Variante beta del SARS-CoV-2


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Países con casos confirmados de la variante Beta al 25 de junio de 2021 [1]
Leyenda:
  1000+ secuencias confirmadas
  250–999 secuencias confirmadas
  100–249 secuencias confirmadas
  10 a 99 secuencias confirmadas
  2-9 secuencias confirmadas
  1 secuencia confirmada
  Ninguno o ningún dato disponible

La variante beta , [1] [2] también conocida como linaje B.1.351 , [a] es una variante del SARS-CoV-2 , el virus que causa el COVID-19 . Una de varias variantes del SARS-CoV-2 que se cree que son de particular importancia , se detectó por primera vez en el área metropolitana de Nelson Mandela Bay [5] de la provincia de Eastern Cape en Sudáfrica en octubre de 2020, [6] que fue informado por el Departamento de Salud del país el 18 de diciembre de 2020. [7] Análisis filogeográficosugiere que esta variante surgió en el área de la bahía de Nelson Mandela en julio o agosto de 2020. [8]

La Organización Mundial de la Salud etiquetó la variante como variante Beta, no para reemplazar el nombre científico, sino como un nombre para que el público se refiera comúnmente. [9] [10] La OMS lo considera una variante de preocupación . [9]

Mutaciones

  • Mutaciones de aminoácidos de la variante beta del SARS-CoV-2 representadas en un mapa del genoma del SARS-CoV-2 con un enfoque en Spike. [11]

Hay tres mutaciones de particular interés en la región de pico del genoma del linaje B.1.351: [12]

  • K417N
  • E484K
  • N501Y

y otras cinco mutaciones de pico que hasta ahora han generado menos preocupación: [12]

  • L18F
  • D80A
  • D215G
  • R246I
  • A701V

Lejos de la región del pico, también porta: K1655N, deleción SGF 3675-3677, P71L y T205I. [13]

Los científicos notaron que la variante puede adherirse más fácilmente a las células humanas debido a tres mutaciones en el dominio de unión al receptor (RBD) en la glicoproteína de pico del virus: N501Y [7] [14] (un cambio de asparagina (N) a tirosina (Y) [15] en la posición del aminoácido 501), K417N y E484K. [16] [17] Dos de estas mutaciones, E484K y N501Y, están dentro del motivo de unión al receptor (RBM) del dominio de unión al receptor (RBD). [18] [19]

La mutación N501Y también se ha detectado en el Reino Unido. [7] [20] Dos mutaciones encontradas en la variante Beta, E484K y K417N, no se encuentran en la variante Alpha . Además, Beta no tiene la mutación 69-70del que se encuentra en la otra variante. [14] [21]

Eficacia de la vacuna

El 4 de enero de 2021, el periódico británico The Telegraph informó que el inmunólogo de Oxford, Sir John Bell, creía que había "un gran signo de interrogación" sobre la resistencia potencial de la nueva variante sudafricana a las vacunas COVID-19 , lo que generó temores de que las vacunas podrían no funcionar tan eficazmente en eso. cepa variante. [22] El mismo día, Shabir Madhi , profesor de vacunación en la Universidad de Witwatersrand , comentó a CBS News que "no es un hecho" que la nueva variante Beta (variante 501.V2) podría evadir las vacunas, pero que debería considerarse que "podrían no tener la eficacia total". [23]Las mutaciones adicionales de la proteína de pico en Beta fueron planteadas como un factor preocupante por Simon Clarke, profesor asociado de microbiología celular en la Universidad de Reading , en el sentido de que "pueden hacer que el virus sea menos susceptible a la respuesta inmune desencadenada por las vacunas". . [24] Lawrence Young, virólogo de la Universidad de Warwick , también señaló que las múltiples mutaciones de pico de la variante "podrían conducir a algún escape de la protección inmunológica". [24]

