El código de plastidios de bacterias, arqueas y plantas (tabla de traducción 11 ) es el código de ADN utilizado por bacterias , arqueas , virus procarióticos y proteínas de cloroplasto . Es esencialmente el mismo que el código estándar , sin embargo, existen algunas variaciones en los codones de inicio alternativos .
El código
Propiedades bioquímicas de los aminoácidos | No polar | Polar | Básico | Ácido | Terminación: codón de parada |
1ra base | 2da base | 3ra base | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
U | C | A | GRAMO | ||||||
U | UUU | (Phe / F) Fenilalanina | UCU | (Ser / S) Serina | UAU | (Tyr / Y) Tirosina | UGU | (Cys / C) Cisteína | U |
UUC | UCC | UAC | CGU | C | |||||
UUA | (Leu / L) Leucina | UCA | UAA | Detener ( Ocre ) [B] | UGA | Detener ( ópalo ) [B] | A | ||
UUG [A] | UCG | UAG | Detener ( ámbar ) [B] | UGG | (Trp / W) Triptófano | GRAMO | |||
C | CUU | CCU | (Pro / P) Prolina | CAU | (His / H) Histidina | CGU | (Arg / R) Arginina | U | |
CUC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CUA | CCA | CAA | (Gln / Q) Glutamina | CGA | A | ||||
CUG [A] | CCG | CAG | CGG | GRAMO | |||||
A | AUU | (Ile / I) Isoleucina | ACU | (Thr / T) Treonina | AAU | (Asn / N) Asparagina | AGU | (Ser / S) Serina | U |
AUC | ACC | CAA | AGC | C | |||||
AUA | ACA | AAA | (Lys / K) Lisina | AGA | (Arg / R) Arginina | A | |||
AGOSTO [A] | (Met / M) Metionina | ACG | AAG | AGG | GRAMO | ||||
GRAMO | GUU | (Val / V) Valina | GCU | (Ala / A) Alanina | GAU | (Asp / D) Ácido aspártico | GGU | (Gly / G) Glicina | U |
GUC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GUA | GCA | GAA | (Glu / E) Ácido glutámico | GGA | A | ||||
GUG | GCG | MORDAZA | GGG | GRAMO |
- A El codón AUG codifica la metionina y sirve como sitio de inicio: el primer AUG enla región codificante deun ARNmes donde comienza la traducción a proteína. [1]Los otros codones de inicio enumerados por GenBank son raros en eucariotas y generalmente codifican Met / fMet. [2]
- B ^ ^ ^ La base histórica para designar los codones de terminación como ámbar, ocre y ópalo se describe en una autobiografía de Sydney Brenner [3] y en un artículo histórico de Bob Edgar. [4]
Como en el código estándar, la iniciación es más eficiente en AUG. Además, los inicios de GUG y UUG están documentados en arqueas y bacterias. [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] En Escherichia coli , se estima que UUG sirve como iniciador para aproximadamente el 3% de las proteínas de la bacteria. [12] Se sabe que CUG funciona como un iniciador de una proteína codificada por plásmido (RepA) en E. coli . [13] Además de las iniciaciones NUG, en casos raros las bacterias pueden iniciar la traducción de un codón AUU como, por ejemplo, en el caso de la poli (A) polimerasa PcnB y el gen InfC que codifica el factor de iniciación de la traducción IF3 . [14] [15] [9] [16] Las asignaciones internas son las mismas que en el código estándar, aunque los códigos UGA de baja eficiencia para triptófano en Bacillus subtilis y, presumiblemente, en Escherichia coli . [17]
Ver también
- Lista de códigos genéticos
Referencias
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público . [18]
- ^ Nakamoto T (marzo de 2009). "Evolución y universalidad del mecanismo de iniciación de la síntesis de proteínas". Gene . 432 (1–2): 1–6. doi : 10.1016 / j.gene.2008.11.001 . PMID 19056476 .
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