Pardis Christine Sabeti ( persa : پردیس ثابتی ) (nacida el 25 de diciembre de 1975 en Teherán, Irán ) es una bióloga computacional , genetista médica y genetista evolutiva iraní-estadounidense . [2] Ella desarrolló un método estadístico bioinformático que identifica secciones del genoma que han estado sujetas a selección natural y un algoritmo que explica los efectos de la genética en la evolución de la enfermedad. [3] [4] [5] [6] [7]
Pardis Sabeti | |
---|---|
Nació | Pardis Christine Sabeti 25 de diciembre de 1975 |
Educación | Escuela Preparatoria Trinity |
alma mater |
|
Premios | Beca Rhodes Premio Richard Lounsbery |
Carrera científica | |
Campos | Genética evolutiva Epidemiología genética Biología computacional Antropología biológica Bioinformática Genética médica |
Instituciones | Instituto Broad de la Universidad de Harvard |
Tesis | Los efectos de la selección natural y la recombinación sobre la diversidad genética en humanos: una investigación del paludismo por Plasmodium falciparum en poblaciones africanas (2002) |
Asesor de doctorado | Ryk Ward Anthony J. Boyce [1] |
Sitio web | sabetilab |
En 2014, Sabeti formó parte de un equipo dirigido por Christian Happi, un genetista camerunés, que utilizó tecnología avanzada de secuenciación genómica para identificar un único punto de infección desde un reservorio animal hasta un humano en el brote de ébola en África Occidental . [8] Los cambios en el ARN sugieren que la primera infección humana fue seguida por transmisiones exclusivas de humano a humano. [9] El trabajo la llevó a ser nombrada una de las Personas del Año por la revista TIME en 2014 (luchadores contra el ébola), y una de las 100 personas más influyentes de TIME en 2015. [10] [11]
Sabeti es profesor titular en el Centro de Biología de Sistemas y el Departamento de Biología Organísmica y Evolutiva de la Universidad de Harvard y en la facultad del Centro de Dinámica de Enfermedades Transmisibles de la Escuela de Salud Pública TH Chan de Harvard , y es miembro del instituto de Broad Instituto e investigador del Instituto Médico Howard Hughes . [12] Ella es la directora del Laboratorio Sabeti. [13]
Sabeti es el cantante principal y escritor de la banda de rock Thousand Days [7] [14] [15] y también es el presentador actual de la serie educativa Against All Odds: Inside Statistics patrocinada por Annenberg Learner . [16] Su programa está incluido en muchos planes de estudios de estadística de escuelas secundarias, incluido el Curso de Estadísticas de Investigación 1 y 2 en la Escuela Secundaria Thomas Jefferson de Ciencia y Tecnología .
Temprana edad y educación
Sabeti nació en 1975 en Teherán , Irán , de Nasrin y Parviz Sabeti . Su padre provenía de una familia de Baháʼí Faith pero nunca se unió oficialmente como miembro [17] [18] y fue diputado en SAVAK , la agencia de inteligencia de Irán, y un oficial de seguridad de alto rango en el régimen de Shah . [19] [20] Tenía una hermana, Parisa, que era 2 años mayor. [19] Al crecer, Parisa le enseñó a Pardis el material del curso que había aprendido el año anterior en la escuela, lo que llevó a Pardis a estar "casi dos años por delante de sus compañeros de clase" cuando comenzó el año escolar. [19]
Su familia huyó de Irán en octubre de 1978, poco antes de la revolución iraní , cuando Sabeti tenía dos años [21] y encontró refugio en Florida . [19] Al crecer en Orlando , [22] Sabeti quería ser propietario de una floristería, novelista o médico. [23] Sin embargo, ella era la más apasionada por las matemáticas. [23] Durante su infancia y en la universidad, Sabeti jugó tenis competitivo. [24] Sabeti fue a la Trinity Preparatory School en Florida Central. En la escuela secundaria, fue una becaria de mérito nacional y participó en el equipo académico de la escuela secundaria All-USA de USA Today. [19] Además, atribuye parte de su inspiración hacia la ciencia médica a la película Outbreak de 1995 . [25]
