Los ganadores del premio ISCB Overton y del premio ISCB Achievement by a Senior Scientist están invitados a dar charlas de apertura como parte del programa. Las actas de la conferencia se publican actualmente en la revista Bioinformatics .
Historia
Reuniones tempranas
Los orígenes de la conferencia ISMB se encuentran en un taller para investigadores de inteligencia artificial con interés en biología molecular que se llevó a cabo en noviembre de 1991. [3] El taller fue organizado por el investigador estadounidense Lawrence Hunter , entonces director del Proyecto de Aprendizaje Automático en el Instituto Nacional de Estados Unidos. institutos de la Salud 's Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) en Bethesda, Maryland . [4] Un taller posterior sobre el mismo tema celebrado en 1992, organizado por la NLM y la National Science Foundation , dejó en claro que se requería una conferencia internacional regular para el campo. Dicha conferencia estaría dedicada a la biología molecular como una aplicación emergente de la inteligencia artificial. [5] Habiendo solicitado con éxito subvenciones de AAAI , NIH y la Oficina de Salud e Investigación Ambiental del Departamento de Energía , la primera conferencia de ISMB se celebró en julio de 1993, en la NLM. La conferencia fue presidida por Hunter, David Searls (profesor asociado de investigación en la Universidad de Pennsylvania Escuela de Medicina ) y Jude Shavlik (profesor asistente de ciencias informáticas en la Universidad de Wisconsin-Madison ) y atrajo a más de 200 asistentes de 13 países, [4] la presentación 69 artículos científicos. [3]
El éxito de la primera conferencia motivó el anuncio de una segunda conferencia ISMB al final de la reunión. Inicialmente, se planeó que ISMB 1994 se llevara a cabo en Seattle . Sin embargo, una reunión en competencia obligó a ISMB a cambiar de lugar con poca antelación. La conferencia se llevó a cabo en la Universidad de Stanford en agosto de 1994 y fue organizada por Russ Altman , científico investigador de la Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford . [3] Para enfatizar el aspecto internacional de la conferencia, ISMB 1995 se llevó a cabo en Robinson College, Cambridge . ISMB 1995 también marcó un cambio en el enfoque de la conferencia. Alfonso Valencia, miembro de la Junta de ISCB y director del Instituto Nacional de Bioinformática de España, ha afirmado que, en 1995, "la conferencia pasó de ser una conferencia basada en la informática a un punto en el que todos se dieron cuenta de que, si se quiere progresar, es necesario más enfoque en biología ". [3]
Formación de ISCB y expansión
ISMB 1997 se celebró en Halkidiki , Grecia y marcó la fundación de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB). [5] ISCB se formó con un enfoque en la gestión de todos los aspectos científicos, organizativos y financieros de la conferencia ISMB y para proporcionar un foro para que los científicos aborden el papel emergente de las computadoras en las ciencias biológicas. ISCB ha ayudado a organizar la serie de conferencias ISMB desde 1998. [2] El período posterior a la formación de ISCB también marcó una expansión en el número de asistentes a ISMB: ISMB 2000 (celebrada en la Universidad de California, San Diego ) contó con la asistencia de más de 1.000 delegados, [1] presentando 141 artículos científicos. [3] Esta reunión también fue la última vez que ISMB se llevaría a cabo en una universidad, debido a limitaciones de tamaño. [1]
Asociación con ECCB
En 2004, ISMB se celebró conjuntamente con la Conferencia Europea de Biología Computacional por primera vez. La conferencia también se ubicó junto con la conferencia Genes, Proteins and Computers. Esta reunión, celebrada en Glasgow , Reino Unido , fue la conferencia de bioinformática más grande jamás celebrada, [6] a la que asistieron 2.136 delegados, que presentaron 496 artículos científicos. [7] Alfonso Valencia considera que ISMB / ECCB 2004 es un hito importante en la historia de ISMB: "fue el primero en el que el equilibrio entre Europa y Estados se convirtió en una parte importante de la conferencia. Fue aquí donde establecimos el las reglas y las formas y el espíritu de colaboración entre los estadounidenses y los europeos ". [3] El éxito de la conferencia conjunta allanó el camino para las futuras reuniones europeas del ISMB que se celebrarán conjuntamente con el ECCB. [3]
Reuniones recientes
