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Larry Hunter
Larry hunter científico informático.jpg
Larry Hunter en 2002
Nacido
Lawrence E. Hunter

( 01/18/1961 )18 de enero de 1961 (60 años)
Estados Unidos
alma materUniversidad de Yale (PhD)
Conocido porSistemas inteligentes de biología molecular (ISMB)
Sociedad internacional de biología computacional (ISCB)
PremiosBecario ISCB (2010)
Carrera científica
CamposBiología Computacional
Inteligencia Artificial
Bioinformática [1]
InstitucionesFacultad de Medicina de la Universidad de Colorado Universidad
George Mason
TesisPlanificación de la adquisición de conocimientos: adquirir conocimientos a través de la experiencia  (1989)
Asesor de doctoradoRoger Schank [2]
Sitio webcompbio .ucdenver .edu / Hunter

Lawrence E. Hunter es profesor y director del Centro de Farmacología Computacional y del Programa de Biociencia Computacional de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colorado y profesor de Ciencias de la Computación en la Universidad de Colorado Boulder . [3] Es un erudito conocido internacionalmente, [1] [4] enfocado en biología computacional, extracción de información impulsada por el conocimiento de la literatura biomédica primaria, [5] la integración semánticade recursos de conocimiento en biología molecular, y el uso del conocimiento en el análisis de datos de alto rendimiento, así como por su trabajo fundacional en biología computacional, que condujo a la génesis de la principal organización profesional en el campo y dos conferencias internacionales. [6]

Educación [ editar ]

Hunter completó su doctorado en la Universidad de Yale en 1989 con una tesis sobre planificación de la adquisición de conocimientos: obtención de conocimientos a través de la experiencia , sobre el diagnóstico de cáncer de pulmón a partir de imágenes histológicas utilizando el razonamiento basado en casos , [7] bajo la dirección de Roger Schank . [2]

Carrera e investigación [ editar ]

Al enfrentarse a una elección entre carreras en las principales aplicaciones de la inteligencia artificial (programación de juegos y trabajo de defensa), Hunter decidió crear una nueva disciplina, la bioinformática . De 1989 a 2000, Hunter trabajó como informático y jefe de sección de las secciones de los Institutos Nacionales de Salud dedicadas a la investigación estadística y bioinformática. Fue miembro adjunto de la facultad en la Universidad George Mason de 1991 a 2000 [ cita requerida ] y profesor asociado en la Facultad de Medicina de Denver de la Universidad de Colorado de 2000 a 2008. Fue ascendido a profesor en 2008. [8]

ISCB [ editar ]

En 1997, Hunter fundó lo que se ha convertido en la organización profesional más grande en biología computacional y bioinformática , la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) . [9]

Conferencias [ editar ]

Hunter también fue fundador de tres exitosas conferencias internacionales en bioinformática, la Conferencia Internacional sobre Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB) y el Simposio del Pacífico sobre Biocomputación (PSB) [10] y la Conferencia de Bioinformática de las Montañas Rocosas. [11] También es coorganizador de la conferencia de visualización biológica Vizbi. [12] Hunter cofundó y fue miembro de la Junta Directiva de Molecular Mining Corporation de 1997 a 2003.

Premios, honores e influencia [ editar ]

Hunter es miembro del Colegio Americano de Informática Médica [ cita requerida ] [ ¿cuándo? ] y ganador del Premio Engelmore 2003 de Aplicaciones Innovadoras de la Inteligencia Artificial de la Asociación para el Avance de la Inteligencia Artificial (AAAI) . [ cita requerida ]

A Hunter se le atribuye ser uno de los fundadores del campo de la bioinformática . [ cita requerida ] A lo largo de su carrera, Hunter ha investigado y dirigido grupos de investigación que investigan el desarrollo y la aplicación de técnicas computacionales avanzadas para biomedicina a ensayos de alto rendimiento, en particular la aplicación de técnicas estadísticas y basadas en el conocimiento, en particular bio-ontologías, [13 ] al análisis de datos de alto rendimiento y de textos biomédicos. Ha propuesto modelos computacionales de cognición informados neurobiológicamente y evolutivamente, y cuestiones éticas relacionadas con la biociencia computacional. Ha abogado por la expansión de las actividades de ciencia de datos en biomedicina para incluir métodos basados ​​en el conocimiento.[14]

Se convirtió en miembro de ISCB en 2010. Otros premios y honores incluyen el Regent's Award for Scholarship and Technical Achievement 1994 [ cita requerida ] Meritorious Service Award, National Library of Medicine , 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1998 [ cita requerida ] Premio a la Excelencia en Investigación, Departamento de Farmacología de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colorado , 2007 [ cita requerida ] Premio a la Excelencia en la Enseñanza, Departamento de Medicina Preventiva y Biometría de la Facultad de Medicina de la Universidad de Colorado , 2004. [ cita requerida ]

Publicaciones [ editar ]

Las publicaciones seleccionadas incluyen:

