Se puede usar una tabla de codones para traducir un código genético en una secuencia de aminoácidos . [1] [2] El código genético estándar se representa tradicionalmente como una tabla de codones de ARN , porque cuando las proteínas son producidas en una célula por los ribosomas , es el ARN mensajero el que dirige la biosíntesis de proteínas . [2] [3] La secuencia de ARNm está determinada por la secuencia de ADN genómico . [4] En tal contexto, el código genético estándar se denomina tabla de traducción 1. [3]También se puede representar en una tabla de codones de ADN. Los codones de ADN en tales tablas se encuentran en la hebra de ADN sentido y están dispuestos en una dirección de 5 'a 3' . [5] Se utilizan diferentes tablas con codones alternos dependiendo de la fuente del código genético, como del núcleo celular , mitocondria , plastidio o hidrogenosoma . [6]
![](http://wikiimg.tojsiabtv.com/wikipedia/commons/thumb/6/6d/Genetic_code_by_Jian-Jun_SHU.jpg/440px-Genetic_code_by_Jian-Jun_SHU.jpg)
Hay 64 codones diferentes en el código genético y en las tablas siguientes; la mayoría especifica un aminoácido. [7] Tres secuencias, UAG, UGA y UAA, conocidas como codones de terminación , [nota 1] no codifican un aminoácido, sino que señalan la liberación del polipéptido naciente del ribosoma. [8] En el código estándar, la secuencia AUG (leída como metionina) puede servir como un codón de inicio y, junto con secuencias como un factor de iniciación , inicia la traducción. [3] [9] [10] En raras ocasiones, los codones de inicio en el código estándar también pueden incluir GUG o UUG; estos codones normalmente representan valina y leucina , respectivamente, pero como codones de inicio se traducen como metionina o formilmetionina . [3] [10]
La primera tabla, la tabla estándar, se puede utilizar para traducir tripletes de nucleótidos en el aminoácido correspondiente o en la señal apropiada si se trata de un codón de inicio o de parada. La segunda tabla, apropiadamente llamada inversa, hace lo contrario: se puede usar para deducir un posible código triplete si se conoce el aminoácido. Como múltiples codones pueden codificar el mismo aminoácido, en algunos casos se proporciona la notación de ácido nucleico de la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC) .
Tabla de traducción 1
Tabla de codones de ARN estándar
Propiedades bioquímicas de los aminoácidos | No polar ![]() | Polar ![]() | Básico ![]() | Ácido ↓ | Terminación: codón de parada * | Iniciación: posible codón de inicio ![]() |
1ra base | 2da base | 3ra base | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
U | C | A | GRAMO | ||||||
U | UUU | (Phe / F) Fenilalanina![]() | UCU | (Ser / S) Serina![]() | UAU | (Tyr / Y) Tirosina![]() | UGU | (Cys / C) Cisteína![]() | U |
UUC | UCC | UAC | CGU | C | |||||
UUA | (Leu / L) Leucina![]() | UCA | UAA | Detener ( Ocre ) * [nota 2] | UGA | Detener ( Opal ) * [nota 2] | A | ||
UUG ![]() | UCG | UAG | Detener ( ámbar ) * [nota 2] | UGG | (Trp / W) Triptófano![]() | GRAMO | |||
C | CUU | CCU | (Pro / P) Prolina![]() | CAU | (His / H) Histidina![]() | CGU | (Arg / R) Arginina![]() | U | |
CUC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CUA | CCA | CAA | (Gln / Q) Glutamina![]() | CGA | A | ||||
CUG | CCG | CAG | CGG | GRAMO | |||||
A | AUU | (Ile / I) Isoleucina![]() | ACU | (Thr / T) Treonina![]() | AAU | (Asn / N) Asparagina![]() | AGU | (Ser / S) Serina![]() | U |
AUC | ACC | CAA | AGC | C | |||||
AUA | ACA | AAA | (Lys / K) Lisina![]() | AGA | (Arg / R) Arginina![]() | A | |||
AGO ![]() | (Met / M) Metionina![]() | ACG | AAG | AGG | GRAMO | ||||