A finales de 2006, ISCB atravesaba dificultades financieras. Dos conferencias (ISMB 2003, en Brisbane e ISMB 2006, en Fortaleza ) habían reducido drásticamente el número de participantes debido a su ubicación, con la correspondiente reducción en los ingresos. [8] Para permitir la asistencia de más delegados, se decidió limitar las ubicaciones de la conferencia a América del Norte y Europa. En enero de 2007, ISMB y ECCB acordaron celebrar conferencias conjuntas en Europa cada dos años, comenzando con ISMB / ECCB 2007. [2] ISMB se llevaría a cabo en América del Norte en los años entre reuniones conjuntas. A partir de 2016[actualizar], se ha confirmado que este patrón continuará hasta al menos 2019. ISMB / ECCB 2007 (celebrada en Viena , Austria ) marcó la primera conferencia cuya organización asumió la responsabilidad total de ISCB. [1] Viena se convirtió en la primera ciudad en albergar ISMB dos veces con ISMB / ECCB 2011. Esta "visita de regreso" fue un experimento destinado a reducir el esfuerzo creciente requerido para encontrar lugares adecuados para conferencias. Aunque el regreso a Viena solo se consideró parcialmente exitoso debido a los aumentos de precios, se prevé que Boston (que acogió ISMB 2010 y 2014) se convierta en un sitio "seguro" al que ISMB pueda regresar periódicamente. [1]
ISMB celebró su vigésima reunión con ISMB 2012, celebrada en Long Beach, California . Este evento atrajo a alrededor de 1.600 delegados, [1] que presentaron 268 artículos científicos. [3] Richard H. Lathrop y Lawrence Hunter presentaron una presentación especial de apertura, mirando hacia atrás en reuniones previas de ISMB e intentando predecir hacia dónde se dirigirá el campo de la bioinformática en el futuro. [9] ISMB / ECCB 2013 se celebró en Berlín , Alemania y contó con la asistencia de alrededor de 2.000 delegados que presentaron 233 artículos científicos. [10]
Formato
Conferencia principal
La conferencia principal de ISMB generalmente se lleva a cabo durante tres días y consta de presentaciones, sesiones de carteles y charlas magistrales . [1]
Los trabajos académicos en ISMB se presentaban tradicionalmente en una sola pista. [3] Las presentaciones en ISMB 1994 se dividieron en tres días temáticos, centrándose en la predicción de la estructura secundaria de proteínas , el análisis de secuencias y técnicas de IA y aplicaciones bioquímicas, respectivamente. [4] A medida que aumentó la asistencia a ISMB, el enfoque de vía única se volvió cada vez más insostenible y se introdujeron dos vías paralelas en ISMB / ECCB 2004. Una mayor expansión significó que, para ISMB 2012, se presentaron más de 200 charlas en nueve vías paralelas [1], incluyendo múltiples pistas de procedimientos , una pista de aspectos destacados y una pista de tecnología. La introducción de pistas paralelas a ISMB fue controvertida. Christopher Rawlings (jefe de Biología Computacional y de Sistemas en Rothamsted Research y organizador de ISMB 1995) ha dicho: "Había muchas personas que querían mantenerlo con más fuerza en el modelo de sistemas inteligentes de IA y tener una reunión a la que todos irían todo. Pero simplemente creció demasiado. Simplemente no pudimos ". [3] A medida que ha aumentado el número de documentos de procedimientos presentados, la tasa de aceptación ha disminuido drásticamente, del 75% en 1994 al 13% en 2012. [3] AAAI Press publicó los procedimientos de ISMB de 1993-2000 . Desde ISMB 2001, las actas se han publicado en la revista Bioinformatics . [11] [12] El número de carteles presentados en ISMB también ha aumentado drásticamente. Se presentaron 25 carteles en ISMB 1994; [4] en reuniones recientes de ISMB, se han presentado entre 500 y 1000 carteles en múltiples sesiones de carteles. [1]
Las charlas principales se presentan en una sola pista y generalmente atraen a la mayor audiencia. [2] Estas presentaciones se eligen para destacar investigaciones destacadas en el campo de la bioinformática . Entre los oradores principales del ISMB se encuentran ocho premios Nobel : Richard J. Roberts (orador principal en 1994, 2006), John Sulston (1995), Manfred Eigen (1999), Gerald Edelman (2000), Sydney Brenner (2003), Kurt Wüthrich ( 2006), Robert Huber (2006) y Michael Levitt (2015). [5] [13] [14]
A partir de 2012, ISMB tiene un presupuesto de más de $ 1.5M y, en términos de ingresos, genera cuatro veces más que las otras conferencias ISCB (ISCB-Latin America, ISCB-Africa , ISCB-Asia, Rocky Mountain Bioinformatics Conference, CSHALS y la Conferencia de Bioinformática de los Grandes Lagos) combinados. [1] Las tarifas de inscripción estándar (a partir de 2013) son de alrededor de $ 1,000 para académicos que son miembros de ISCB ($ 1,350 para no miembros), con tarifas más bajas para estudiantes y tarifas más altas para delegados corporativos, respectivamente. Se ofrecen descuentos por inscripción anticipada. [15]
