Mycobacterium aubagnense es una especie del filo Actinobacteria ( bacterias grampositivas con alto contenido de guanina y citosina , uno de los filos dominantes de todas las bacterias), perteneciente al género Mycobacterium .
Tipo cepa : cepa U8 = CCUG 50186 = CIP 108543.
Etimología : NL neut. adj. aubagnense, perteneciente a Aubagne , ciudad de donde era originario el primer paciente.
ADÉKAMBI (T.), BERGER (P.), RAOULT (D.) y DRANCOURT (M.): caracterización basada en la secuencia del gen rpoB de micobacterias no tuberculosas emergentes con descripciones de Mycobacterium bolletii sp. noviembre, Mycobacterium phocaicum sp. nov. y Mycobacterium aubagnense sp. nov. En t. J. Sys. Evol. Microbiol., 2006, 56, 133–143. PMID 16403878