Philip Eric Bourne (nacido en 1953) es un bioinformático australiano , [10] escritor de no ficción [2] y hombre de negocios. [4] Actualmente es Stephenson Chair of Data Science y Director de la School of Data Science y profesor de Ingeniería Biomédica [11] y fue el primer Director Asociado de Data Science en los National Institutes of Health , donde sus proyectos incluyen la gestión de Big Iniciativa Data to Knowledge y anteriormente Vicecanciller Asociado en UCSD . [12] Ha contribuido a los libros de texto y es un firme partidario de la literatura y el software de acceso abierto. Sus diversos intereses han abarcadobiología estructural , informática médica , tecnología de la información , bioinformática estructural , comunicación académica y ciencias farmacéuticas . [10] Sus artículos están muy citados y tiene un índice h superior a 50. [13] [14] [9]
Phil Bourne | |
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Nació | Philip Eric Bourne 1953 (67 a 68 años) [1] |
alma mater | Universidad de Flinders (PhD) |
Conocido por |
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Esposos) | Roma Chalupa ( m. 1983) |
Niños |
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Premios |
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Carrera científica | |
Campos | Ciencia de datos Biología computacional Comunicación académica [9] Bioinformática |
Instituciones | |
Tesis | Análisis de estructura cristalina: complejos metálicos de interés biológico y estereoquímica de fonilbiciclooctanos sustituidos (1979) |
Estudiantes notables | Werner G. Krebs |
Sitio web | datascience .virginia .edu / people / phil-bourne |
Educación
Bourne se formó como químico físico a mediados o finales de la década de 1970 y obtuvo su doctorado en 1979 [1] en la Universidad Flinders .
Carrera e investigación
Después de su doctorado, Bourne se trasladó a la Universidad de Sheffield para realizar una investigación postdoctoral durante 1979-1981, [15] seguido de un traslado a la Universidad de Columbia , Nueva York, en 1981. En 1995 se trasladó a la Universidad de California, San Diego , donde fue profesor en el Departamento de Farmacología. En 2014, se trasladó a los NIH para convertirse en su Director Asociado de Ciencia de Datos. En enero de 2017, se anunció que había aceptado un puesto como director del Instituto de Ciencia de Datos de la Universidad de Virginia . [dieciséis]
Es conocido por escribir el libro Unix for VMS Users (1990) [2] y por ser co-desarrollador del algoritmo de Extensión Combinatoria para la alineación tridimensional de estructuras de proteínas , [17] junto con I. Shindyalov (1998). En 1999 se convirtió en codirector del Protein Data Bank . [18] Fue presidente de la ISCB (2002-2003). [19] Es miembro de la Asociación Estadounidense de Informática Médica desde 2002. [20] Es el Editor en Jefe fundador de PLoS Computational Biology (2005-). En 2007 cofundó SciVee . [4] Bourne es editor de la popular serie de editoriales Ten Simple Rules publicada en la revista PLoS Computational Biology . [21] Se ha desempeñado como Vicerrector Asociado de Innovación y Alianzas Industriales [12] y profesor de farmacología en la Facultad de Farmacia y Ciencias Farmacéuticas Skaggs de la Universidad de California, San Diego (UCSD). [22] [23] Es asesor del proyecto Hypothes.is [24] y Director Asociado de Ciencia de Datos en los Institutos Nacionales de Salud, donde sus proyectos incluyen la gestión de la iniciativa Big Data to Knowledge . [25] [26]
Publicaciones
Bourne es autor de numerosos artículos científicos y capítulos de libros y editor del libro de texto Structural Bioinformatics . [27] [28] y Pharmacy Informatics [29] Otras publicaciones [9] incluyen:
- Bioinformática estructural 1ª edición [27]
- Bioinformática estructural 2ª edición [28]
- Informática farmacéutica [29]
- Unix para usuarios de Vms [2]
- Bourne, Philip E. (1 de enero de 1997). Un libro de cocina para servir Internet para UNIX . Prentice Hall. ISBN 9780135199923.
- Hart, David L .; Bourne, Philip E. (12 de agosto de 1998). Libro de recetas de Mac OS 8 Web Server (1ª ed.). PTR de Prentice Hall. ISBN 9780135200162.
- Bourne, Philip E. (1 de enero de 2000). Guía subterránea Unix . Prentice Hall. ISBN 9780131844582.
- Berman, HM; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, TN; Weissig, H .; Shindyalov, IN; Bourne, PE (1 de enero de 2000). "El banco de datos de proteínas" . Investigación de ácidos nucleicos . 28 (1): 235–242. doi : 10.1093 / nar / 28.1.235 . ISSN 0305-1048 . PMC 102472 . PMID 10592235 .
Premios y honores
Bourne fue elegido miembro de la AAAS en virtud de Ciencias Farmacéuticas en 2011 [5] y miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) en 2011. [6] En 2010 ganó de Microsoft Jim Gray e-Ciencia premio [7] y en 2009 ganó el premio Benjamin Franklin (2009). [8] [30]
Vida personal
Bourne está casado desde 1983 con Roma Chalupa y tienen dos hijos: Scott Bourne (1985-) y Melanie Bourne (1997-). [ cita requerida ] Sus intereses incluyen motocicletas, [31] volar y caminar
Referencias
- ^ a b Bourne, Philip Eric (1979). Análisis de estructura cristalina: complejos metálicos de interés biológico y estereoquímica de fonilbiciclooctanos sustituidos (tesis doctoral). Universidad de Flinders. OCLC 708090572 .
