Methanocaldococcus jannaschii (antes Methanococcus jannaschii ) es un arqueano metanogénico termófilo de la clase Methanococci . Fue la primera arqueona en tener su genoma completo secuenciado . [1] La secuenciación identificó muchos genes exclusivos de las arqueas. Muchas de las vías de síntesis de los cofactores metanogénicosse desarrollaron bioquímicamente en este organismo, [2] al igual que otras vías metabólicas específicas de las arqueas.
Methanocaldococcus jannaschii | |
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clasificación cientifica | |
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Especies: | M. jannaschii |
Nombre binomial | |
Methanocaldococcus jannaschii | |
Sinónimos | |
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Historia
Methanocaldococcus jannaschii fue aislado de un respiradero hidrotermal submarino en el Instituto Oceanográfico Woods Hole . [3]
Secuenciación
Methanocaldococcus jannaschii fue secuenciado por un grupo en TIGR dirigido por Craig Venter [4] usando secuenciación escopeta de genoma completo . Methanocaldococcus jannaschii representó el primer miembro de Archaea en tener su genoma secuenciado. Según Venter, las características únicas del genoma proporcionaron una fuerte evidencia de que hay tres dominios de la vida . [4]
Taxonomía
Methanocaldoccus jannaschii es un miembro del género Methanocaldococcus (anteriormente una parte de Methanococcus ) y, por lo tanto, a veces se lo denomina metanógeno de "clase I" (por ejemplo, [1] ).
Biología y bioquímica
Methanocaldococcus jannaschii es un metanógeno termofílico , lo que significa que crece al producir metano como un subproducto metabólico . Solo es capaz de crecer en dióxido de carbono e hidrógeno como fuentes de energía primaria, a diferencia de muchos otros metanococos (como Methanococcus maripalidus ) que también pueden usar formiato como fuente de energía primaria. [3] El genoma incluye muchas hidrogenasas , como una 5,10-meteniltetrahidrometanopterina hidrogenasa , [5] una ferredoxina hidrogenasa (eha) y una coenzima F420 hidrogenasa . [6]
Los estudios proteómicos mostraron que M. jannaschii contiene una gran cantidad de inteínas : 19 fueron descubiertas por un estudio. [7]
Se han elaborado muchas vías metabólicas nuevas en M. jannaschii , incluidas las vías para la síntesis de muchos cofactores metanogénicos, [2] riboflavina , [8] y vías de síntesis de aminoácidos novedosos. [ cita requerida ] También se han estudiado muchas vías de procesamiento de información en este organismo, como una familia de ADN polimerasa específica de arqueas . [9] La información sobre las proteínas transmembrana de un solo paso de M. jannaschii se recopiló en la base de datos Membranome .
Referencias
- ^ Carol J. Bult, Owen White, Gary J. Olsen, Lixin Zhou, Robert D. Fleischmann, Granger G. Sutton, Judith A. Blake, Lisa M. FitzGerald, Rebecca A. Clayton, Jeannine D. Gocayne, Anthony R. Kerlavage, Brian A. Dougherty, Tumba de Jean-Francois, Mark D. Adams, Claudia I. Reich, Ross Overbeek, Ewen F. Kirkness, Keith G. Weinstock, Joseph M. Merrick, Anna Glodek, John L. Scott, Neil SM Geoghagen, Janice F. Weidman, Joyce L. Fuhrmann, Dave Nguyen, Teresa R. Utterback, Jenny M. Kelley, Jeremy D. Peterson, Paul W. Sadow, Michael C. Hanna, Matthew D. Cotton, Kevin M. Roberts, Margaret A. Hurst, Brian P. Kaine, Mark Borodovsky, Hans-Peter Klenk, Claire M. Fraser, Hamilton O. Smith, Carl R. Woese y J. Craig Venter (1996). "Secuencia completa del genoma del arqueón metanogénico, Methanococcus jannaschii ". Ciencia . 273 (5278): 1058–1073. Código Bibliográfico : 1996Sci ... 273.1058B . doi : 10.1126 / science.273.5278.1058 . PMID 8688087 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ a b Robert H. White (2001). "Biosíntesis de los cofactores metanogénicos". Vitaminas y Hormonas . 61 : 299–337. doi : 10.1016 / s0083-6729 (01) 61010-0 . PMID 11153270 .
