El Árbol de la Vida Abierta es una línea filogenética árbol de la vida - un esfuerzo de colaboración, financiado por la Fundación Nacional de Ciencia . [2] [3] El primer borrador, que incluye 2,3 millones de especies, se publicó en septiembre de 2015. [4] El gráfico interactivo permite al usuario acercarse a clasificaciones taxonómicas, árboles filogenéticos e información sobre un nodo. Al hacer clic en una especie, se devolverá su taxonomía de origen y referencia.
Disponible en | inglés |
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URL | opentreeoflife.org |
Comercial | No |
Registro | no requerido |
Lanzado | Septiembre de 2015 |
Estado actual | activo |
Licencia de contenido | BSD 2 cláusulas (FreeBSD) [1] |
Acercarse
El proyecto utiliza un enfoque de superárbol para generar un único árbol filogenético (disponible en tree.opentreeoflife.org [5] ) a partir de una taxonomía completa y un conjunto curado de estimaciones filogenéticas publicadas.
La taxonomía es una combinación de varias clasificaciones grandes producidas por otros proyectos; se crea utilizando una herramienta de software llamada "smasher" [6]. La taxonomía resultante se denomina Open Tree Taxonomy (OTT) y se puede navegar en línea. [7]
Historia
El proyecto se inició en junio de 2012 con un premio NSF de tres años a investigadores de diez universidades. En 2015, se otorgó un premio complementario de dos años a investigadores de tres instituciones.
Ver también
Referencias
- ^ "Licencia OpenTreeOfLife" .
- ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM, et al. (Octubre de 2015). "Síntesis de filogenia y taxonomía en un árbol de la vida integral" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (41): 12764–9. Código bibliográfico : 2015PNAS..11212764H . doi : 10.1073 / pnas.1423041112 . PMC 4611642 . PMID 26385966 .
- ^ "Montaje, visualización y análisis del árbol de la vida" . Fundación Nacional de Ciencias (NSF) . Consultado el 11 de febrero de 2016 .
- ^ Pennisi E (21 de septiembre de 2015). "El primer árbol de la vida completo muestra cuán relacionado estás con millones de especies" . Revista de ciencia .
- ^
, desarrolladores de Open Tree of Life. @gmail.com>"árbol abierto" . - ^ Rees JA, Cranston K (2017). "Montaje automatizado de una taxonomía de referencia para la síntesis de datos filogenéticos" . Revista de datos de biodiversidad . 5 (5): e12581. doi : 10.3897 / BDJ.5.e12581 . PMC 5515096 . PMID 28765728 .
- ^ "tree.opentreeoflife.org" .