Sabeti pasó a estudiar biología en el Instituto de Tecnología de Massachusetts (MIT), donde fue miembro del equipo de tenis universitario y presidenta de la clase, y se graduó en 1997 con una especialización en Biología y un "promedio perfecto de 5.0". [19] En el MIT, comenzó su carrera investigadora en el laboratorio de David Bartel [26] y también trabajó en el laboratorio de Eric Lander , [27] creó el Freshman Leadership Program y trabajó como asistente de enseñanza. [22] En ese entonces era una Rhodes Scholar en la Universidad de Oxford y completó su Doctorado en Genética Evolutiva en 2002, [1] y se graduó summa cum laude con un Doctorado en Medicina en la Escuela de Medicina de Harvard en 2006, siendo la tercera mujer en recibir este honor desde que la escuela había comenzado a aceptar alumnas. [27] [28] Las becas Paul & Daisy Soros para nuevos estadounidenses apoyaron sus estudios de posgrado. [27] Inicialmente, Sabeti planeaba ingresar a la medicina y convertirse en médico; sin embargo, decidió dedicarse a la investigación después de completar la facultad de medicina y descubrir que prefería la investigación a la medicina. [23]
Carrera e investigación
Sabeti es un participante anual en la Serie de Conferencias Distinguidas en el aclamado Research Science Institute del MIT para estudiantes de secundaria. En mayo de 2015, pronunció una charla TED , titulada "Cómo lucharemos contra el próximo virus mortal". [29] "Su equipo recibió recientemente fondos del Proyecto TED Audacious para construir Sentinel, un sistema de prevención y respuesta ante una pandemia". [30] [31]
Como estudiante graduado en Oxford y becario postdoctoral con Eric Lander en el Broad Institute , Sabeti desarrolló una familia de pruebas estadísticas para la selección positiva que buscan variantes genéticas comunes que se encuentran en haplotipos inusualmente largos . Sus pruebas, la homocigosidad de haplotipos extendidos (EHH), la prueba de haplotipos de largo alcance (LRH) y la homocigosidad de haplotipos extendidos de poblaciones cruzadas (XP-EHH), están diseñadas para detectar mutaciones ventajosas cuya frecuencia en poblaciones humanas ha aumentado rápidamente durante las últimas 10,000 años. [3] [4] [32] [33] Como miembro de la facultad de Harvard, Sabeti y su grupo han desarrollado una prueba estadística para identificar señales de selección, el compuesto de múltiples señales (CMS), [34] y una familia de pruebas estadísticas para detectar y caracterizar correlaciones en conjuntos de datos de cualquier tipo, exploración no paramética de información máxima (MINE). [5] Sabeti creó una serie de videos con el objetivo de explicar las estadísticas a estudiantes de secundaria y universitarios. [ cita requerida ] Sabeti tiene a través de su colaboración con Michael Mitzenmacher un número Erd Ers de 3. [35]
En febrero de 2021 Sabeti fue coautor de un artículo en Nature Communications sobre cómo un cierto nivel de anticuerpos COVID-19 puede proporcionar una protección duradera contra el virus. El documento se basó en muestras de sangre proporcionadas voluntariamente por 4300 empleados de SpaceX, acreditando también a su CEO Elon Musk . [36] [37]
Premios y honores
Sabeti recibió en 2012 el premio American Ingenuity Award de la revista Smithsonian en la categoría de Ciencias Naturales. En 2014, recibió el Premio Vilcek a la Promesa Creativa en Ciencias Biomédicas. [38] Es una Joven Líder Global del Foro Económico Mundial y una Exploradora Emergente de National Geographic .
Además de ser nombrada una de las Personas del Año por la revista TIME en 2014 (luchadores contra el ébola), Sabeti fue incluida como una de las 100 personas más influyentes de la revista TIME en 2015. [39]
En 2015, Sabeti fue seleccionada para el prestigioso premio Investigador del Instituto Médico Howard Hughes. [40] También ha recibido un premio Burroughs Wellcome Fund Career Award en ciencias biomédicas, [41] un premio de la Fundación Packard en ciencia e ingeniería, [32] y un premio al nuevo innovador del director del NIH , [33] y un L'Oréal por Beca Mujeres en Ciencias.