GRAMO | GUU | (Val / V) Valina![]() | GCU | (Ala / A) Alanina![]() | GAU | (Asp / D) Ácido aspártico ↓ | GGU | (Gly / G) Glicina![]() | U |
GUC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GUA | GCA | GAA | (Glu / E) Ácido glutámico ↓ | GGA | A | ||||
GUG ![]() | GCG | MORDAZA | GGG | GRAMO |
Tabla de codones de ARN inverso
Aminoácidos | Codones de ARN | Comprimido | Aminoácidos | Codones de ARN | Comprimido | |
---|---|---|---|---|---|---|
Ala, A | GCU, GCC, GCA, GCG | GCN | Ile, yo | AUU, AUC, AUA | AUH | |
Arg, R | CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; o CGY, MGR | Leu, L | CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG | CUN, UUR; o CUY, YUR | |
Asn, N | AAU, AAC | AAY | Lys, K | AAA, AAG | AAR | |
Asp, D | GAU, GAC | Gay | Conocido, M | AGO | ||
Asn o Asp, B | AAU, AAC; GAU, GAC | RAYO | Phe, F | UUU, UUC | UUY | |
Cys, C | UGU, UGC | UGY | Pro, P | CCU, CCC, CCA, CCG | CCN | |
Gln, Q | CAA, CAG | CARRO | Ser, S | UCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC | UCN, EDAD | |
Pegamento | GAA, GAG | GAR | Thr, T | ACU, ACC, ACA, ACG | ACN | |
Gln o Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | SAR | Trp, W | UGG | ||
Gly, G | GGU, GGC, GGA, GGG | GGN | Tyr, Y | UAU, UAC | UAY | |
Su, H | CAU, CAC | ISLA PEQUEÑA | Val, V | GUU, GUC, GUA, GUG | PISTOLA | |
COMIENZO | AGO | DETENER | UAA, UGA, UAG | URA, UAR |
Tabla de codones de ADN estándar
Propiedades bioquímicas de los aminoácidos | No polar ![]() | Polar ![]() | Básico ![]() | Ácido ↓ | Terminación: codón de parada * | Iniciación: posible codón de inicio ![]() |
1ra base | 2da base | 3ra base | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T | C | A | GRAMO | ||||||
T | TTT | (Phe / F) Fenilalanina![]() | TCT | (Ser / S) Serina![]() | HACER ENCAJE | (Tyr / Y) Tirosina![]() | TGT | (Cys / C) Cisteína![]() | T |
TTC | TCC | TAC | TGC | C | |||||
TTA | (Leu / L) Leucina![]() | TCA | TAA | Detener ( Ocre ) * [nota 2] | TGA | Detener ( Opal ) * [nota 2] | A | ||
TTG ![]() | TCG | ETIQUETA | Detener ( ámbar ) * [nota 2] | TGG | (Trp / W) Triptófano![]() | GRAMO | |||
C | CTT | CCT | (Pro / P) Prolina![]() | GATO | (His / H) Histidina![]() | CGT | (Arg / R) Arginina![]() | T | |
CTC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CTA | CCA | CAA | (Gln / Q) Glutamina![]() | CGA | A | ||||
CTG | CCG | CAG | CGG | GRAMO | |||||
A | ATT | (Ile / I) Isoleucina![]() | ACTUAR | (Thr / T) Treonina![]() | AAT | (Asn / N) Asparagina![]() | AGT | (Ser / S) Serina![]() | T |
ATC | ACC | CAA | AGC | C | |||||
ATA | ACA | AAA | (Lys / K) Lisina![]() | AGA | (Arg / R) Arginina![]() | A | |||
ATG ![]() | (Met / M) Metionina![]() | ACG | AAG | AGG | GRAMO | ||||
GRAMO | GTT | (Val / V) Valina![]() | GCT | (Ala / A) Alanina![]() | REVÓLVER | (Asp / D) Ácido aspártico ↓ | GGT | (Gly / G) Glicina![]() | T |
GTC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GTA | GCA | GAA | (Glu / E) Ácido glutámico ↓ | GGA | A | ||||
GTG ![]() | GCG | MORDAZA | GGG | GRAMO |
Tabla de codones de ADN inverso
Aminoácidos | Codones de ADN | Comprimido | Aminoácidos | Codones de ADN | Comprimido | |
---|---|---|---|---|---|---|
Ala, A | GCT, GCC, GCA, GCG | GCN | Ile, yo | ATT, ATC, ATA | ATH | |
Arg, R | CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; o CGY, MGR | Leu, L | CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTG | CTN, TTR; o CTY, YTR | |
Asn, N | AAT, AAC | AAY | Lys, K | AAA, AAG | AAR | |
Asp, D | GAT, GAC | Gay | Conocido, M | ATG | ||
Asn o Asp, B | AAT, AAC; GAT, GAC | RAYO | Phe, F | TTT, TTC | TTY | |
