Un virus recombinante puede ocurrir de forma natural o producirse recombinando fragmentos de ADN utilizando tecnología de ADN recombinante .
Recombinación sintética
Esto puede usarse para producir vacunas virales o vectores de terapia génica .
Recombinación natural
El término también se usa para referirse a la recombinación natural entre genomas de virus en una célula infectada por más de una cepa de virus . Esto ocurre por recombinación homóloga de las cadenas de ácido nucleico o por reordenamiento de segmentos genómicos. Tanto estos como la mutación dentro del virus se han sugerido como formas en las que evolucionan la influenza y otros virus. Un ejemplo de virus recombinante es el virus de la encefalitis equina occidental (WEE), que es un virus recombinante entre otros dos virus de encefalitis estrechamente relacionados pero distintos . Además, el reordenamiento es más importante para los virus de la influenza pandémica .