- ^ a b c d Bourne, Phil E (1990). Unix para usuarios de VMS . Prensa digital Newton, MA, EE. UU. ISBN 1-55558-034-3.
- ^ Berman, HM ; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T .; Weissig, H .; Shindyalov, I .; Bourne, P. (2000). "El banco de datos de proteínas" . Investigación de ácidos nucleicos . 28 (1): 235–242. doi : 10.1093 / nar / 28.1.235 . PMC 102472 . PMID 10592235 .
- ^ a b c Fink, JL; Bourne, PE (2007). "Reinventar la comunicación académica para la era electrónica" . CTWatch Quarterly . 3 (3).
- ^ a b "El Dr. Phil Bourne elegido miembro de la AAAS en Ciencias Farmacéuticas" . Pharmacy.ucsd.edu . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
- ^ a b "Becarios ISCB" .
- ^ a b "Philip E. Bourne gana el premio Jim Gray eScience de Microsoft 2010" . Eurekalert.org. 2010-10-18 . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
- ^ a b "Premio Benjamin Franklin" . Bioinformatics.org . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
- ^ a b c Publicaciones de Philip Bourne indexadas por Google Scholar
- ^ a b Publicaciones de Philip Bourne indexadas por la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
- ^ https://engineering.virginia.edu/faculty/philip-e-bourne
- ^ a b http://pharmacy.ucsd.edu/news/Appointment-of-Associate-VC-for-Innovation-%20Industry-Alliances.pdf
- ^ página en la Universidad de Virginia
- ^ sitio web antiguo de Bournes
- ^ Clegg, GA; Stansfield, RFD; Bourne, PE; Harrison, PM (1980). "Empaquetamiento de hélice y conformación de subunidades en apoferritina de bazo de caballo". Naturaleza . 288 (5788): 298–300. doi : 10.1038 / 288298a0 . PMID 7432529 . S2CID 4335735 .
- ^ https://www.news.virginia.edu/content/uva-names-nih-researcher-new-director-data-science-institute
- ^ Shindyalov, IN; Bourne, PE (1998). "Alineación de la estructura de la proteína por extensión combinatoria incremental (CE) de la ruta óptima" . Diseño y Selección de Ingeniería de Proteínas . 11 (9): 739–747. doi : 10.1093 / proteína / 11.9.739 . PMID 9796821 .
- ^ Berman, HM ; Westbrook, J .; Feng, Z .; Gilliland, G .; Bhat, T .; Weissig, H .; Shindyalov, I .; Bourne, P. (2000). "El banco de datos de proteínas" . Investigación de ácidos nucleicos . 28 (1): 235–242. doi : 10.1093 / nar / 28.1.235 . PMC 102472 . PMID 10592235 .
- ^ "ISCB - ex presidentes" . Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2015 . Consultado el 3 de septiembre de 2015 .
- ^ Greenes, RA; Madsen, E .; Miller, RA (2003). "Becarios del Colegio Americano de Informática Médica y Asociados Internacionales, 2002" . Revista de la Asociación Estadounidense de Informática Médica . 10 (3): 281-286. doi : 10.1197 / jamia.M1326 . PMC 400512 .
- ^ Diez reglas simples
- ^ http://www.sdsc.edu/pb/ La página web del laboratorio de Bourne
- ^ http://www.sdsc.edu/~bourne/CV.pdf Philip E. Bourne Ph.D. CV
- ^ Sitio web oficial de Hypothes.is
- ^ NIH nombra al Dr. Philip E. Bourne primer director asociado de ciencia de datos
- ^ Margolis, R .; Derr, L .; Dunn, M .; Huerta, M .; Larkin, J .; Sheehan, J .; Guyer, M .; Green, ED (2014). "Iniciativa de Big Data to Knowledge (BD2K) de los Institutos Nacionales de Salud: capitalizar el big data biomédico" . Revista de la Asociación Estadounidense de Informática Médica . 21 (6): 957–8. doi : 10.1136 / amiajnl-2014-002974 . ISSN 1067-5027 . PMC 4215061 . PMID 25008006 .
- ^ a b Bourne, Philip E .; Weissig, Helga (2003). Bioinformática estructural . John Wiley e hijos.
- ^ a b Gu, Jenny; Bourne, Philip E. (marzo de 2009). Bioinformática estructural (2ª ed.). Wiley-Blackwell. ISBN 978-0-470-18105-8.
- ^ a b Anderson, Philip O .; Bourne, Philip E. (diciembre de 2009). Informática Farmacéutica . Prensa CRC. ISBN 978-1-4200-7175-7.
- ^ "El elogio de Bourne: evangelista de acceso abierto gana el premio Benjamin Franklin 2009" . Bio-itworld.com . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
- ^ OFL | Philip Bourne | Blog de viajes
Precedido por Russ Altman | Presidente de la Sociedad Internacional de Biología Computacional 2002-2003 | Sucedido por Michael Gribskov |
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