El Índice Internacional de Proteínas ( IPI ) es una base de datos de proteínas extinta lanzada en 2001 por el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI) y cerrada en 2011. Su propósito era proporcionar a la comunidad proteómica un recurso que permita
En su última versión, el IPI contenía los conjuntos de referencia completos para seis especies animales: Homo sapiens (humano), Mus musculus (ratón), Rattus norvegicus (rata), Bos taurus (ganado vacuno), Gallus gallus (pollo) y Danio rerio ( pez cebra); y una especie de planta: Arabidopsis thaliana (berro thale). Los conjuntos de datos de humanos, ratones y ratas fueron los primeros en desarrollarse, combinando información extraída de las bases de datos Swiss-Prot , TrEMBL , Ensembl y RefSeq . [1]
En 2001, cuando se lanzó el IPI, las bases de datos que catalogaban genes humanos variaban mucho y tenían pocos vínculos entre ellas. Desde entonces, se han producido muchos más datos dando una imagen más completa y las bases de datos han colaborado para sincronizar los datos. Actualmente, muchos organismos modelo tienen un conjunto de referencia de genes/proteínas que están catalogados en Ensembl / UniProt respectivamente, así como otras bases de datos específicas de especies. Debido a esta redundancia, el IPI se retiró en 2011. EBI aconsejó a los usuarios de sus servicios que emplearan los números de acceso de UniProtKB como sus identificadores de proteínas.