Parhyale hawaiensis es unaespecie de crustáceo anfípodo que se utiliza enanálisis genéticos y de desarrollo . Está catalogado como un organismo modelo emergente ya que se han establecido las principales técnicas biológicas necesarias para el estudio de un organismo.
Parhyale hawaiensis | |
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Macho adulto | |
Alimentándose con una rodaja de zanahoria | |
clasificación cientifica | |
Reino: | |
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Familia: | |
Género: | |
Especies: | P. hawaiensis |
Nombre binomial | |
Parhyale hawaiensis Dana , 1853 |
Habitat
P. hawaiensis es un detritovore que tiene una distribución marina circuntropical , mundial, intermareal y de aguas poco profundas , [1] [2] y puede ocurrir como un complejo de especies . [3] Se ha informado que ocurre en grandes poblaciones (más de 3000 por metro cuadrado) en material de hoja de manglar en descomposición en ambientes sujetos a cambios rápidos en la salinidad . [4] La capacidad de tolerar cambios rápidos de temperatura y osmóticos permite que esta especie prospere en condiciones típicas de laboratorio. Es una especie robusta y está siendo considerada para la acuicultura. [5]
Ciclo vital
Las hembras producen embriones cada 2 semanas una vez que alcanzan la madurez sexual . La embriogénesis es relativamente corta y dura unos 10 días a 26 ° C (79 ° F). Las hembras normalmente crían los embriones en una bolsa de cría ventral . Un examen minucioso del desarrollo embrionario de P. hawaiensis ha producido el sistema de estadificación más detallado para cualquier crustáceo. [7] La embriogénesis completa se ha dividido en 30 etapas diferenciadas, que son fácilmente identificables en animales vivos o por medio de marcadores moleculares comunes en muestras fijas. Las crías poseen un complemento completo de segmentos y apéndices morfológicamente similares a los de los animales adultos.
Investigación genética
P. hawaiensis se utiliza en la investigación genética porque los óvulos y los embriones se manipulan fácilmente. Los embriones pueden extraerse rápida y fácilmente de la bolsa de cría y mantenerse en agua de mar. Los huevos se pueden recolectar e incubar individualmente, y los animales maduros se pueden usar posteriormente en apareamientos de hermana-hermano o madre-hijo para generar líneas endogámicas .
Los huevos fertilizados son lo suficientemente grandes para realizar microinyecciones [8] y aislamientos de blastómeros [9] con relativa facilidad. Los embriones de P. hawaiensis en desarrollo son claros, lo que permite tanto análisis microscópicos detallados in situ como el uso de moléculas trazadoras marcadas con fluorescencia en embriones vivos. La escisión temprana es holoblástica (total), lo que permite explorar el destino de las células tempranas individuales mediante la manipulación experimental. [7] [8] [9]
Se generó inicialmente un transcriptoma de P. hawaiensis utilizando la técnica de pirosecuenciación . [10] Este recurso se puede descargar gratuitamente . Posteriormente, se generaron transcriptomas más completos utilizando la secuenciación de Illumina. Los datos del transcriptoma se pueden utilizar para la creación de sondas in situ y otras herramientas experimentales. El genoma está disponible en NCBI
El genoma de P. hawaiensis está disponible y se secuenció utilizando la secuenciación de lectura corta de Illumina. [11] Esta primera versión ( V3.0 ) del genoma fue reemplazada recientemente por una versión más contigua generada por la secuenciación de Chicago a través de la plataforma Dovetail. La nueva versión Phaw_5.0 está disponible en NCBI.
Referencias
- ^ Clarence Raymond Shoemaker (1956). "Observaciones sobre el género anfípodo Parhyale ". Actas del Museo Nacional de Estados Unidos . 106 (3372): 345–358. doi : 10.5479 / si.00963801.106-3372.345 .
- ^ JL Barnard (1965). "Anfípoda marina de atolones en Micronesia". Actas del Museo Nacional de Estados Unidos . 117 (3516): 459–551. doi : 10.5479 / si.00963801.117-3516.459 .
