Open Babel es un software informático , un sistema químico experto que se utiliza principalmente para interconvertir formatos de archivos químicos . [3] Debido a la fuerte relación con la informática, este programa pertenece más a la categoría de quiminformática que al modelado molecular . Está disponible para Windows , Unix , Linux , macOS y Android . Es un software gratuito y de código abierto publicado bajo una GNU General Public License (GPL) 2.0.
Desarrollador (es) | Equipo de desarrollo de Open Babel |
---|---|
Versión inicial | 2 de junio de 2005 |
Lanzamiento estable | 3.1.1 / 8 de mayo de 2020 [1] |
Repositorio | www |
Escrito en | C , C ++ ( wxWidgets [2] ) |
Sistema operativo | Windows , macOS , Linux , Android |
Plataforma | IA-32 , x86-64 |
Disponible en | inglés |
Tipo | Quiminformática , modelado molecular |
Licencia | GPL 2.0 |
Sitio web | www |
El objetivo declarado del proyecto es: "Open Babel es un proyecto científico impulsado por la comunidad que ayuda tanto a los usuarios como a los desarrolladores como un programa y biblioteca multiplataforma diseñado para respaldar el modelado molecular, la química y muchas áreas relacionadas, incluida la interconversión de formatos de archivo y datos. "
Historia
Open Babel y JOELib se derivaron de la biblioteca de quimioinformática OELib . A su vez, OELib se basó en ideas del programa de química original Babel y una biblioteca de programación orientada a objetos inédita llamada OBabel .
Características principales
- sistema químico experto
- interconversión de muchos formatos de archivos químicos
- búsqueda de subestructura, basada en un sistema simplificado de entrada de línea de entrada molecular (SMILES)
- cálculo de huellas dactilares
- Generación de coordenadas 3D [4]
- envoltorios para Python , Perl , Java , Ruby , C # [5]
Ver también
- Avogadro : constructor molecular y editor basado en Open Babel
- Ghemical - programa de mecánica molecular basado en Open Babel
- JOELib : versión Java de Open Babel y OELib
- XDrawChem : programa de dibujo 2D basado en Open Babel
- Comparación de software para modelado de mecánica molecular
- Obelisco azul [6]
- Lista de paquetes de software gratuitos y de código abierto
Referencias
- ^ "Lanzamientos · openbabel / openbabel" . github.com . Consultado el 22 de abril de 2021 .
- ^ "Debian - Detalles del paquete openbabel-gui en jessie" . Consultado el 10 de marzo de 2017 .
- ^ O'Boyle, NM; Banck, M .; James, CA; Morley, C .; Vandermeersch, T .; Hutchison, GR (2011). "Open Babel: una caja de herramientas química abierta" . Revista de Cheminformatics . 3 : 33. doi : 10.1186 / 1758-2946-3-33 . PMC 3198950 . PMID 21982300 .
- ^ Yoshikawa, Naruki; Hutchison, Geoffrey R. (1 de agosto de 2019). "Generación de coordenadas basada en fragmentos rápida y eficiente para Open Babel" . Revista de Cheminformatics . 11 (1): 49. doi : 10.1186 / s13321-019-0372-5 . PMC 6676618 . PMID 31372768 .
- ^ http://openbabel.org/
- ^ Guha, R .; Howard, MT; Hutchison, GR; Murray-Rust, P .; Rzepa, H .; Steinbeck, C .; Wegner, J .; Willighagen, EL (2006). "El Obelisco Azul - Interoperabilidad en Informática Química" . Revista de información química y modelado . 46 (3): 991–998. doi : 10.1021 / ci050400b . PMC 4878861 . PMID 16711717 .
enlaces externos
- Página web oficial
- E-BABEL - versión interactiva del Open Babel en el Laboratorio Virtual de Química Computacional
- chemCast Episodio 003 : el desarrollador líder del proyecto, Geoff Hutchison, fue entrevistado en el podcast
- Defectos de diseño en OELib