RyhB
RyhB RNA es un RNA de 90 nucleótidos que regula a la baja un conjunto de proteínas de almacenamiento y uso de hierro cuando el hierro es limitante; ella misma está regulada negativamente por la proteína represora de la absorción férrica, Fur ( regulador de la absorción férrica ).
El gen se identificó de forma independiente en dos pantallas, denominadas RyhB por Wassarman et al . y llamado SraI por Argaman et al . y se encontró que se expresaba solo en fase estacionaria. [2] [3]
Los niveles de ARN de RyhB se correlacionan inversamente con los niveles de ARNm para el operón sdhCDAB , que codifica la succinato deshidrogenasa, así como con otros cinco genes que previamente se demostró que estaban regulados positivamente por Fur mediante un mecanismo desconocido. Estos incluyen otros dos genes que codifican enzimas en el ciclo del ácido tricarboxílico , acnA y fumA , dos genes de ferritina , ftnA y bfr , y un gen para la superóxido dismutasa , sodB . [4] Varios otros genes se han predicho computacionalmente y se han verificado como objetivos mediante análisis de microarrays : napF , sodA, cysE , yciS , acpS , nagZ y dadA . [1] RyhB está unido por la proteína Hfq , que aumenta su interacción con sus mensajes objetivo.
Un enfoque de predicción de objetivos de genómica comparativa sugiere que los ARNm de once proteínas adicionales que contienen hierro están controlados por RyhB en Escherichia coli . Dos de ellos ( erpA , nirB ) y dos objetivos adicionales que no están directamente relacionados con el hierro ( nagZ , marA ) se verificaron con un sistema informador de GFP. [5] [6]
Se ha demostrado que RyhB tiene un papel en el direccionamiento del transcrito policistrónico iscRSUA para la degradación diferencial. RyhB se une al segundo cistrón de iscRSUA, que codifica la maquinaria para la biosíntesis de grupos de Fe-S. Esta unión promueve la escisión del transcrito iscSUA cadena abajo. Esta escisión deja el transcrito 5 'IscR, que es un regulador transcripcional responsable de regular varios genes que dependen del nivel celular de Fe-S. [7]
Los datos más recientes indican un posible papel de doble función para RyhB. En esta capacidad, puede actuar como un regulador basado en la interacción ARN-ARN y como una transcripción que codifica una proteína pequeña. [8]
