Las directrices de información mínima para la publicación de experimentos de PCR en tiempo real cuantitativos ( MIQE ) son un conjunto de protocolos para realizar y notificar datos y experimentos de PCR en tiempo real cuantitativos , según lo ideado por Bustin et al. en 2009. [1] Fueron ideados después de que se publicara un artículo en 2002 que afirmaba detectar el virus del sarampión en niños con autismo mediante el uso de RT-qPCR, pero los resultados demostraron ser completamente irreproducibles por otros científicos. [2] Los propios autores tampoco intentaron reproducirlos y se encontró que los datos sin procesar tenían una gran cantidad de errores y errores básicos en el análisis. Este incidente incitó a Stephen Bustincrear las directrices MIQE para proporcionar un nivel de referencia de calidad para los datos de qPCR publicados en la literatura científica. [2]
Las pautas MIQE se crearon debido a la baja calidad de los datos de qPCR enviados a las revistas académicas en ese momento, que solo se estaba volviendo más común como secuenciación de próxima generación.la maquinaria permitió que tales experimentos se realizaran a un costo más económico. Debido a que la técnica se utiliza en toda la ciencia en múltiples campos, los instrumentos, métodos y diseños de cómo se usa qPCR difieren mucho. Para ayudar a mejorar la calidad general, las pautas MIQE se hicieron como sugerencias generalizadas sobre procedimientos experimentales básicos y formas de datos que deben recopilarse como un nivel mínimo de información reportada para que otros investigadores las entiendan y las usen al leer el material publicado. La comunidad científica consideró importante establecer un conjunto de directrices reconocidas y ampliamente acordadas como estas, especialmente debido a la cantidad cada vez mayor de trabajo científico proveniente de países en desarrollo con muchos idiomas y protocolos diferentes. [3]
En 2009, un grupo internacional de científicos encabezado por Stephen Bustin colaboró para elaborar un conjunto de pautas sobre cómo realizar qPCR y qué formas de datos deben recopilarse y publicarse en el proceso. Esto también permitió a los editores y revisores de revistas científicas emplear las pautas al revisar un artículo enviado que incluía datos de qPCR. Por lo tanto, las pautas se establecieron como una especie de lista de verificación para cada paso del procedimiento, marcando ciertos elementos como esenciales (E) al enviar los datos para su publicación y otros como simplemente deseables (D). [4]
En septiembre de 2010 se publicó una versión adicional de las directrices para su uso con PCR cuantitativa en tiempo real basada en fluorescencia. También actuó como un resumen de la forma más amplia de las directrices. [5] Otros investigadores han estado creando versiones adicionales para formas específicas de qPCR que pueden requerir un conjunto adicional o diferente de elementos para verificar, incluida la qPCR de una sola célula [6] y la PCR digital (dPCR). [7] También se ha revisado el cumplimiento adecuado de las directrices MIQE existentes en otras áreas científicas, incluida la fotobiomodulación [8] y los biomarcadores clínicos . [9]
Bustin notó en 2014 (y nuevamente por él mismo en 2017) que había cierta aceptación y uso de las pautas MIQE dentro de la comunidad científica, pero todavía había demasiados artículos publicados con experimentos de qPCR que carecían incluso de la mayor parte. base de presentación de datos y confirmación adecuada de la efectividad de dichos datos. Estos estudios retuvieron importantes problemas de reproducibilidad, donde las conclusiones de su evidencia no pudieron ser replicadas por otros investigadores, lo que arrojó dudas sobre los resultados iniciales. Todo esto fue a pesar de que muchos artículos citaron directamente la publicación MIQE original de Bustin, pero no siguieron la lista de verificación de la guía de material en sus propios experimentos. [2] [10]Sin embargo, algunos investigadores han señalado al menos cierto éxito, con una serie de artículos que han sido rechazados por revistas académicas para su publicación debido a que no pasaron las listas de verificación de MIQE. Otros estudios se han retractado después del hecho una vez que se notó y señaló públicamente a los editores de la revista su falta de datos adecuados para aprobar las pautas MIQE. [11]