PeptideAtlas es un recurso de datos de proteómica que recopila conjuntos de datos de espectrometría de masas en tándem de todo el mundo, los vuelve a procesar con Trans-Proteomic Pipeline y hace que el resultado combinado esté disponible gratuitamente para la comunidad . Peptide Atlas es uno de los miembros fundadores del Consorcio ProteomeXchange .
Historia
La primera concepción de PeptideAtlas comenzó en el Instituto de Biología de Sistemas en el laboratorio de investigación de Ruedi Aebersold por Eric Deutsch y Sharon Chen en la Base de Datos de Péptidos Anotados (APD). El concepto se amplió aún más con esfuerzos adicionales de Parag Mallick y Frank Desiere. La primera instancia de un conjunto de experimentos humanos se publicó en 2004 como Human PeptideAtlas. [1]
El concepto se expandió aún más a muchas otras especies a lo largo de los años con un gran esfuerzo por parte de Nichole King, Zhi Sun, Terry Farrah y Dave Campbell.
Estado actual
PeptideAtlas todavía se mantiene y desarrolla en el Instituto de Biología de Sistemas en el laboratorio de investigación de Robert Moritz, dirigido por Eric Deutsch, y con importantes esfuerzos de Zhi Sun y Dave Campbell.
Ver también
enlaces externos
Referencias
- ^ Desiere, Frank; Deutsch, Eric W .; Nesvizhskii, Alexey I .; Mallick, Parag; King, Nichole L .; Eng, Jimmy K .; Aderem, Alan; Boyle, Rose; Brunner, Erich; Donohoe, Samuel; Fausto, Nelson; Hafen, Ernst; Hood, Lee; Katze, Michael G .; Kennedy, Kathleen A .; Kregenow, Floyd; Lee, Hookeun; Lin, Biaoyang; Martin, Dan; Ranish, Jeffrey A .; Rawlings, David J .; Samelson, Lawrence E .; Shiio, Yuzuru; Watts, Julian D .; Wollscheid, Bernd; Wright, Michael E .; Yan, Wei; Yang, Lihong; Yi, Eugene C .; Zhang, Hui; Aebersold, Ruedi (2005). "Integración con el genoma humano de secuencias de péptidos obtenidas por espectrometría de masas de alto rendimiento" . Biología del genoma . 6 (1): –9. doi : 10.1186 / gb-2004-6-1-r9 . ISSN 1474-760X . PMC 549070 . PMID 15642101 .