NeXML es un estándar de intercambio para representar datos filoinformáticos. [1] Se inspiró en el formato de archivo Nexus ampliamente utilizado , pero utiliza XML para producir un formato más sólido para datos filogenéticos ricos. Las ventajas incluyen validación de sintaxis, anotación semántica y servicios web. El formato es ampliamente compatible y tiene bibliotecas en muchos lenguajes de programación populares para bioinformática .
Extensiones de nombre de archivo | .nexml |
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Tipo de medio de Internet | text/x-nexml+xml |
Desarrollado por | Rutger A. Vos y col. |
Versión inicial | 1 de Julio de 2012 |
Tipo de formato | bioinformática |
Extendido desde | XML |
¿ Formato abierto ? | sí |
Sitio web | nexml |
enlaces externos
- NeXML Github
- Manual de NeXML
Referencias
- ^ Vos, Rutger A .; Balhoff, James P .; Caravas, Jason A .; Titular, Mark T .; Lapp, Hilmar; Maddison, Wayne P .; Midford, Peter E .; Priyam, Anurag; Sukumaran, Jeet (1 de julio de 2012). "NeXML: representación rica, extensible y verificable de datos y metadatos comparativos" . Biología sistemática . 61 (4): 675–689. doi : 10.1093 / sysbio / sys025 . ISSN 1063-5157 . PMC 3376374 . PMID 22357728 .