En biología molecular, el dominio proteico SAICAR sintasa es una enzima que cataliza una reacción para crear SAICAR . En enzimología , esta enzima también se conoce como fosforribosilaminoimidazoles succinocarboxamida sintasa ( EC 6.3.2.6 ). Es una enzima que cataliza la reacción química.
SAICAR sintasa | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
CE no. | 6.3.2.6 | |||||||
No CAS. | 9023-67-0 | |||||||
Bases de datos | ||||||||
IntEnz | Vista IntEnz | |||||||
BRENDA | Entrada BRENDA | |||||||
FÁCIL | NiceZyme vista | |||||||
KEGG | Entrada KEGG | |||||||
MetaCyc | camino metabólico | |||||||
PRIAM | perfil | |||||||
Estructuras PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Ontología de genes | AmiGO / QuickGO | |||||||
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SAICAR sintetasa | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | SAICAR_synt | |||||||
Pfam | PF01259 | |||||||
InterPro | IPR001636 | |||||||
PROSITE | PDOC00810 | |||||||
SCOP2 | 1a48 / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd00476 | |||||||
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- ATP + 5-amino-1- (5-fosfo-D-ribosil) imidazol-4-carboxilato + L-aspartato ADP + fosfato + (S) -2- [5-amino-1- (5-fosfo-D-ribosil) imidazol-4-carboxamido] succinato
Los 3 sustratos de esta enzima son ATP , 5-amino-1- (5-fosfo-D-ribosil) imidazol-4-carboxilato y L-aspartato , mientras que sus 3 productos son ADP , fosfato y (S) -2 - [5-amino-1- (5-fosfo-D-ribosil) imidazol-4-carboxamido] succinato.
Esta enzima pertenece a la familia de las ligasas , concretamente aquellas que forman enlaces carbono-nitrógeno como ligasas ácido-D-aminoácido (péptido sintasas). El nombre sistemático de esta clase de enzimas es 5-amino-1- (5-fosfo-D-ribosil) imidazol-4-carboxilato: L-aspartato ligasa (formadora de ADP) . Esta enzima participa en el metabolismo de las purinas .
Esta familia de proteínas en particular es de gran importancia ya que se encuentra en los tres dominios de la vida. Es el séptimo paso en la ruta de la biosíntesis de purinas . Las purinas son vitales para todas las células, ya que participan en el metabolismo energético y la síntesis de ADN . [1] Además, son de interés específico para los investigadores científicos, ya que el estudio de la vía de biosíntesis de purinas podría conducir al desarrollo de fármacos quimioterapéuticos . [2] Esto se debe a que la mayoría de los cánceres carecen de una vía de rescate para los nucleótidos de adenina y dependen completamente de la vía SAICAR. [3]
Dominio proteico
Este dominio proteico se encuentra en eucariotas , bacterias y arqueas . Es vital para los organismos vivos, ya que cataliza un paso en la ruta de biosíntesis de purinas que ayuda al metabolismo energético y la síntesis de ADN .
Función del dominio proteico
En bacterias y plantas, este dominio proteico solo cataliza la síntesis de SAICAR. Sin embargo, en los mamíferos también cataliza la actividad de la fosforribosilaminoimidazol carboxilasa (AIRC). [3]
Estructura del dominio proteico
Esta proteína en particular es un octámero formado por 8 subunidades idénticas. Cada monómero consta de un dominio central y una hélice alfa C-terminal . El dominio central consiste en una hoja beta paralela de cinco hebras flanqueada por tres hélices alfa en un lado de la hoja y dos hélices alfa en el otro, formando un sándwich de tres capas (alfa beta alfa). [4]
Estudios estructurales
A finales de 2007, se han resuelto 10 estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1A48 , 1KUT , 1OBD , 1OBG , 2CNQ , 2CNU , 2CNV , 2GQR , 2GQS y 2H31 .