- ^ a b W. J. Jones, J. A. Leigh, F. Mayer, C. R. Woese y R. S. Wolfe (1983). " Methanococcus jannaschii sp. Nov., Un metanógeno extremadamente termofílico de un respiradero hidrotermal submarino". Archivos de Microbiología . 136 (4): 254-261. doi : 10.1007 / BF00425213 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ a b Nicholas Wade (23 de agosto de 1996). "El mar profundo da una pista sobre el origen de la vida" . New York Times .
- ^ Erica J. Lyon, Seigo Shima, Gerrit Buurman, Shantanu Chowdhuri, Alfred Batschauer, Klaus Steinbach y Rudolf K. Thauer (enero de 2004). "Inactivación UV-A / luz azul de la hidrogenasa 'libre de metales' (Hmd) de arqueas metanogénicas" . Revista europea de bioquímica . 271 (1): 195-204. doi : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03920.x . PMID 14686932 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ Rudolf K. Thauer, Anne-Kristin Kaster, Meike Goenrich, Michael Schick, Takeshi Hiromoto y Seigo Shima (2010). "Hydrogenases de archaea metanogénicas, níquel, una novela cofactor, y H 2 de almacenamiento". Revisión anual de bioquímica . 79 : 507–536. doi : 10.1146 / annurev.biochem.030508.152103 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ Wenhong Zhu, Claudia I. Reich, Gary J. Olsen, Carol S. Giometti y John R. Yates III (2004). "Proteómica de escopeta de Methanococcus jannaschii y conocimientos sobre la metanogénesis". Revista de investigación del proteoma . 3 (3): 538–548. doi : 10.1021 / pr034109s . PMID 15253435 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ Ilka Haase, Simone Mörtl, Peter Köhler, Adelbert Bacher y Markus Fischer (2003). "Biosíntesis de riboflavina en Archaea: 6,7-dimetil-8-ribitilumazina sintasa de Methanococcus jannaschii ". Revista europea de bioquímica . 270 (5): 1025–1032. doi : 10.1046 / j.1432-1033.2003.03478.x . PMID 12603336 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ Yoshizumi Ishino, Kayoko Komori, Isaac K. O. Cann y Yosuke Koga (1998). "Una nueva familia de ADN polimerasa encontrada en Archaea" . Revista de bacteriología . 180 (8): 2232–2236. doi : 10.1128 / JB.180.8.2232-2236.1998 . PMC 107154 . PMID 9555910 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
Otras lecturas
- Gao, Yongxiang (noviembre de 2013). "Cristalización y análisis preliminar de difracción de rayos X de MJ0458, una adenilato quinasa de Methanocaldococcus jannaschii " . Acta Crystallographica Sección F . 69 : 1272-1274. doi : 10.1107 / S1744309113026638 . PMC 3818051 . PMID 24192367 .
- Wang, Yu; Xu, Huimin; White, Robert H. (agosto de 2014). "Biosíntesis de beta-alanina en Methanocaldococcus jannaschii " . Sociedad Americana de Microbiología . 196 : 2869-2875. doi : 10.1128 / JB.01784-14 . PMC 4135672 . PMID 24891443 .
- Allen, Kyle D .; Xu, Huimin; White, Robert H. (septiembre de 2014). "Identificación de un radical único S-adenosilmetionina metilasa probablemente implicado en la biosíntesis de metanopterina en Methanocaldococcus jannaschii " . Revista de bacteriología . 196 (18): 3315–3323. doi : 10.1128 / JB.01903-14 . PMC 4135684 . PMID 25002541 .
- Lee, Eun Hye; Lee, Kitaik; Hwang, Kwang Yeon (13 de diciembre de 2013). "Caracterización estructural y comparación de las grandes subunidades de IPM isomerasa y homoaconitasa de Methanococcus jannaschii ". Acta Crystallographica Sección D . 70 (4): 922–931. doi : 10.1107 / S1399004713033762 .
enlaces externos
- Entrada de microbio wiki para metano (caldo) coccus jannaschii
- Entrada del navegador del genoma de UCSD para Methanocaldococcus jannaschii
- Entrada KEGG para Methanocaldococcus jannaschii
- Tipo de cepa de Methanocaldococcus jannaschii en Bac Dive - la base de metadatos de diversidad bacteriana