Cys, C | TGT, TGC | TGY | Pro, P | CCT, CCC, CCA, CCG | CCN | |
Gln, Q | CAA, CAG | CARRO | Ser, S | TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC | TCN, EDAD | |
Pegamento | GAA, GAG | GAR | Thr, T | ACT, ACC, ACA, ACG | ACN | |
Gln o Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | SAR | Trp, W | TGG | ||
Gly, G | GGT, GGC, GGA, GGG | GGN | Tyr, Y | TAT, TAC | TAY | |
Su, H | GATO, CAC | ISLA PEQUEÑA | Val, V | GTT, GTC, GTA, GTG | GTN | |
COMIENZO | ATG | DETENER | TAA, TGA, TAG | TRA, TAR |
Codones alternativos en otras tablas de traducción
Alguna vez se creyó que el código genético era universal: [17] un codón codificaría el mismo aminoácido independientemente del organismo o la fuente. Sin embargo, ahora se acepta que el código genético evoluciona, [18] resultando en discrepancias en cómo se traduce un codón dependiendo de la fuente genética. [17] [18] Por ejemplo, en 1981, se descubrió que el uso de los codones AUA, UGA, AGA y AGG por el sistema de codificación en las mitocondrias de mamíferos difería del código universal. [17] Los codones de parada también pueden verse afectados: en los protozoos ciliados , los codones de parada universales UAA y UAG codifican la glutamina. [18] [nota 4] La siguiente tabla muestra estos codones alternativos.
Propiedades bioquímicas de los aminoácidos | No polar ![]() | Polar ![]() | Básico ![]() | Ácido ↓ | Terminación: codón de parada * |
Código | Tabla de traducción | Codón de ADN involucrado | Codón de ARN involucrado | Traducción con este código | Traducción estándar | Notas | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Estándar | 1 | Incluye tabla de traducción 8 ( cloroplastos de plantas ). | ||||||
Mitocondrial de vertebrados | 2 | AGA | AGA | Detener * | Arg (R) ![]() | |||
AGG | AGG | Detener * | Arg (R) ![]() | |||||
ATA | AUA | Se reunió (M) ![]() | Ile (yo) ![]() | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
Levadura mitocondrial | 3 | ATA | AUA | Se reunió (M) ![]() | Ile (yo) ![]() | |||
CTT | CUU | Thr (T) ![]() | Leu (L) ![]() | |||||
CTC | CUC | Thr (T) ![]() | Leu (L) ![]() | |||||
CTA | CUA | Thr (T) ![]() | Leu (L) ![]() | |||||
CTG | CUG | Thr (T) ![]() | Leu (L) ![]() | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
CGA | CGA | ausente | Arg (R) ![]() | |||||
CGC | CGC | ausente | Arg (R) ![]() | |||||
Moho, protozoos y celentéreos mitocondriales + Mycoplasma / Spiroplasma | 4 | TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | Incluye la tabla de traducción 7 ( cinetoplasto ). | ||
Mitocondrial de invertebrados | 5 | AGA | AGA | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||
AGG | AGG | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
ATA | AUA | Se reunió (M) ![]() | Ile (yo) ![]() | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
Ciliate, dasycladacean y Hexamita nuclear | 6 | TAA | UAA | Gln (Q) ![]() | Detener * | |||
ETIQUETA | UAG | Gln (Q) ![]() | Detener * | |||||
Equinodermo y gusano plano mitocondrial | 9 | AAA | AAA | Asn (N) ![]() | Lys (K) ![]() | |||
AGA | AGA | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
AGG | AGG | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
Euplotid nuclear | 10 | TGA | UGA | Cys (C) ![]() | Detener * | |||
Plástido bacteriano, arqueal y vegetal | 11 | Ver tabla de traducción 1 . | ||||||
Levadura alternativa nuclear | 12 | CTG | CUG | Ser (S) ![]() | Leu (L) ![]() | |||
Mitocondrial ascidiana | 13 | AGA | AGA | Gly (G) ![]() | Arg (R) ![]() | |||
AGG | AGG | Gly (G) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
