Secuencia descendente de PYLIS

Secuencia de inserción de pirrolisina 1
Estructura secundaria predicha del ARN PYLIS 1.
Identificadores
Símbolo	PÍLIS 1
Rfam	RF01982
Otros datos
Tipo de ARN	Elemento regulador cis
Dominio (s)	Arqueas
Estructuras PDB	PDBe

En biología, la secuencia aguas abajo PYLIS (PYLIS: py rro l ysine i nsertion s equence ) es un tallo-bucle estructura que aparece en algunas de ARNm de secuencias. Anteriormente se pensaba que este motivo estructural provocaba que el codón de parada UAG (ámbar) se tradujera al aminoácido pirrolisina en lugar de finalizar la traducción de la proteína. ^[1]^[2]^[3] Sin embargo, se ha demostrado que PYLIS no tiene ningún efecto sobre la eficacia de la supresión de UAG, ^[4] por lo que incluso su nombre es, de hecho, incorrecto.

Ver también

Elemento SECIS

Referencias

^ Namy O, Rousset JP, Napthine S, Brierley I (2004). "Decodificación genética reprogramada en la expresión génica celular" . Célula molecular . 13 (2): 157-168. doi : 10.1016 / S1097-2765 (04) 00031-0 . PMID 14759362 .
^ Théobald-Dietrich A, Giegé R, Rudinger-Thirion J (2005). "Evidencia de la existencia en ARNm de un elemento de horquilla responsable de la inserción de pirrolisina dependiente de ribosoma en proteínas". Biochimie . 87 (9-10): 813-817. doi : 10.1016 / j.biochi.2005.03.006 . PMID 16164991 .
^ Zhang Y, Baranov PV, Atkins JF, Gladyshev VN (mayo de 2005). "La pirrolisina y la selenocisteína utilizan estrategias de decodificación diferentes" . J. Biol. Chem . 280 (21): 20740–20751. doi : 10.1074 / jbc.M501458200 . PMID 15788401 .
^ Namy, Olivier; Zhou, Yu; Gundllapalli, Sarath; Polycarpo, Carla R .; Denise, Alain; Rousset, Jean-Pierre; Söll, Dieter; Ambrogelly, Alexandre (noviembre de 2007). "Añadiendo pirrolisina al código genético de Escherichia coli " . Cartas FEBS . 581 (27): 5282–5288. doi : 10.1016 / j.febslet.2007.10.022 . PMID 17967457 .

Otras lecturas

Longstaff DG, Blight SK, Zhang L, Green-Church KB, Krzycki JA (enero de 2007). " Requisitos contextuales in vivo para la traducción de UAG como pirrolisina". Mol. Microbiol . 63 (1): 229–241. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2006.05500.x . PMID 17140411 . S2CID 25346794 .
Theil Have, C; Zambach, S; Christiansen, H (4 de abril de 2013). "Efectos del uso de potencial de codificación, conservación de secuencias y conservación de la estructura del ARNm para predecir genes que contienen pirrolisina" . BMC Bioinformática . 14 (1): 118. doi : 10.1186 / 1471-2105-14-118 . PMC 3639795 . PMID 23557142 .

enlaces externos

Página para la secuencia de inserción de pirrolisina 1 en Rfam

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[pmid14759362-1] Namy O, Rousset JP, Napthine S, Brierley I (2004). "Decodificación genética reprogramada en la expresión génica celular" . Célula molecular . 13 (2): 157-168. doi : 10.1016 / S1097-2765 (04) 00031-0 . PMID 14759362 .

[pmid16164991-2] Théobald-Dietrich A, Giegé R, Rudinger-Thirion J (2005). "Evidencia de la existencia en ARNm de un elemento de horquilla responsable de la inserción de pirrolisina dependiente de ribosoma en proteínas". Biochimie . 87 (9-10): 813-817. doi : 10.1016 / j.biochi.2005.03.006 . PMID 16164991 .

[pmid15788401-3] Zhang Y, Baranov PV, Atkins JF, Gladyshev VN (mayo de 2005). "La pirrolisina y la selenocisteína utilizan estrategias de decodificación diferentes" . J. Biol. Chem . 280 (21): 20740–20751. doi : 10.1074 / jbc.M501458200 . PMID 15788401 .

[4] Namy, Olivier; Zhou, Yu; Gundllapalli, Sarath; Polycarpo, Carla R .; Denise, Alain; Rousset, Jean-Pierre; Söll, Dieter; Ambrogelly, Alexandre (noviembre de 2007). "Añadiendo pirrolisina al código genético de Escherichia coli " . Cartas FEBS . 581 (27): 5282–5288. doi : 10.1016 / j.febslet.2007.10.022 . PMID 17967457 .

[1]