En biología molecular , el ARNsno U3 es un ARN no codificante que se encuentra predominantemente en el nucleolo . U3 tiene motivos de caja C / D que técnicamente lo hacen miembro de la clase de snoRNA de caja C / D ; sin embargo, a diferencia de otros ARNsno de caja C / D, no se ha demostrado que dirija la 2'- O - metilación de otros ARN. Más bien, se cree que U3 guía la escisión específica del sitio del ARN ribosómico (ARNr) durante el procesamiento del prerARN. [1]
El elemento de caja C / D es un subconjunto de los seis elementos de secuencia corta que se encuentran en todos los snoRNA de U3, a saber, las cajas A, A ', B, C, C' y D. [2] La estructura secundaria de snoRNA de U3 se caracteriza por una pequeño dominio de 5 ' (con cajas A y A'), y un dominio más grande de 3 'dominio (con casillas B, C, C 'y D), estando los dos dominios unidos por una bisagra monocatenaria. Los recuadros B y C forman el motivo B / C, que parece ser exclusivo de los snoRNA de U3, y los recuadros C 'y D forman el motivo C' / D. Este último es funcionalmente similar a los motivos C / D que se encuentran en otros snoRNA. El dominio 5 'y la región bisagra actúan como un dominio de unión a pre-rRNA. El dominio 3 'tiene sitios de unión a proteínas conservados. Tanto los motivos de la caja B / C como de la caja C '/ D son suficientes para la retención nuclear del snoRNA U3. El motivo de caja C '/ D también es necesario para la localización nucleolar, la estabilidad y la hipermetilación del snoRNA U3. [3] Ambos motivos, recuadro B / C y C '/ D, están implicados en interacciones proteicas específicas y son necesarios para las funciones de procesamiento del rRNA del snoRNA U3.
La estructura secundaria de S. cerevisiae determinada por mapeo químico de ARN U3A en un snoRNP purificado está disponible. [4] Un humano modelo de estructura también se ha propuesto. [5] Como la levadura y el ser humano, el protista protozoario Entamoeba histolytica: un eucariota primitivo adoptó la misma estructura secundaria conservada del snoRNA U3. [6] Se han propuestocuatro estructuras de consenso específicas para metazoos , hongos , plantas y eucariotas basales. [7]