ATA | AUA | Se reunió (M) ![]() | Ile (yo) ![]() | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
Mitocondrial de gusano plano alternativo | 14 | AAA | AAA | Asn (N) ![]() | Lys (K) ![]() | |||
AGA | AGA | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
AGG | AGG | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
TAA | UAA | Tyr (Y) ![]() | Detener * | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
Blefarisma nuclear | 15 | ETIQUETA | UAG | Gln (Q) ![]() | Detener * | Al 18 de noviembre de 2016: ausente de la actualización del NCBI. Similar a la tabla de traducción 6 . | ||
Mitocondrial clorofícea | dieciséis | ETIQUETA | UAG | Leu (L) ![]() | Detener * | |||
Trematodo mitocondrial | 21 | TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||
ATA | AUA | Se reunió (M) ![]() | Ile (yo) ![]() | |||||
AGA | AGA | Ser (S) | Arg (R) ![]() | |||||
AGG | AGG | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
AAA | AAA | Asn (N) ![]() | Lys (K) ![]() | |||||
Scenedesmus obliquus mitocondrial | 22 | TCA | UCA | Detener * | Ser (S) ![]() | |||
ETIQUETA | UAG | Leu (L) ![]() | Detener * | |||||
Thraustochytrium mitocondrial | 23 | TTA | UUA | Detener * | Leu (L) ![]() | Similar a la tabla de traducción 11 . | ||
Pterobranchia mitocondrial | 24 | AGA | AGA | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | |||
AGG | AGG | Lys (K) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
División candidata SR1 y Gracilibacteria | 25 | TGA | UGA | Gly (G) ![]() | Detener * | |||
Pachysolen tannophilus nuclear | 26 | CTG | CUG | Ala (A) ![]() | Leu (L) ![]() | |||
Cariorrelicto nuclear | 27 | TAA | UAA | Gln (Q) ![]() | Detener * | |||
ETIQUETA | UAG | Gln (Q) ![]() | Detener * | |||||
TG | UGA | Detener * | o | Trp (W) ![]() | Detener * | |||
Condilostoma nuclear | 28 | TAA | UAA | Detener * | o | Gln (Q) ![]() | Detener * | |
ETIQUETA | UAG | Detener * | o | Gln (Q) ![]() | Detener * | |||
TGA | UGA | Detener * | o | Trp (W) ![]() | Detener * | |||
Mesodinio nuclear | 29 | TAA | UAA | Tyr (Y) ![]() | Detener * | |||
ETIQUETA | UAG | Tyr (Y) ![]() | Detener * | |||||
Peritrich nuclear | 30 | ejército de reserva | UAA | Glu (E) ↓ | Detener * | |||
ETIQUETA | UAG | Glu (E) ↓ | Detener * | |||||
Blastocritidios nucleares | 31 | TAA | UAA | Detener * | o | Glu (E) ↓ | Detener * | |
ETIQUETA | UAG | Detener * | o | Glu (E) ↓ | Detener * | |||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * | |||||
Código mitocondrial cephalodiscidae | 33 | AGA | AGA | Ser (S) ![]() | Arg (R) ![]() | Similar a la tabla de traducción 24 . | ||
AGG | AGG | Lys (K) ![]() | Arg (R) ![]() | |||||
TAA | UAA | Tyr (Y) ![]() | Detener * | |||||
TGA | UGA | Trp (W) ![]() | Detener * |
Ver también
- Bioinformática
- Lista de códigos genéticos
Notas
- ^ Cada codón de parada tiene un nombre específico: UAG es ámbar , UGA es opal o umber , y UAA es ocre . [8] En el ADN, estos codones de terminación son TAG, TGA y TAA, respectivamente.
- ^ a b c d e f La base histórica para designar los codones de parada como ámbar, ocre y ópalo se describe en la autobiografía de Sydney Brenner [12] y en un artículo histórico de Bob Edgar. [13]
- ^ La principal diferencia entre el ADN y el ARN es que la timina (T) solo se encuentra en el primero. En el ARN, se reemplaza con uracilo (U). [16] Ésta es la única diferencia entre la tabla de codones de ARN estándar y la tabla de codones de ADN estándar.
- ^ Euplotes octacarinatus es una excepción. [18]
Referencias
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enlaces externos
- DNA codon chart organized in a wheel