Se informó que el cambio de aminoácido E484K, una mutación del dominio de unión al receptor (RBD), estaba "asociado con el escape de anticuerpos neutralizantes", lo que podría afectar adversamente la eficacia de las vacunas COVID dependientes de proteínas de pico. [25] [26] La mutación de pico E484K se vinculó a un caso de reinfección con la variante Beta del SARS-CoV-2 en Brasil, que los investigadores creen que es el primer caso de reinfección que involucra esta mutación. [27] La posibilidad de una alteración en la antigenicidad se denominó "mutación de escape" de un anticuerpo monoclonal con la capacidad de neutralizar las variantes de la proteína de pico del SARS-CoV-2. [28] [29] Esto sugiere que las vacunas existentes pueden y deben actualizarse para contrarrestar las nuevas cepas sin recurrir a ensayos por fases.

Janssen

En enero, Johnson & Johnson , que realizó ensayos para su vacuna Janssen (Ad26.COV2.S) en Sudáfrica , informó que el nivel de protección contra la infección por COVID-19 de moderada a grave era del 72% en los Estados Unidos, pero del 64% en los Estados Unidos. Sudáfrica . [30] [31]

Pfizer – BioNTech

El 17 de febrero de 2021, Pfizer anunció que la actividad de neutralización se redujo en dos tercios para la variante Beta, mientras se abstuvo de hacer afirmaciones sobre la eficacia de la vacuna para prevenir enfermedades como resultado de esta variante. [32]

El 16 de marzo de 2021, la Autoridad Reguladora de Productos Sanitarios de Sudáfrica (SAHPRA) aprobó la vacuna Pfizer-BioNTech (BNT162b2) para la autorización de uso de emergencia de la sección 21. [33]

Vacuna Pfizer – BioNTech

El 1 de abril de 2021, una actualización de un ensayo de vacuna en Sudáfrica declaró que la vacuna era 100% efectiva hasta ahora (es decir, los participantes vacunados no vieron casos), con seis de nueve infecciones en el grupo de control de placebo siendo la variante Beta (linaje B .1.351). [34] Sin embargo, nueve días después, un estudio israelí encontró que la variante estaba presente incluso en personas que habían recibido ambas inyecciones de la vacuna, su prevalencia un aumento desproporcionado de ocho veces entre los individuos vacunados en comparación con las cepas silvestres. [35]

El 5 de mayo de 2021, una carta que resumía los resultados del Grupo de Estudio Nacional de Qatar para la Vacunación COVID-19 mostró una efectividad del 75% contra la infección, con cero casos de enfermedad grave. [36]

Oxford – AstraZeneca

El 6 de febrero de 2021, The Financial Times informó que los datos del ensayo provisional de un estudio realizado por la Universidad de Witwatersrand de Sudáfrica junto con la Universidad de Oxford demostraron una eficacia reducida de la vacuna COVID-19 de Oxford-AstraZeneca (AZD1222) contra la variante Beta. El estudio encontró que en un tamaño de muestra de 2000, la vacuna AZD1222 proporcionó solo una "protección mínima" en todos los casos de COVID-19, excepto en los más graves . [37]

El 7 de febrero de 2021, el gobierno sudafricano suspendió el despliegue planificado de alrededor de 1 millón de dosis de la vacuna mientras examinaba los datos y esperaba consejos sobre cómo proceder. [38] El gobierno de Sudáfrica canceló posteriormente el uso de la vacuna, vendió su suministro a otros países africanos y cambió su programa de vacunación para utilizar la vacuna Janssen COVID-19 . [39] [40]

En julio de 2021, tras el aumento de la incidencia de Beta en Francia, el Reino Unido, uno de los principales usuarios de la vacuna AstraZeneca, impuso restricciones adicionales a las personas que viajan al Reino Unido desde Francia. Sin embargo, la incidencia en Francia está en su territorio de La Reunión en el Océano Índico , [41] como lo señaló la política y médica francesa Veronique Trillet-Lenoir . [42]