  • Rindflesch, T .; Tanabe, L .; Weinstein, J .; Hunter, L. (2000). "EDGAR: Extracción de fármacos, genes y relaciones de la literatura biomédica" . Simposio del Pacífico sobre biocomputación : 517–528. doi : 10.1142 / 9789814447331_0049 . ISBN 978-981-02-4188-9. PMC  2709525 . PMID  10902199 .
  • Schank, RC; Collins, GC; Hunter, LE (1986). "Trascendiendo la formación de categorías inductivas en el aprendizaje". Ciencias del comportamiento y del cerebro . 9 (4): 639. doi : 10.1017 / S0140525X00051578 .
  • Rindflesch, TC; Rajan, JV; Hunter, L. (2000). "Extracción de relaciones de unión molecular a partir de texto biomédico" . Actas de la sexta conferencia sobre procesamiento del lenguaje natural aplicado - . págs. 188-195. doi : 10.3115 / 974147.974173 . S2CID  16166432 .
  • Planificación para aprender Las actas de la Duodécima Conferencia Anual de la Sociedad de Ciencias Cognitivas, Boston, MA., Julio de 1990, págs. 26–34, Lawrence Erlbaum Associates, Hillsdale, Nueva Jersey. pulg. [15]
  • Hunter, Lawrence (1993). Inteligencia artificial y biología molecular . Menlo Park, California: AAAI Press. ISBN 978-0-262-58115-8.
  • Baumgartner, WA; Cohen, KB; Fox, LM; Acquaah-Mensah, G .; Hunter, L. (2007). "La curación manual no es suficiente para la anotación de bases de datos genómicas" . Bioinformática . 23 (13): i41 – i48. doi : 10.1093 / bioinformatics / btm229 . PMC  2516305 . PMID  17646325 .
  • Hunter, L .; Lu, Z .; Firby, J .; Baumgartner Jr, WA; Johnson, HL; Ogren, PV; Cohen, KB (2008). "OpenDMAP: Un motor de análisis de conceptos de código abierto, impulsado por ontologías, con aplicaciones para capturar conocimiento sobre el transporte de proteínas, interacciones de proteínas y expresión génica específica de tipo celular" . BMC Bioinformática . 9 : 78. doi : 10.1186 / 1471-2105-9-78 . PMC  2275248 . PMID  18237434 .
  • Leach, SM; Tipney, H .; Feng, W .; Baumgartner, WA; Kasliwal, P .; Schuyler, RP; Williams, T .; Spritz, RA; Hunter, L. (2009). Miyano, Satoru (ed.). "Aceleración del descubrimiento biomédico, con aplicaciones al desarrollo craneofacial" . PLOS Biología Computacional . 5 (3): e1000215. Código Bibliográfico : 2009PLSCB ... 5E0215L . doi : 10.1371 / journal.pcbi.1000215 . PMC  2653649 . PMID  19325874 .
  • Hunter, Lawrence (2009). Los procesos de la vida: una introducción a la biología molecular . Cambridge, Massachusetts: MIT Press. ISBN 0-262-01305-3 . [8] 

Referencias [ editar ]

  1. ^ a b Publicaciones de Lawrence Hunter indexadas por Google Scholar
  2. ↑ a b Hunter, Lawrence E. (1989). Planificación de la adquisición de conocimientos: adquirir conocimientos a través de la experiencia (tesis doctoral). Universidad de Yale. hdl : 10079 / bibid / 9838922 . OCLC 24116492 . ProQuest 303852846 .  
  3. ^ "Lawrence Hunter, Ph.D." Compbio.ucdenver.edu . Consultado el 12 de abril de 2018 .
  4. ^ Lawrence Hunter en elservidor de bibliografía DBLP
  5. ^ Hunter, L .; Cohen, KB (2006). "Procesamiento del lenguaje biomédico: ¿Qué hay más allá de PubMed?" . Célula molecular . 21 (5): 589–594. doi : 10.1016 / j.molcel.2006.02.012 . PMC 1702322 . PMID 16507357 .  
  6. ^ "Un pionero con personalidad: Larry Hunter, fundador de la Sociedad Internacional de Biología Computacional". Bioinformatics World : 6. Otoño de 2002.
  7. ^ Gibson, Todd A. (2012). "Las raíces de la bioinformática en ISMB" . PLOS Biología Computacional . 8 (8): e1002679. Código Bibliográfico : 2012PLSCB ... 8E2679G . doi : 10.1371 / journal.pcbi.1002679 . PMC 3431341 . PMID 22952443 .  
  8. ↑ a b Hunter, Lawrence (2009). Los procesos de la vida: una introducción a la biología molecular . Cambridge, Massachusetts: MIT Press. ISBN 978-0-262-01305-5.
  9. ^ "Actas de la Sexta Conferencia Internacional sobre Sistemas Inteligentes para Biología Molecular. Montreal, Quebec, Canadá. 28 de junio al 1 de julio de 1998". Actas. Congreso Internacional de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular . 6 : 1–223. 1998. PMID 9867411 . 
  10. ^ "Actas de la 4ta Conferencia Internacional sobre Sistemas Inteligentes para Biología Molecular. ISMB-96". Actas. Congreso Internacional de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular . 4 : 1–262. 1996. PMID 9005023 . 
  11. ^ "Rocky 09 - ¡Bienvenido!" . Iscb.org . Consultado el 12 de abril de 2018 .
  12. ^ O'Donoghue, Sean. "VIZBI - Visualización de datos biológicos" . Vizbi.org . Consultado el 12 de abril de 2018 .
  13. ^ Livingston, Kevin M .; Bada, Michael; Baumgartner, William A .; Hunter, Lawrence E. (23 de abril de 2015). "KaBOB: integración semántica basada en ontología de bases de datos biomédicas" . BMC Bioinformática . 16 : 126. doi : 10.1186 / s12859-015-0559-3 . ISSN 1471-2105 . PMC 4448321 . PMID 25903923 .   
  14. ^ Hunter, Lawrence E. (2017). "Ciencia de datos biomédicos basada en el conocimiento" . EPJ Data Science . 1 (1-2): 19-25. doi : 10.3233 / DS-170001 . ISSN 2193-1127 . PMC 6171523 . PMID 30294517 .   
  15. ^ Leake, David B .; Ram, Ashwin (1995). Aprendizaje orientado a objetivos . Cambridge, Massachusetts: MIT Press. ISBN 978-0-262-18165-5.
Precedido por
Ninguno		Presidente de la
Sociedad Internacional de Biología Computacional
1997 - 2000		Sucedido por
Russ Altman