Sabeti estaba en la lista de las 100 mujeres de la BBC anunciada el 23 de noviembre de 2020 [42].
Vida personal
Sabeti es el cantante y compositor de la banda de rock Thousand Days. [7] [14] [15] En su tiempo libre, Sabeti disfruta jugando voleibol y participa en la liga de voleibol de verano de Harvard. [43]
El 17 de julio de 2015, Sabeti sufrió un accidente casi fatal en una conferencia en Montana. [24] Ella era una pasajera en un vehículo todo terreno que cayó por un acantilado y se catapultó a las rocas. Se rompió la pelvis y las rodillas y sufrió una lesión cerebral. [24] Completó la rehabilitación para volver a la docencia. [24]
Filmografia
- Against All Odds ... Host (32 episodios) [44]
Referencias
- ↑ a b Sabeti, Pardis Christine (2002). Los efectos de la selección natural y la recombinación sobre la diversidad genética en humanos: una investigación del paludismo por Plasmodium falciparum en poblaciones africanas . jisc.ac.uk (tesis de DPhil). Universidad de Oxford. OCLC 64594684 . EThOS uk.bl.ethos.410671 . Archivado desde el original el 7 de marzo de 2019 . Consultado el 6 de marzo de 2019 .
- ^ Publicaciones de Pardis Sabeti de Europa PubMed Central
- ^ a b Sabeti, PC; Reich, DE; Higgins, JM; Levine, HZP; Richter, DJ; Schaffner, SF; Gabriel, SB; Platko, JV; Patterson, Nueva Jersey; McDonald, GJ; Ackerman, HC; Campbell, SJ; Altshuler, D .; Cooper, R .; Kwiatkowski, D .; Ward, R .; Lander, ES (2002). "Detección de selección positiva reciente en el genoma humano a partir de la estructura del haplotipo". Naturaleza . 419 (6909): 832–837. Código Bibliográfico : 2002Natur.419..832S . doi : 10.1038 / nature01140 . PMID 12397357 . S2CID 4404534 .
- ^ a b Sabeti, Pardis C .; Varilly, Patrick; Fry, Ben; Lohmueller, Jason; Hostetter, Elizabeth; Cotsapas, Chris; Xie, Xiaohui; Byrne, Elizabeth H .; McCarroll, Steven A .; Gaudet, Rachelle; Schaffner, Stephen F .; Lander, Eric S .; El Consorcio Internacional HapMap; Frazer, Kelly A .; Ballinger, Dennis G .; Cox, David R .; Hinds, David A .; Stuve, Laura L .; Gibbs, Richard A .; Belmont, John W .; Boudreau, Andrew; Hardenbol, Paul; Leal, Suzanne M .; Pasternak, Shiran; Wheeler, David A .; Willis, Thomas D .; Yu, Fuli; Yang, Huanming; Zeng, Changqing Zeng; et al. (2007). "Detección y caracterización de selección positiva en todo el genoma en poblaciones humanas" . Naturaleza . 449 (7164): 913–918. Código Bib : 2007Natur.449..913S . doi : 10.1038 / nature06250 . PMC 2687721 . PMID 17943131 .
- ^ a b Reshef, DN; Reshef, YA; Finucane, HK ; Grossman, SR; McVean, G .; Turnbaugh, PJ; Lander, ES ; Mitzenmacher, M .; Sabeti, PC (2011). "Detección de nuevas asociaciones en grandes conjuntos de datos" . Ciencia . 334 (6062): 1518-1524. Código Bibliográfico : 2011Sci ... 334.1518R . doi : 10.1126 / science.1205438 . PMC 3325791 . PMID 22174245 .
- ^ Deen, Lango (25 de julio de 2005). "Uno a uno con Pardis Sabeti" . Science Spectrum en línea . Archivado desde el original el 28 de septiembre de 2007 . Consultado el 27 de julio de 2007 .
- ^ a b c Furman, Eric (16 de julio de 2007). "Genios que cambiarán tu vida" . CNN .com . Consultado el 27 de julio de 2007 .
- ^ Kolata, Gina (1 de diciembre de 2014). "Examinando genes en busca de respuestas sobre el ébola" . The New York Times . ISSN 0362-4331 . Consultado el 28 de mayo de 2016 .
