Volteo del plano peptídico


El cambio de plano peptídico es un tipo de cambio conformacional que puede ocurrir en las proteínas por el cual los ángulos diédricos de los aminoácidos adyacentes experimentan rotaciones a gran escala con un pequeño desplazamiento de las cadenas laterales . El cambio de plano se define como una rotación de los ángulos diédricos φ,ψ en los aminoácidos i e i+1 de manera que los ángulos resultantes permanecen en regiones estructuralmente estables del espacio de Ramachandran . El requisito clave es que la suma del ángulo ψ i del residuo i y el ángulo φ i+1 del residuo i+1permanecer aproximadamente constante; en efecto, el giro es un movimiento del cigüeñal alrededor del eje definido por los vectores de enlace C α -C¹ y NC α del grupo peptídico, que son aproximadamente paralelos. Como ejemplo, los giros beta de tipo I y tipo II se diferencian por un simple giro del grupo peptídico central del giro.

La importancia de los cambios de plano del péptido en la dinámica del estado nativo se ha inferido en algunas proteínas comparando estructuras cristalinas de la misma proteína en múltiples conformaciones . [1] Por ejemplo, los cambios de péptidos se han descrito como significativos en el ciclo catalítico de la flavodoxina [2] y en la formación de estructuras amiloides , donde su capacidad para proporcionar una vía de baja energía entre la hoja beta y la llamada hoja alfa se sugiere la conformación para facilitar las primeras etapas de la amiloidogénesis. [3] [4] [5]La inversión del plano peptídico también puede ser significativa en las primeras etapas del plegamiento de proteínas . [1]

En las estructuras proteicas determinadas por cristalografía de rayos X , la mala geometría del plano peptídico se ha descrito como un problema común; muchas estructuras necesitan corrección mediante cambios de plano peptídico o cambios de enlaces peptídicos . [6]