Eventos satélite
Los tutoriales previos a la conferencia han jugado un papel importante en ISMB desde la primera conferencia. [2] Los tutoriales en ISMB 1994 incluyeron introducciones a algoritmos genéticos , redes neuronales , IA para biólogos moleculares y biología molecular para científicos informáticos. [4] En ISMB / ECCB 2013 se presentaron tutoriales sobre proteómica basada en espectrometría de masas computacional y acceso a datos ENCODE. [16]
A medida que la asistencia a ISMB creció a fines de la década de 1990, se formaron varias reuniones satélite y reuniones de grupos de interés especial (SIG) junto con la conferencia principal. Las reuniones del SIG se llevan a cabo uno o dos días antes de la conferencia principal y se centran en un tema específico, lo que permite una discusión más detallada de la que habría tiempo para la conferencia principal. [17] Entre las reuniones SIG destacadas se incluyen la Conferencia de código abierto sobre bioinformática (BOSC), que se celebra anualmente desde 2000 [18] y Bio-Ontologies, que se celebra anualmente desde 1998. [19] Las reuniones satélite suelen durar dos días y se llevan a cabo en conjunto con ISMB. La 12ª conferencia de CAMDA y la 9ª reunión de 3DSIG se celebraron como reuniones satélite de ISMB / ECCB 2013. [20] [21]
Lista de conferencias
Conferencia | Localización | Lugar de eventos | Notas |
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ISMB 1993 [22] | Bethesda , Estados Unidos | Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos | |
ISMB 1994 [23] | Stanford , Estados Unidos | Universidad Stanford | |
ISMB 1995 [24] | Cambridge , Reino Unido | Colegio Robinson, Cambridge | |
ISMB 1996 [25] | St. Louis , Estados Unidos | Universidad de Washington en St. Louis | |
ISMB 1997 [26] | Halkidiki , Grecia | Sithonia Beach Hotel, Porto Carras | |
ISMB 1998 [27] | Montreal , Canadá | Radisson Hotel des Gouverneurs | |
ISMB 1999 [28] | Heidelberg , alemania | Kongresshaus Stadthalle Heidelberg | |
ISMB 2000 [29] | San Diego , Estados Unidos | Universidad de California, San Diego | |
ISMB 2001 [30] | Copenhague , Dinamarca | Jardines de Tivoli ( sala de conciertos ) | |
ISMB 2002 [31] | Edmonton , Canadá | Centro de conferencias Shaw | |
ISMB 2003 [32] | Brisbane , Australia | Centro de exposiciones y convenciones de Brisbane | |
ISMB / ECCB 2004 [33] | Glasgow , Reino Unido | Centro de conferencias y exposiciones de Escocia | Primera reunión conjunta con ECCB . |
ISMB 2005 [34] | Detroit , Estados Unidos | Detroit Marriott en el Renaissance Center | |
ISMB 2006 [35] | Fortaleza , Brasil | Centro de convenciones de Fortaleza | |
ISMB / ECCB 2007 [36] | Viena , Austria | Centro Internacional de Viena | |
ISMB 2008 [37] | Toronto , canadá | Centro de convenciones de Toronto | |
ISMB / ECCB 2009 [38] | Estocolmo , Suecia | Ferias internacionales de Estocolmo | |
ISMB 2010 [39] | Boston , Estados Unidos | Centro de convenciones John B. Hynes Veterans Memorial | |
ISMB / ECCB 2011 [40] | Viena, Austria | Centro Internacional de Viena | Décima reunión del ECCB. |
ISMB 2012 [41] | Long Beach , Estados Unidos | Centro de convenciones y entretenimiento de Long Beach | 20ª reunión ISMB. |
ISMB / ECCB 2013 [42] | Berlín , alemania | Congreso Internacional Centrum Berlin | |
ISMB 2014 [43] | Boston, Estados Unidos | Centro de convenciones John B. Hynes Veterans Memorial | |
ISMB / ECCB 2015 [44] | Dublín , Irlanda | Centro de convenciones de Dublín | |
ISMB 2016 | Orlando , estados unidos | Centro de convenciones y hotel Swan and Dolphin de Walt Disney World | |
ISMB / ECCB 2017 [45] | Praga , República Checa | Centro de congresos de Praga [46] | 25ª reunión ISMB. |
ISMB 2018 [45] | Chicago , Estados Unidos | Hotel Hyatt Regency | |
ISMB / ECCB 2019 [47] | Basilea , Suiza | Centro de congresos de Basilea |
Eventos planificados
Conferencia | Localización | Lugar de eventos | Notas |
---|---|---|---|
ISMB 2020 | Montreal Canadá | Palais des congrès de Montréal | 12-16 de julio |
ISMB / ECCB 2021 | Lyon, Francia [48] | 25 al 29 de julio, 20ª reunión del ECCB. | |
ISMB 2022 | Madison, Wisconsin , Estados Unidos | 30ª reunión ISMB. | |
ISMB / ECCB 2023 | Liverpool, Reino Unido | 16-20 de julio |
Ver también
- Congreso Europeo de Biología Computacional (ECCB)
- Simposio del Pacífico sobre biocomputación (PSB)
- Investigación en Biología Molecular Computacional (RECOMB)
Referencias
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