BBIBP-CorV

Otros países africanos han comenzado el despliegue de BBIBP-CorV de Sinopharm , con Marruecos , Egipto , Seychelles y Zimbabwe iniciando el despliegue masivo. [43] Hasta ahora, la vacuna ha demostrado ser resistente a la variante Beta, como se demostró en Zimbabwe. [44] El 2 de febrero de 2021, un documento de preimpresión anunció que la actividad de neutralización se redujo en 1,6 veces para la variante Beta. [45]

Moderna

En febrero, Moderna informó que la vacuna actual ( ARNm-1273 ) producía solo una sexta parte de los anticuerpos en respuesta a la variante sudafricana en comparación con el virus original. Han lanzado una prueba de una nueva vacuna para abordar la variante Beta. [46]

Sputnik V

La Autoridad Reguladora de Productos Sanitarios de Sudáfrica (SAHPRA) ha confirmado que ha recibido documentación para la vacuna desarrollada por el Instituto Gamaleya en Rusia . [47]

Sputnik V (Gam-COVID-Vac) es una de las tres vacunas Covid a nivel mundial con una eficacia superior al 90% en casos sintomáticos. Se encontró que era un poco menos efectivo, sin embargo, funcionó mejor que sus rivales. [1] Se encontró una reducción de tres veces en VNA contra la variante beta. [2] [3]

CoronaVac

CoronaVac aún no ha sido aprobado para su uso por la Autoridad de Productos Sanitarios de Sudáfrica (SAHPRA). [48] Hasta ahora, Sinovac se ha ofrecido a suministrar a Sudáfrica 5 millones de dosis de la vacuna. [49]

Covaxina

Se ha descubierto que la covaxina es eficaz contra la variante beta, aunque con una reducción de tres veces en la neutralización.

CoviVac

La información sobre la vacuna CoviVac aún no se ha entregado al gobierno de Sudáfrica. [50]

EpiVacCorona

La información sobre la vacuna EpiVacCorona aún no se ha entregado al gobierno de Sudáfrica . [51]

ZF2001

La información sobre la vacuna ZF2001 está en proceso de ser entregada al gobierno de Sudáfrica . [52]

Novavax

Un estudio sobre la vacuna NVX-CoV2373 Novavax mostró una eficacia del 60% (para participantes VIH negativos) en Sudáfrica , en comparación con el 90% de eficacia en Gran Bretaña . [53]

Inmunidad Bio

El Instituto BioVac , una compañía de vacunas sudafricana respaldada por el estado , planea utilizar un acuerdo que ganó para fabricar vacunas contra el coronavirus . El contrato con la estadounidense basada ImmunityBio Inc está llevando a cabo la fase 1 de ensayos de vacunas con su vacuna hAd5 en los Estados Unidos y Sudáfrica. [54]

ImmunityBio y BioVac planean distribuir las vacunas en Sudáfrica y África. [55] [56]

Epidemiología

Los investigadores y los funcionarios informaron que la prevalencia de la variante era mayor entre los jóvenes sin condiciones de salud subyacentes, y causa con mayor frecuencia enfermedades graves en tales casos que otras variantes. [57] [58] El departamento de salud de Sudáfrica también indicó que la variante puede estar impulsando la segunda ola de la pandemia COVID-19 en el país, ya que la variante se propaga más rápido que otras variantes anteriores del virus. [7] [57]

Estadísticas

Historia

Un equipo de genómica liderado por la Plataforma de Secuenciación e Innovación de Investigación de KwaZulu-Natal ( KRISP ) en la Universidad de KwaZulu-Natal descubrió la nueva variante. [59] Fue descubierto por la secuenciación del genoma completo . Varias secuencias genómicas de este linaje se enviaron a la base de datos de secuencias de GISAID . [60] [se necesita una mejor fuente ]

