ModBase es una base de datos de modelos de estructura de proteínas comparativos anotados , que contiene modelos para más de 3,8 millones de secuencias de proteínas únicas. [1] Los modelos son creados por la comparativa de modelado de tuberías ModPipe que se basa en la MODELADOR programa.
Contenido | |
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Descripción | Base de datos de modelos comparativos de estructura de proteínas |
Contacto | |
Centro de Investigación | Universidad de California en San Francisco |
Laboratorio | Departamento de Bioingeniería y Ciencias Terapéuticas |
Autores | Ursula Pieper, Eswar Narayanan, Ben Webb, Andrej Sali |
Cita primaria | Pieper & al. (2011) [1] |
Fecha de lanzamiento | 1998 |
Acceso | |
Sitio web | http://salilab.org/modbase |
URL de descarga | ftp://salilab.org/databases/modbase |
URL del servicio web | http://salilab.org/modweb |
ModBase se desarrolla en el laboratorio de Andrej Sali en UCSF . Los modelos ModBase también son accesibles a través del Portal de modelos de proteínas .
Ver también
Referencias
- ^ a b Pieper, Ursula; Webb Benjamin M; Barkan David T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberg Hannes; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E; Burley Stephen K; Sali Andrej (enero de 2011). "ModBase, una base de datos de modelos de estructura de proteínas comparativos anotados y recursos asociados" . Ácidos nucleicos Res . Inglaterra. 39 (Problema de la base de datos): D465-74. doi : 10.1093 / nar / gkq1091 . PMC 3013688 . PMID 21097780 .