- ^ Evento de transmisión de un solo animal a humano responsable del comunicado de prensa del NIH del brote de ébola de 2014 , 29 de agosto de 2014
- ^ "Pardis Sabeti" . Tiempo . Consultado el 30 de octubre de 2020 .
- ^ "Persona del año 2014: lea las historias de los científicos del ébola" . TIME.com . Consultado el 30 de octubre de 2020 .
- ^ "Centro FAS de Biología de Sistemas, Universidad de Harvard" . Archivado desde el original el 17 de mayo de 2008.
- ^ "Sabeti Lab" . sabetilab.org . Consultado el 28 de mayo de 2016 .
- ^ a b Kahn, Joseph (14 de junio de 2008). "Melodías infecciosas" . Consultado el 14 de junio de 2012 .
- ^ a b "bio" . mil días. 2008-06-14. Archivado desde el original el 28 de marzo de 2013 . Consultado el 12 de octubre de 2013 .
- ^ "Contra todo pronóstico, estadísticas internas" . Aprendiz de Annenberg . Fundación Annenberg. Archivado desde el original el 30 de noviembre de 2015 . Consultado el 18 de noviembre de 2018 .
- ^ Informe del grupo de derechos de las minorías, volúmenes 2-51, El grupo 1982, página 114.
- ↑ El pogromo secreto de Irán: la conspiración para acabar con los baháʼís, Geoffrey Nash, N. Sge 50.
- ^ a b c d e f "Pardis Sabeti, el científico de la estrella del rock en patines de Harvard | Ciencia y naturaleza | Revista Smithsonian" . Smithsonianmag.com . Consultado el 12 de octubre de 2013 .
- ^ "El Dr. Pardis Sabeti es miembro de PAAIA" .
- ^ "Viajes médicos y musicales: una entrevista con una de las personas del año de Time, Pardis Sabeti" . El Huffington Post . 2016-02-10 . Consultado el 1 de mayo de 2016 .
- ^ a b "Tres de MIT llamado Rhodes, Marshall Scholars - The Tech" . tech.mit.edu . Consultado el 28 de mayo de 2016 .
- ^ a b c "Perfil de Pardis Sabeti" . El Proyecto Rhodes . Consultado el 1 de mayo de 2016 .
- ^ a b c d "Quince profesores para conocer | Revista | The Harvard Crimson" . www.thecrimson.com . Consultado el 1 de mayo de 2016 .
- ^ Medina, Kai (diciembre de 2020). "Rodearse de las mejores personas" . KaiMedinaE .
- ^ Sabeti PC, Unrau PJ, Bartel DP (1997). "Acceso a actividades raras de secuencias de ARN aleatorias: la importancia de la longitud de las moléculas en el grupo inicial" . Chem Biol . 4 (10): 767–74. doi : 10.1016 / s1074-5521 (97) 90315-x . PMID 9375255 .
- ^ a b c Oskin, Becky (14 de junio de 2006). "Perfil del adjudicatario de Burroughs Wellcome Fund de Pardis Sabeti" . Archivado desde el original el 14 de diciembre de 2019 . Consultado el 12 de octubre de 2007 .
- ^ "El científico amplio Pardis Sabeti recibe prestigiosos premios de investigación | Instituto Broad del MIT y Harvard" . www.broadinstitute.org . Consultado el 28 de mayo de 2016 .
- ^ Sabeti, Pardis. "Cómo lucharemos contra el próximo virus mortal" . www.ted.com . Consultado el 19 de mayo de 2016 .
- ^ Bazelon, Emily. "¿Cómo será la universidad en el otoño?" . www.nytimes.com . Consultado el 3 de junio de 2020 .
- ^ Siliezar, Juan. "Respondiendo a esta pandemia, preparándonos para la próxima" . www.harvard.edu . Consultado el 3 de junio de 2020 .
- ^ a b "Directorio de becas de la Fundación Packard: Pardis Sabeti" . Consultado el 14 de junio de 2012 .
- ^ a b "Científico iraní gana el premio al innovador NIH 2009" . 2009-10-24 . Consultado el 14 de junio de 2012 .
