Euryarchaeota (en griego, "amplia calidad antigua") es un filo de arqueas . [7] Es uno de los dos filos de arqueas, el otro es crenarchaeota . [8] Las Euryarchaeota son muy diversas e incluyen metanógenos , que producen metano y se encuentran a menudo en los intestinos, halobacterias , que sobreviven a concentraciones extremas de sal , y algunos aerobios y anaerobios extremadamente termófilos , que generalmente viven a temperaturas entre 41 y 122 ° C. Están separados de los otros arqueos basándose principalmente en secuencias de ARNr y su ADN polimerasa única. [9]
Euryarchaeota | |
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Halobacterium sp. cepa NRC-1, cada célula de aproximadamente 5 µm de longitud. | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | |
Reino: | Euryarchaeota |
Phyla [6] | |
Sinónimos | |
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Descripción
Las Euryarchaeota son diversas en apariencia y propiedades metabólicas. El filo contiene organismos de una variedad de formas, incluidos bastones y cocos . Euryarchaeota puede aparecer grampositiva o gramnegativa dependiendo de si la pseudomureína está presente en la pared celular. [10] Euryarchaeota también demuestra diversos estilos de vida, incluidos metanógenos, halófilos, reductores de sulfato y termófilos extremos en cada uno. [10] Otros viven en el océano, suspendidos con plancton y bacterias. Aunque estas euryarchaeota marinas son difíciles de cultivar y estudiar en un laboratorio, la secuenciación genómica sugiere que son heterótrofos móviles . [11]
Aunque anteriormente se pensaba que euryarchaeota solo vivía en ambientes extremos (en términos de temperatura, contenido de sal y / o pH), un artículo de Korzhenkov et al publicado en enero de 2019 mostró que euryarchaeota también vive en ambientes moderados, como de baja temperatura. ambientes ácidos. En algunos casos, la euryarchaeota superó en número a las bacterias presentes. [12] Euryarchaeota también se ha encontrado en otros ambientes moderados como manantiales de agua, marismas, suelo y rizosferas . [8] Algunas euryarchaeota son muy adaptables; un orden llamado Halobacteriales se encuentra generalmente en ambientes extremadamente salados y ricos en azufre, pero también puede crecer en concentraciones de sal tan bajas como las del agua de mar al 2.5%. [8] En las rizosferas, la presencia de euryarchaeota parece depender de la de hongos micorrízicos ; una mayor población de hongos se correlacionó con una mayor frecuencia y diversidad de euryarchaeota, mientras que la ausencia de hongos micorrízicos se correlacionó con la ausencia de euryarchaeota. [8]
Filogenia
la filogenia se basa en la liberación de LTP basada en rRNA 16S 121 [13] | Dombrowski y col. 2019, [14] Jordan et al. 2017 [15] y Cavalier-Smith2020. [5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) [16] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [17] y la filogenia se basa en la liberación 121 de LTP basada en rRNA 16S de 'The Proyecto de árboles vivos para todas las especies . [13]
| Otros análisis filogenéticos han sugerido que las arqueas del clado DPANN también pueden pertenecer a Euryarchaeota y que incluso pueden ser un grupo polifilético que ocupa diferentes posiciones filogenéticas dentro de Euryarchaeota. También se debate si el phylum Altiarchaeota debe clasificarse en DPANN o Euryarchaeota. [14] A continuación se muestra un gráfico de un cladograma que resume esta propuesta. [15] [5] Los grupos marcados entre comillas son linajes asignados a DPANN, pero separados filogenéticamente del resto.
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Una tercera filogenia de Annotree [18] y GTDB, versión 05-RS95 (17 de julio de 2020). [19]
| Euryarchaeota ss |
Ver también
- Nanoorganismos acidófilos de la mina Archaeal Richmond (ARMAN)
- Monera
Referencias
- ^ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (junio de 1990). "Hacia un sistema natural de organismos: propuesta para los dominios Archaea, Bacteria y Eucarya" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 87 (12): 4576–9. Código Bibliográfico : 1990PNAS ... 87.4576W . doi : 10.1073 / pnas.87.12.4576 . PMC 54159 . PMID 2112744 .
- ↑ Anja Spang, Eva F. Caceres, Thijs JG Ettema: Exploración genómica de la diversidad, ecología y evolución del dominio arqueológico de la vida . En: Science Volume 357 Issue 6351, eaaf3883, 11 de agosto de 2017, doi: 10.1126 / science.aaf3883
- ↑ Sometines mal escritos como Theinoarchaea: Catherine Badel, Gaël Erauso, Annika L. Gomez, Ryan Catchpole, Mathieu Gonnet, Jacques Oberto, Patrick Forterre, Violette Da Cunha: La distribución global y la historia evolutiva de la familia de plásmidos de arqueas pT26-2 . En: microbiología ambiental. sfam 10 de septiembre de 2019. doi: 10.1111 / 1462-2920.14800
- ^ Petitjean, C .; Deschamps, P .; López-García, P .; Moreira, D. (2014). "Enraizar el dominio Archaea por análisis filogenómico apoya la fundación del nuevo reino Proteoarchaeota" . Genome Biol. Evol . 7 (1): 191–204. doi : 10.1093 / gbe / evu274 . PMC 4316627 . PMID 25527841 .
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- ^ NCBI: Candidatus Poseidoniia (clase)
Otras lecturas
- Cavalier-Smith T (enero de 2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 52 (Pt 1): 7-76. doi : 10.1099 / 00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Woese CR, Gupta R, Hahn CM, Zillig W, Tu J (1984). "Las relaciones filogenéticas de tres arqueobacterias dependientes de azufre". Microbiología sistemática y aplicada . 5 : 97-105. doi : 10.1016 / S0723-2020 (84) 80054-5 . PMID 11541975 .
- Garrity GM, Holt JG (2001). "Phylum AII. Euryarchaeota phy. Nov." . En DR Boone, RW Castenholz (eds.). Manual de Bergey de Bacteriología Sistemática Volumen 1: Las arqueas y las bacterias fototróficas y de ramificación profunda (2ª ed.). Nueva York: Springer Verlag . pp. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2.
enlaces externos
- Referencias de PubMed para Euryarchaeota
- Referencias de PubMed Central para Euryarchaeota
- Referencias de Google Scholar para Euryarchaeota
- Análisis comparativo de los genomas de Euryarchaeota (en el sistema IMG del DOE ) `1
- Página de taxonomía NCBI para Euryarchaeota
- Búsqueda de páginas de taxonomía del Árbol de la vida para Euryarchaeota
- Búsqueda de la página Species2000 para Euryarchaeota
- Página de MicrobeWiki para Euryarchaeota