Otros nombres comunes
- fosforribosilaminoimidazol-succinocarboxamida sintetasa ,
- PurC ,
- SAICAR sintetasa ,
- 4- (N-succinocarboxamida) -5-aminoimidazol sintetasa ,
- 4 - [(N-succinilamino) carbonil] -5-aminoimidazol ribonucleótido ,
- sintetasa ,
- SAICARs ,
- fosforribosilaminoimidazoles succinocarboxamida sintetasa ,
- 5-aminoimidazol-4-N-succinocarboxamida ribonucleótido sintetasa .
Referencias
- ↑ Brown AM, Hoopes SL, White RH, Sarisky CA (2011). "Biosíntesis de purinas en arqueas: variaciones sobre un tema" . Biol Direct . 6 : 63. doi : 10.1186 / 1745-6150-6-63 . PMC 3261824 . PMID 22168471 .
- ^ Cheng X, Lu G, Qi J, Cheng H, Gao F, Wang J, et al. (2010). "Clonación, expresión, purificación, cristalización y análisis preliminar de difracción de rayos X de SAICAR sintasa de Streptococcus suis serotipo 2" . Acta Crystallogr F . 66 (Parte 8): 909-12. doi : 10.1107 / S1744309110020518 . PMC 2917288 . PMID 20693665 .
- ^ a b Ginder ND, Binkowski DJ, Fromm HJ, Honzatko RB (2006). "Complejos de nucleótidos de Escherichia coli fosforribosilaminoimidazol succinocarboxamida sintetasa" . J Biol Chem . 281 (30): 20680–8. doi : 10.1074 / jbc.M602109200 . PMID 16687397 .
- ^ Mathews II, Kappock TJ, Stubbe J, Ealick SE (1999). "Estructura cristalina de Escherichia coli PurE, una mutasa inusual en la vía biosintética de purina". Estructura . 7 (11): 1395–406. doi : 10.1016 / S0969-2126 (00) 80029-5 . PMID 10574791 .
- LUKENS LN, BUCHANAN JM (1959). "Biosíntesis de las purinas. XXIV. La síntesis enzimática del ácido 5-amino-1-ribosil-4-imidazolcarboxílico 5'-fosfato a partir de 5-amino-1-ribosilimidazol 5'-fosfato y dióxido de carbono". J. Biol. Chem . 234 (7): 1799–805. PMID 13672967 .
- Parker J. (1984). "Identificación del producto del gen purC de Escherichia coli" . J. Bacteriol . 157 (3): 712–7. doi : 10.1128 / JB.157.3.712-717.1984 . PMC 215316 . PMID 6365889 .
- Ebbole DJ, Zalkin H (1987). "Clonación y caracterización de un grupo de 12 genes de Bacillus subtilis que codifican nueve enzimas para la síntesis de nucleótidos de purina de novo". J. Biol. Chem . 262 (17): 8274–87. PMID 3036807 .
- Chen ZD, Dixon JE, Zalkin H (1990). "Clonación de un ADNc de hígado de pollo que codifica 5-aminoimidazol ribonucleótido carboxilasa y 5-aminoimidazol-4-N-succinocarboxamida ribonucleótido sintetasa por complementación funcional de mutantes pur de Escherichia coli" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (8): 3097–101. Código Bibliográfico : 1990PNAS ... 87.3097C . doi : 10.1073 / pnas.87.8.3097 . PMC 53841 . PMID 1691501 .
- O'Donnell AF, Tiong S, Nash D, Clark DV (2000). "El gen ade5 de Drosophila melanogaster codifica una enzima bifuncional para dos pasos en la vía de síntesis de novo de purina" . Genética . 154 (3): 1239–53. PMC 1460979 . PMID 10757766 .
- Nelson SW, Binkowski DJ, Honzatko RB, Fromm HJ (2005). "Mecanismo de acción de la fosforribosilaminoimidazolesuccinocarboxamida sintetasa de Escherichia coli". Bioquímica . 44 (2): 766–74. doi : 10.1021 / bi048191w . PMID 15641804 .