- ^ Alan A. Myers (1985). "Amphipoda (Gammaridea) de Fiji en aguas poco profundas, arrecifes de coral y manglares" (PDF) . Registros del Museo Australiano . Supl. 5: 1–143.
- ^ S. Poovachiranon, K. Boto y N. Duke (1986). "Estudios de preferencias alimentarias y mediciones de la tasa de ingestión del anfípodo de manglar Parhyale hawaiensis (Dana)". Revista de Biología y Ecología Marina Experimental . 98 (1–2): 129–140. doi : 10.1016 / 0022-0981 (86) 90078-X .
- ^ Vargas-Abúndez, Jorge Arturo; López-Vázquez, Humberto Ivan; Mascaró, Maite; Martínez-Moreno, Gemma Leticia; Simões, Nuno (10 de febrero de 2021). "Anfípodos marinos como una nueva presa viva para la acuicultura ornamental: explorar el potencial de Parhyale hawaiensis y Elasmopus pectenicrus" . PeerJ . 9 : e10840. doi : 10.7717 / peerj.10840 . ISSN 2167-8359 . PMC 7881717 .
- ^ Kao D, Lai AG, Stamataki E, Rosic S, Konstantinides N, Jarvis E, et al. (2016). "El genoma del crustáceo Parhyale hawaiensis, modelo de desarrollo animal, regeneración, inmunidad y digestión de lignocelulosa" . eLife . 5 . doi : 10.7554 / eLife.20062 . PMC 5111886 . PMID 27849518 .
- ^ a b William E. Browne; Alivia L. Price; Matthias Gerberding; Nipam H. Patel (2005). "Etapas del desarrollo embrionario en el crustáceo anfípodo, Parhyale hawaiensis " (PDF) . Génesis . 42 (3): 124-149. doi : 10.1002 / gene.20145 . PMID 15986449 . S2CID 18213916 .
- ^ a b Matthias Gerberding, William E. Browne y Nipam H. Patel (2002). "Análisis de linaje celular del crustáceo anfípodo Parhyale hawaiensis " . Desarrollo . 129 (24): 5789–5901. doi : 10.1242 / dev.00155 . PMID 12421717 .
- ^ a b Cassandra G. Extavour (2005). "El destino de blastómeros aislados con respecto a la formación de células germinales en el crustáceo anfípodo Parhyale hawaiensis " (PDF) . Biología del desarrollo . 277 (2): 387–402. doi : 10.1016 / j.ydbio.2004.09.030 . PMID 15617682 . Archivado desde el original (PDF) el 26 de marzo de 2012 . Consultado el 4 de julio de 2011 .
- ^ Victor Zeng; Karina Villanueva; Ben Ewen-Campen; Frederike Alwes; William Browne; Cassandra Extavour (2011). " Ensamblaje de novo y caracterización de un transcriptoma materno y de desarrollo para el crustáceo modelo emergente Parhyale hawaiensis " (PDF) . BMC Genomics . 12 : 581. doi : 10.1186 / 1471-2164-12-581 . PMC 3282834 . PMID 22118449 .
- ^ Kao D, Lai AG, Stamataki E, Rosic S, Konstantinides N, Jarvis E; et al. (2016). "El genoma del crustáceo Parhyale hawaiensis, modelo de desarrollo animal, regeneración, inmunidad y digestión de lignocelulosa" . eLife . 5 . doi : 10.7554 / eLife.20062 . PMC 5111886 . PMID 27849518 .CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
Otras lecturas
- E. Jay Rehm; Roberta L. Hannibal; R. Crystal Chaw; Mario A. Vargas-Vila; Nipam H. Patel (2009). "El crustáceo Parhyale hawaiensis : un nuevo modelo para el desarrollo de artrópodos". Protocolos de Cold Spring Harbor . 2009 (1): pdb.emo114. doi : 10.1101 / pdb.emo114 . PMID 20147009 .