El 23 de diciembre, el ministro de salud del Reino Unido, Matt Hancock, anunció que dos personas que habían viajado desde Sudáfrica al Reino Unido estaban infectadas con la variante Beta (variante 501.V2). [21] [61] El 28 de diciembre, la variante se había detectado en dos personas en Suiza [62] y en una en Finlandia . [63] El 29 de diciembre, la cepa se había detectado en un visitante de Sudáfrica a Japón , [64] y en un viajero extranjero a Queensland , Australia . [65] El 30 de diciembre se detectó la variante en Zambia.. [66] El 31 de diciembre, también se detectó en Francia , en un pasajero que regresaba de Sudáfrica. [67] El 2 de enero de 2021, se detectó el primer caso de esta variante en Corea del Sur . [68] Austria notificó su primer caso de esta variante, junto con cuatro casos de la variante Alpha el 4 de enero. [69] La República de Botswana también detectó su primer caso el 4 de enero. [70] La República Popular China notificó el primer caso de esta variante en la provincia meridional de Guangdong el 6 de enero. [71]

El 8 de enero de 2021, la República de Irlanda notificó la detección de 3 casos, todos relacionados con viajes desde Sudáfrica. [72] El mismo día se notificó en Brasil un caso de reinfección con la nueva variante por una mujer que había tenido COVID-19 , la primera reinfección de este tipo notificada en el mundo. [27] Canadá notificó el primer caso de esta variante en Alberta el 9 de enero, [73] e Israel notificó cuatro casos, todos los cuales fueron importados en personas que viajaban desde Sudáfrica. [74] Nueva Zelandia notificó el primer caso de esta variante el 10 de enero. [75] [76] El 12 de enero,Alemania informó de la detección de la mutación en seis personas de tres hogares diferentes. [77] El mismo día, se informó que el Reino Unido tenía un total de 29 casos, dos de los cuales se notificaron anteriormente. [78] Al día siguiente, Bélgica notificó el primer caso en una persona de Flandes Occidental sin antecedentes de viajes, [79] Israel informó cuatro casos más, [80] y Taiwán informó el primer caso en un hombre de Swazilandia de unos 30 años que había dio positivo por COVID-19 el 1 de enero. [81]

El 14 de enero, Alemania detectó otro caso [82] y al día siguiente, Canadá notificó un segundo caso de la mutación que se detectó en la provincia canadiense de Columbia Británica . [83] El mismo día se informó de otro caso en Alemania. [84] Dinamarca y Reunión notificaron sus primeros casos el 16 de enero cuando Israel descubrió otros cuatro casos. [85] [86] [87] El 17 de enero, Israel notificó otros cuatro casos, lo que elevó el número total de casos de esta variante a 20. [88] Se notificaron dos casos más en los Países Bajos.el 18 de enero, lo que elevó el total del país a tres. [89] Ghana notificó su primer caso de la variante el 19 de enero. [90] El 23 de enero, Panamá detectó su primer caso de la cepa en una persona de Zimbabwe, que había viajado desde Sudáfrica. [91] También el 23 de enero, Bélgica notificó al menos 15 casos de la variante en Ostende, [92] mientras que se confirmaron 6 casos en las Comoras. [93] El 26 de enero, la República de Irlanda notificó la detección de 6 casos más. [94] Estados Unidos notificó sus primeros casos de la variante el 28 de enero de 2021, en el estado de Carolina del Sur . [95]El 27 de enero, Israel notificó 3 casos más que fueron los primeros casos de la variante de muestras que se recolectaron en la comunidad al azar, sin conocer el origen de la infección. [96] Los datos preliminares comunicados por África CDC el 29 de enero indicaron que la variante había llegado a Ghana . [97] El 31 de enero, Israel informó de su primer caso de reinfección con la nueva variante por un hombre que regresó de Turquía . [98]

El 1 de febrero de 2021, el Secretario de Estado de Salud y Asistencia Social del Reino Unido informó de la detección aleatoria de 11 casos de la variante donde no había conexión con viajes internacionales. [99] El mismo día, la provincia canadiense de Ontario informó del primer caso de la variante en la región de Peel , con una ausencia similar de antecedentes de viajes y sin contacto con nadie que hubiera estado recientemente en el extranjero. [100] El 8 de febrero, la República de Irlanda notificó la detección de 2 casos más. [101]

