En bioquímica , una ligasa es una enzima que puede catalizar la unión ( ligación ) de dos moléculas grandes formando un nuevo enlace químico . Esto es típicamente a través de la hidrólisis de un pequeño grupo químico colgante en una de las moléculas más grandes o la enzima que cataliza la unión de dos compuestos, por ejemplo, enzimas que catalizan la unión de CO, CS, CN, etc. siguiente reacción:
- Ab + C → A – C + b
o algunas veces
- Ab + cD → A – D + b + c + d + e + f
donde las letras minúsculas pueden significar los pequeños grupos dependientes. La ligasa puede unir dos fragmentos complementarios de ácido nucleico y reparar las roturas monocatenarias que surgen en el ADN bicatenario durante la replicación.
Nomenclatura [ editar ]
Los nombres comunes de ligasas a menudo incluyen la palabra "ligasa", como ADN ligasa , una enzima comúnmente utilizada en los laboratorios de biología molecular para unir fragmentos de ADN . Otros nombres comunes para ligasas incluyen la palabra "sintetasa", porque se utilizan para sintetizar nuevas moléculas.
La nomenclatura bioquímica a veces ha distinguido las sintetasas de las sintasas y, a veces, ha tratado las palabras como sinónimos . Según una definición, las sintasas no usan energía de nucleósidos trifosfatos (como ATP, GTP, CTP, TTP y UTP), mientras que las sintetasas sí usan nucleósidos trifosfatos. También se dice que una sintasa es una liasa (una liasa es una enzima que cataliza la ruptura de varios enlaces químicos por medios distintos a la hidrólisis y la oxidación, a menudo formando un nuevo doble enlace o una nueva estructura de anillo) y no requiere ninguna energía. , mientras que una sintetasa es una ligasa (una ligasa es una enzima que une dos sustancias químicas o compuestos) y, por lo tanto, requiere energía. sin embargo, elLa Comisión Conjunta de Nomenclatura Bioquímica (JCBN) dicta que "sintasa" puede usarse con cualquier enzima que catalice la síntesis (use o no nucleósidos trifosfatos), mientras que "sintetasa" debe usarse como sinónimo. [1]
Clasificación [ editar ]
Las ligasas se clasifican como EC 6 en la clasificación de enzimas del número EC . Las ligasas se pueden clasificar en seis subclases:
- EC 6.1 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-oxígeno
- EC 6.2 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-azufre
- EC 6.3 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-nitrógeno (incluida la argininosuccinato sintetasa )
- EC 6.4 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-carbono
- EC 6.5 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces éster fosfórico
- EC 6.6 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces nitrógeno-metal, como en las quelatasas
Ligasas asociadas a membranas [ editar ]
Algunas ligasas se asocian con membranas biológicas como proteínas de membrana periférica o ancladas a través de una única hélice transmembrana , [2] por ejemplo, ciertas proteínas relacionadas con ubiquitina ligasa .
Etimología y pronunciación [ editar ]
La palabra ligasa usa formas combinadas de lig- (del verbo latino ligāre , "unir" o "unir") + -ase (que denota una enzima), produciendo "enzima de unión".
Ver también [ editar ]
- ADN ligasa
- Nucleasa
- Proteasa
Referencias [ editar ]
- ^ "Sintasas y ligasas" . chem.qmul.ac.uk . Archivado desde el original el 15 de octubre de 2012 . Consultado el 28 de julio de 2013 .
- ^ Superfamilias de ligasas transmembrana de un solo paso en la base de datos Membranome
- EC 6 Introducción del Departamento de Química de Queen Mary, Universidad de Londres
