Si bien hay muchos puntos en común, las diferentes partes del árbol de la vida utilizan códigos genéticos ligeramente diferentes . [1] [2] Notablemente, los códigos mitocondriales varían.
Al traducir de genoma a proteína, el uso del código genético correcto es esencial.
- Tabla de traducción 1: el código estándar
- Tabla de traducción 2: El código mitocondrial de los vertebrados
- Tabla de traducción 3: El código mitocondrial de la levadura
- Tabla de traducción 4: El código mitocondrial de moho, protozoo y celentéreo y el código de micoplasma / espiroplasma
- Tabla de traducción 5: El código mitocondrial de invertebrados
- Tabla de traducción 6: El código nuclear ciliado, dasycladáceo y hexamita
- Tabla de traducción 7: El código de cinetoplasto ; cf . tabla 4.
- Tabla de traducción 8: cf . tabla 1.
- Tabla de traducción 9: El código mitocondrial del equinodermo y del gusano plano
- Tabla de traducción 10: El código nuclear de la euplótida
- Tabla de traducción 11: El código de plastidios bacterianos, arqueales y vegetales
- Tabla de traducción 12: El código nuclear de levadura alternativo
- Tabla de traducción 13: El código mitocondrial ascidiano
- Tabla de traducción 14: El código mitocondrial alternativo del gusano plano
- Tabla de traducción 15: El código nuclear Blepharisma [3] [4]
- Tabla de traducción 16: El código mitocondrial clorofíceo
- Tabla de traducción 21: El código mitocondrial de los trematodos
- Tabla de traducción 22: El código mitocondrial del Scenedesmus obliquus
- Tabla de traducción 23: El código mitocondrial de Thraustochytrium
- Tabla de traducción 24: El código mitocondrial de Pterobranchia
- Tabla de traducción 25: La división candidata SR1 y el código de gracilibacterias
- Tabla de traducción 26: El código nuclear de Pachysolen tannophilus
- Tabla de traducción 27: El código nuclear karyorelict
- Tabla de traducción 28: El código nuclear del condilostoma
- Tabla de traducción 29: El código nuclear del mesodinio
- Tabla de traducción 30: El código nuclear de Peritrich
- Tabla de traducción 31: El código nuclear de Blastocrithidia
- Tabla de traducción 32: Código de plastidios de Balanophoraceae [5] [6]
- Tabla de traducción 33: El código mitocondrial de Cephalodiscidae
Las tablas de traducción alternativa (2 a 33) implican reasignaciones de codones que se recapitulan en la lista de todos los codones alternativos conocidos .
Comparación de tablas de traducción alternativas para todos los codones (utilizando códigos de aminoácidos IUPAC ):
Propiedades bioquímicas de los aminoácidos | No polar | Polar | Básico | Ácido | Terminación: codón de parada * |
Codón | ID de tabla de traducción (ver arriba) | ||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | dieciséis | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | |
TTT | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
TTC | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
TTA | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | * | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
TTG | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
TCT | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TCC | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TCA | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | * | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
TCG | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
HACER ENCAJE | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
TAC | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
TAA | * | * | * | * | * | Q | * | * | * | * | * | Y | * | * | * | * | * | * | * | * | Q | Q | Y | mi | mi | * | Y |
ETIQUETA | * | * | * | * | * | Q | * | * | * | * | * | * | Q | L | * | L | * | * | * | * | Q | Q | Y | mi | mi | W | * |
TGT | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C |
TGC | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C |
TGA | * | W | W | W | W | * | W | C | * | * | W | W | * | * | W | * | * | W | GRAMO | * | W | W | * | * | W | * | W |
TGG | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W | W |
CTT | L | L | T | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
CTC | L | L | T | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
CTA | L | L | T | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L | L |
CTG | L | L | T | L | L | L | L | L | L | S | L | L | L | L | L | L | L | L | L | A | L | L | L | L | L | L | L |
CCT | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG |
CCC | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG |
CCA | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG |
CCG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG | PAG |
GATO | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H |
CAC | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H | H |
CAA | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q |
CAG | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q | Q |
CGT | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
CGC | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
CGA | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
CGG | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
ATT | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I |
ATC | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I |
ATA | I | METRO | METRO | I | METRO | I | I | I | I | I | METRO | I | I | I | METRO | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I |
ATG | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO | METRO |
ACTUAR | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
ACC | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
ACA | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
ACG | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
AAT | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte |
CAA | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte | norte |
AAA | K | K | K | K | K | K | norte | K | K | K | K | norte | K | K | norte | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K |
AAG | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K | K |
AGT | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
AGC | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
AGA | R | * | R | R | S | R | S | R | R | R | GRAMO | S | R | R | S | R | R | S | R | R | R | R | R | R | R | R | S |
AGG | R | * | R | R | S | R | S | R | R | R | GRAMO | S | R | R | S | R | R | K | R | R | R | R | R | R | R | R | K |
GTT | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GTC | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GTA | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GTG | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
GCT | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GCC | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GCA | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
GCG | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A |
REVÓLVER | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D |
GAC | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D |
GAA | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi |
MORDAZA | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi | mi |
GGT | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO |
GGC | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO |
GGA | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO |
GGG | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO | GRAMO |
Notas
Tres tablas de traducción tienen un estado peculiar:
- La tabla 7 ahora se fusiona con la tabla de traducción 4.
- La tabla 8 se fusiona con la tabla 1; todas las diferencias de cloroplasto vegetal debido a la edición de ARN.
- La tabla 15 se elimina en la fuente, pero se incluye aquí para que esté completa.
Otros mecanismos también juegan un papel en la biosíntesis de proteínas , como la modificación postranscripcional .
Referencias
- ^ Elzanowski, Andrzej; Jim Ostell (7 de julio de 2010). "Los códigos genéticos" . Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 6 de mayo de 2013 .
- ^ Watanabe, Kimitsuna; Suzuki, Tsutomu (2001). "Código genético y sus variantes". Enciclopedia de Ciencias de la Vida . doi : 10.1038 / npg.els.0000810 . ISBN 047001590X.
- ^ "Página de inicio de taxonomía de NCBI" .
- ^ "Los códigos genéticos" .
- ^ "Tabla de código genético NCBI" .
- ^ Su, Huei-Jiun; Barkman, Todd J .; Hao, Weilong; Jones, Samuel S .; Naumann, Julia; Skippington, Elizabeth; Wafula, Eric K .; Hu, Jer-Ming; Palmer, Jeffrey D .; DePamphilis, Claude W. (15 de enero de 2019). "Nuevo código genético y riqueza de AT récord en el genoma de plastidios altamente reducido de la planta holoparásita Balanophora" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 116 (3): 934–943. doi : 10.1073 / pnas.1816822116 .
Ver también
- Códigos genéticos: lista de codones alternativos
enlaces externos
- Stefanie Gabriele Sammet; Ugo Bastolla y Markus Porto (14 de junio de 2010). "Comparación de cargas de traducción para códigos genéticos estándar y alternativos" . BMC Evol Biol . 10 (178): 178. doi : 10.1186 / 1471-2148-10-178 . PMC 2909233 . PMID 20546599 .
- Liliana Torcoroma García; Ney Ribeiro Leite; Juan D Alfonzo; Otavio Henrique Thiemann (31 de julio de 2007). "Efectos del silenciamiento de sintetasas de triptófanil-tRNA de Trypanosoma brucei por interferencia de ARN" . Mem. Inst. Oswaldo Cruz . Rio de Janeiro. 102 (6).Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )