El código mitocondrial ascidiano (tabla de traducción 13 ) es un código genético que se encuentra en las mitocondrias de Ascidia .
Código
AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSGGVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M------------------------------MM---------------M------------
Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Bases: adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T) o uracilo (U).
Aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina (Gln , Q), glicina (Gly, G), histidina (His, H), isoleucina (Ile, I), leucina (Leu, L), lisina (Lys, K), metionina (Met, M), fenilalanina (Phe, F), prolina (Pro, P), serina (Ser, S), treonina (Thr, T), triptófano (Trp, W), tirosina (Tyr, Y), valina (Val, V)
Diferencias del código estándar
Codones de ADN | Codones de ARN | Este código (13) | Código estándar (1) | |
---|---|---|---|---|
AGA | AGA | Gly (G) | Arg (R) | |
AGG | AGG | Gly (G) | Arg (R) | |
ATA | AUA | Se reunió (M) | Ile (yo) | |
TGA | UGA | Trp (W) | PARAR = Ter (*) |
Alcance y comentarios sistemáticos
Existe evidencia de una muestra filogenéticamente diversa de tunicados ( Urochordata ) que AGA y AGG codifican para glicina . En otros organismos, AGA / AGG codifican arginina o serina y en las mitocondrias de vertebrados codifican una PARADA. La evidencia de la traducción de la glicina de AGA / AGG se encontró por primera vez en 1993 en Pyura stolonifera [1] y Halocynthia roretzi . [2] Luego se confirmó mediante la secuenciación del tRNA [3] y la secuenciación de genomas mitocondriales completos. [4] [5]
Codones de iniciación alternativos
- ATA, GTG y TTG [5]
- ATT es el codón de inicio del gen CytB en Halocynthia roretzi . [6]
Ver también
Referencias
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público . [7]
- ^ Durrheim GA, Corfield VA, Harley EH, Ricketts MH (1993). "Secuencia de nucleótidos de la citocromo oxidasa (subunidad III) de la mitocondria del tunicado Pyura stolonifera : evidencia de que AGR codifica glicina" . Investigación de ácidos nucleicos . 21 (15): 3587–8. doi : 10.1093 / nar / 21.15.3587 . PMC 331473 . PMID 8393993 .
- ^ Yokobori S, Ueda T, Watanabe K (enero de 1993). "Los codones AGA y AGG se leen como glicina en las mitocondrias ascidianas". Revista de evolución molecular . 36 (1): 1–8. Código bibliográfico : 1993JMolE..36 .... 1Y . doi : 10.1007 / bf02407301 . PMID 8381878 . S2CID 12603691 .
- ^ Kondow A, Suzuki T, Yokobori S, Ueda T, Watanabe K (junio de 1999). "Un tRNAGly adicional (U * CU) que se encuentra en las mitocondrias ascidianas responsable de decodificar los codones no universales AGA / AGG como glicina" . Investigación de ácidos nucleicos . 27 (12): 2554–9. doi : 10.1093 / nar / 27.12.2554 . PMC 148460 . PMID 10352185 .
- ^ Yokobori S, Ueda T, Feldmaier-Fuchs G, Pääbo S, Ueshima R, Kondow A, Nishikawa K, Watanabe K (diciembre de 1999). "Secuencia completa de ADN del genoma mitocondrial de la ascidia Halocynthia roretzi (Chordata, Urochordata)" . Genética . 153 (4): 1851–62. doi : 10.1093 / genetics / 153.4.1851 . PMC 1460873 . PMID 10581290 .
- ^ a b Yokobori S, Watanabe Y, Oshima T (noviembre de 2003). "Genoma mitocondrial de Ciona savignyi (Urochordata, Ascidiacea, Enterogona): comparación de la disposición de genes y genes de tRNA con genoma mitocondrial de Halocynthia roretzi " . Revista de evolución molecular . 57 (5): 574–87. Código bibliográfico : 2003JMolE..57..574Y . doi : 10.1007 / s00239-003-2511-9 . PMID 14738316 . S2CID 19474615 .
- ^ Gissi C, Pesole G (2003). "Mapeo de transcripción y anotación del genoma de ADNmt de ascidia usando datos EST" . Investigación del genoma . 13 (9): 2203–12. doi : 10.1101 / gr.1227803 . PMC 403730 . PMID 12915488 .
- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "Los códigos genéticos" . Navegador de taxonomía . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . Consultado el 5 de junio de 2016 .