El 8 de febrero de 2021, Austria detectó el mayor brote de variante Beta en Europa hasta el momento. Se han identificado un total de 293 casos confirmados y 200 casos sospechosos mediante secuenciación, la mayoría de ellos serán confirmados con toda probabilidad. Todos los casos se encontraron en la región de Tirol, donde casi el 9% de las pruebas de PCR positivas se identificaron como la variante Beta mediante secuenciación. [102] Los casos activos se estimaron en alrededor de 140. Después de una semana de discusión pública y presión política sobre una posible cuarentena de Tirol, el gobierno de Austria se abstuvo de aislar las áreas de preocupación, en lugar de hacer un pedido formal para reducir el movimiento en y fuera de la región e ir a hacer pruebas después de visitar Tirol. [103] Los funcionarios tiroleses manifestaron su intención de relajar las reglas de encierro en Tirol de acuerdo con el resto de Austria. [104]

El 22 de febrero, el Ministerio de Salud de Israel declaró que la variante se había secuenciado genéticamente en poco menos del 1% de las 3.000 muestras de la comunidad. [105] Más tarde, Israel notificó un total de 444 casos de la variante, lo que la convierte en la tasa de infección más alta del mundo fuera de Sudáfrica. [106] El 25 de febrero, la República de Irlanda notificó la detección de 4 casos más. [107] A finales de febrero, Turquía tenía 49 casos de la variante Beta. [108]

El 3 de marzo de 2021, Filipinas confirmó sus primeros 6 casos nuevos de la variante sudafricana, con 3 pacientes de Pasay sin antecedentes de viajes y 3 con antecedentes de viajes de Qatar y EAU . [109] El 5 de marzo de 2021, Rumania notificó sus dos primeros casos de la variante sudafricana, provenientes de dos pacientes en Bucarest y Pitești . [110]

El 23 de marzo de 2021, Lituania confirmó sus primeros 2 casos nuevos de la cepa sudafricana, 1 en el condado de Kaunas y 1 en Vilnius . Hay 10 casos más sospechosos de esta enfermedad. Las personas infectadas dijeron que no viajaron a ninguna parte. [111] El 26 de marzo se confirmaron 3 casos más, lo que significa que el virus se está propagando con éxito en el interior.

El 1 de abril de 2021, Malasia detectó sus primeros casos de variante sudafricana. El Ministerio de Salud informó dos casos que se cree que se originaron en el grupo de Jalan Lima, que involucran a un empleado con base en el Aeropuerto Internacional de Kuala Lumpur (KLIA), con otros casos reportados escasamente detectados dentro de Selangor . [112] Al 1 de abril, se informó de un total de nueve casos relacionados con la variante. [113] Hasta el 2 de mayo, se habían detectado un total de 48 casos en al menos 5 conglomerados y por rastreo de contactos, de los cuales 20 se encontraron en dos conglomerados en Perak y Kelantan . [114]

El 12 de abril de 2021, Turquía tenía 285 casos en 11 provincias. [115]

Ver también

  • Vacunación COVID-19 en Sudáfrica
  • Pandemia de COVID-19 en Sudáfrica
  • Variante alfa del SARS-CoV-2
  • Variante gamma del SARS-CoV-2
  • Variante delta del SARS-CoV-2
  • Variante Theta del SARS-CoV-2
  • Variante Iota del SARS-CoV-2
  • Variante Kappa del SARS-CoV-2
  • Variantes de SARS-CoV-2

Notas

  1. ^ Otros nombres incluyen: [3] [4]
    - 20H / 501Y.V2 (anteriormente 20C / 501Y.V2)
    - variante 501Y.V2
    - variante de COVID-19 de Sudáfrica

Referencias

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enlaces externos

  • Linajes PANGO: Informe de nueva variante - Informe sobre la distribución global del linaje B.1.351
  • Informe del COG-Reino Unido sobre mutaciones de pico de interés del SARS-CoV-2 en el Reino Unido
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