La proteína SecY es la principal subunidad transmembrana de la vía secretora bacteriana Sec o Tipo II y un complejo de ATPasa secretor de proteínas , también conocido como translocón SecYEG . Los homólogos del complejo SecYEG se encuentran en eucariotas y arqueas, donde la subunidad se conoce como Sec61α. [2]
Proteína SecY / Sec61α | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | SecY | |||||||
Pfam | PF00344 | |||||||
InterPro | IPR002208 | |||||||
PROSITE | PDOC00612 | |||||||
SCOP2 | 1rh5 / SCOPe / SUPFAM | |||||||
TCDB | 3.A.5 | |||||||
Superfamilia OPM | 19 | |||||||
Proteína OPM | 1rh5 | |||||||
Membranome | 165 | |||||||
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La secreción de algunas proteínas que transportan un péptido señal a través de la membrana interna en bacterias Gram negativas se produce a través de la vía de las translocasas de preproteínas. Las proteínas se producen en el citoplasma como precursores y requieren una subunidad chaperona para dirigirlas al componente translocasa dentro de la membrana. [3] A partir de ahí, las proteínas maduras se dirigen a la membrana externa o permanecen como proteínas periplásmicas. Las subunidades de la proteína translocasas están codificadas en el cromosoma bacteriano.
La vía de translocasas comprende 7 proteínas, incluida una proteína chaperona ( SecB ), una ATPasa ( SecA ), un complejo de membrana integral (SecY, SecE y SecG) y dos proteínas de membrana adicionales que promueven la liberación del péptido maduro en el periplasma ( SecD y SecF). [3] La proteína chaperona SecB [4] es una proteína homotetramérica altamente ácida que existe como un "dímero de dímeros" en el citoplasma bacteriano. SecB mantiene las preproteínas en un estado desplegado después de la traducción y las dirige a la proteína de membrana periférica ATPasa SecA para su secreción. [5] La estructura del ensamblaje SecYEG de Escherichia coli reveló un sándwich de dos membranas que interactúan a través de los extensos dominios citoplasmáticos. [6] Cada membrana está compuesta por dímeros de SecYEG. El complejo monomérico contiene 15 hélices transmembrana.
La proteína SecY eubacteriana interactúa con las secuencias señal de las proteínas secretoras, así como con otros dos componentes del sistema de translocación de proteínas: SecA y SecE. SecY es una proteína integral de la membrana plasmática de 419 a 492 residuos de aminoácidos que aparentemente contiene 10 regiones transmembrana (TM), 6 citoplasmáticas y 5 periplásmicas. [7]
Las regiones citoplasmáticas 2 y 3 y los dominios TM 1, 2, 4, 5, 7 y 10 están bien conservados: se cree que las regiones citoplasmáticas conservadas interactúan con factores de secreción citoplasmática, mientras que los dominios TM pueden participar en la exportación de proteínas. [8] SecY también está codificado en el genoma del cloroplasto de algunas algas donde podría estar involucrado en un sistema de exportación de proteínas de tipo procariótico a través de las dos membranas del retículo endoplásmico del cloroplasto (CER) que está presente en las algas cromófitas y criptofitas. [9]
Subfamilias
Proteínas humanas que contienen este dominio
SEC61A1 ; SEC61A2 ;
Referencias
- ^ Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (enero de 2004). "Estructura de rayos X de un canal conductor de proteínas". Naturaleza . 427 (6969): 36–44. Código Bibliográfico : 2004Natur.427 ... 36B . doi : 10.1038 / nature02218 . PMID 14661030 . S2CID 4360143 .
- ^ Auer J, Spicker G, Böck A (junio de 1991). "Presencia de un gen en la archaebacterium Methanococcus vannielii homólogo a secY de eubacteria". Biochimie . 73 (6): 683–8. doi : 10.1016 / 0300-9084 (91) 90048-6 . PMID 1764515 .
- ^ a b Bieker KL, Phillips GJ, Silhavy TJ (junio de 1990). "Los genes sec y prl de Escherichia coli". Revista de Bioenergética y Biomembranas . 22 (3): 291–310. doi : 10.1007 / BF00763169 . PMID 2202721 . S2CID 10694864 .
- ^ Driessen AJ (mayo de 2001). "SecB, un acompañante molecular con dos caras" (PDF) . Tendencias en microbiología . 9 (5): 193–6. doi : 10.1016 / S0966-842X (01) 01980-1 . hdl : 11370 / 4e5ebfac-d58c-42db-b42e-01c22d469a82 . PMID 11336818 .
- ^ Müller JP (julio de 1999). "Efectos de la sobreexpresión de pre-proteínas sobre la síntesis de SecB en Escherichia coli". Cartas de Microbiología FEMS . 176 (1): 219-27. doi : 10.1016 / s0378-1097 (99) 00239-6 . PMID 10418149 .
- ^ Breyton C, Haase W, Rapoport TA, Kühlbrandt W, Collinson I (agosto de 2002). "Estructura tridimensional del complejo de translocación de proteínas bacterianas SecYEG". Naturaleza . 418 (6898): 662–5. Código Bibliográfico : 2002Natur.418..662B . doi : 10.1038 / nature00827 . PMID 12167867 . S2CID 4347664 .
- ^ Ito K (septiembre de 1992). "SecY y componentes integrales de la membrana del sistema de translocación de proteínas de Escherichia coli" . Microbiología molecular . 6 (17): 2423–8. doi : 10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x . PMID 1406280 . S2CID 37452721 .
- ^ Suh JW, Boylan SA, Thomas SM, Dolan KM, Oliver DB, Price CW (febrero de 1990). "Aislamiento de un homólogo secY de Bacillus subtilis: evidencia de una ruta común de exportación de proteínas en eubacterias". Microbiología molecular . 4 (2): 305-14. doi : 10.1111 / j.1365-2958.1990.tb00597.x . PMID 2110998 . S2CID 27373166 .
- ^ Douglas SE (febrero de 1992). "Un segundo homólogo se encuentra en el genoma de plastidios de Cryptomonas phi" . Cartas FEBS . 298 (1): 93–6. doi : 10.1016 / 0014-5793 (92) 80029-G . PMID 1544427 . S2CID 22351990 .