- ^ Grossman, SR; Shlyakhter, I .; Karlsson, EK; Byrne, EH; Morales, S .; Frieden, G .; Hostetter, E .; Angelino, E .; Garber, M .; Zuk, O .; Lander, ES; Schaffner, SF; Sabeti, PC (2010). "Un compuesto de múltiples señales distingue las variantes causales en regiones de selección positiva". Ciencia . 327 (5967): 883–886. Código bibliográfico : 2010Sci ... 327..883G . CiteSeerX 10.1.1.230.5254 . doi : 10.1126 / science.1183863 . PMID 20056855 . S2CID 9751422 .
- ^ Reshef, Yakir A .; Reshef, David N .; Finucane, Hilary K .; Sabeti, Pardis C .; Mitzenmacher, Michael (2016). "Medir la dependencia de forma potente y equitativa". J. Mach. Aprender. Res. 17 (212): 63. arXiv : 1505.02213 .
- ^ Krouse, Sarah (21 de febrero de 2021). "Elon Musk consiguió que 4.000 trabajadores de SpaceX se unieran a un estudio de COVID-19. Esto es lo que aprendió" . Wall Street Journal . Consultado el 21 de febrero de 2021 , a través de foxbusiness.com .
- ^ Bartsch, Yannic C .; Fischinger, Stephanie; Siddiqui, Sameed M .; Chen, Zhilin; Yu, Jingyou; Gebre, Makda; Atyeo, Caroline; Gorman, Matthew J .; Zhu, Alex Lee; Kang, Jaewon; Burke, John S .; Slein, Matthew; Gluck, Matthew J .; Beger, Samuel; Hu, Yiyuan; Rhee, Justin; Petersen, Eric; Mormann, Benjamin; de St Aubin, Michael; Hasdianda, Mohammad A .; Jambaulikar, Guruprasad; Boyer, Edward W .; Sabeti, Pardis C .; Barouch, Dan H .; Julg, Boris D .; Musk, Elon R .; Menon, Anil S .; Lauffenburger, Douglas A .; Nilles, Eric J .; Alter, Galit (15 de febrero de 2021). "Seguimiento de títulos de anticuerpos de SARS-CoV-2 discretos con estabilidad humoral funcional" . Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 1018. doi : 10.1038 / s41467-021-21336-8 . PMC 7884400 . PMID 33589636 .
- ^ "La Fundación Vilcek -" . www.vilcek.org . Archivado desde el original el 25 de junio de 2016 . Consultado el 9 de diciembre de 2015 .
- ^ J. Craig Venter (16 de abril de 2015), "Las 100 personas más influyentes: Pardis Sabeti" , Time
- ^ "HHMI selecciona a 26 de los principales científicos biomédicos de la nación" . 2015-05-19 . Consultado el 2 de junio de 2015 .
- ^ Davis, Nicole (14 de junio de 2006). "El científico amplio Pardis Sabeti recibe prestigiosos premios de investigación" . Consultado el 12 de octubre de 2007 .
- ^ "BBC 100 Women 2020: ¿Quién está en la lista este año?" . BBC News . 2020-11-23 . Consultado el 23 de noviembre de 2020 .
- ^ "Pardis Sabeti: Cell Press" . www.cell.com . Consultado el 28 de mayo de 2016 .[ enlace muerto permanente ]
- ^ "Contra todo pronóstico: estadísticas internas" . Aprendiz de Annenberg .
enlaces externos
- Annie Reneau (4 de noviembre de 2019). "Pardis Sabeti: galardonado genetista computacional de día, cantante de indie rock de noche" . Decente .
- "Perfil: Pardis Sabeti" en NOVA: Science Now , junio de 2008
- La ciencia se encuentra con MTV: el genetista y cantante de rock del Broad Institute Pardis Sabeti fusiona la cultura de laboratorio con la cultura pop (Nature Network Boston, 31 de julio de 2007)
- Fotos de mil días (10 de mayo de 2007)
- Hoja de ruta genética trazada para rastrear la ruta hacia enfermedades comunes
- Video. Perfil: Pardis Sabeti . NOVA scienceNOW , 07.02.2008.
- Perfil del informe anual de Burroughs Wellcome Fund Archivado el 14 de diciembre de 2019 en la Wayback Machine.